Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08587
• Subject: XM_011543509.2
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1539
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGGAGCATCGCATCGTGGGGCCCGGGCCGTACCGAGCTACCAGGCTGTGGAATGAGACCGTGGAGCTTTTTCG  74
                                                         .||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGTGGAATGAGACCGTGGAGCTTTTTCG  29

Query   75  TGCTAAGATGCCGTTACGGAAACATCGCTGTCGTTTCAAGAGCTATGAGCATTGTTTCACAGCGGCCGAAGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   30  TGCTAAGATGCCGTTACGGAAACATCGCTGTCGTTTCAAGAGCTATGAGCATTGTTTCACAGCGGCCGAAGCTG  103

Query  149  TGGATTGGCTGCATGAGCTGCTGAGGTGCAGTCAAAACTTCGGCCCTGAAGTGACCCGCAAACAAACGGTCCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  104  TGGATTGGCTGCATGAGCTGCTGAGGTGCAGTCAAAACTTCGGCCCTGAAGTGACCCGCAAACAAACGGTCCAG  177

Query  223  CTGCTAAAAAAATTCCTGAAGAATCACGTTATTGAAGACATCAAGGGAAAATGGGGTGAGGAAGATTTTGAAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  178  CTGCTAAAAAAATTCCTGAAGAATCACGTTATTGAAGACATCAAGGGAAAATGGGGTGAGGAAGATTTTGAAGA  251

Query  297  CAATCGTCACTTATACAGATTTCCTCCTTCTTCACCCCTGAAACCATATCCAAAGAAGCCCCCAAACCAAAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  252  CAATCGTCACTTATACAGATTTCCTCCTTCTTCACCCCTGAAACCATATCCAAAGAAGCCCCCAAACCAAAAGG  325

Query  371  ATGTTATTAAATTTCCAGAATGGAATGATCTCCCACCAGGCACTTCACAAGAGAACATCCCAGTGAGGCCAGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  326  ATGTTATTAAATTTCCAGAATGGAATGATCTCCCACCAGGCACTTCACAAGAGAACATCCCAGTGAGGCCAGTT  399

Query  445  GTGATGAATTCTGAGATGTGGTACAAGCGTCACAGTATTGCAATTGGAGAGGTGCCAGCTTGCCGTCTTGTCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  400  GTGATGAATTCTGAGATGTGGTACAAGCGTCACAGTATTGCAATTGGAGAGGTGCCAGCTTGCCGTCTTGTCCA  473

Query  519  CCGCAGACAGCTGACAGAGGCCAATGTAGAAGAGATATGGAAGTCTATGACATTATCATACTTACAGAAAATTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  474  CCGCAGACAGCTGACAGAGGCCAATGTAGAAGAGATATGGAAGTCTATGACATTATCATACTTACAGAAAATTC  547

Query  593  TTGGCCTGGATTCCTTAGAAGAAGTTTTAGACGTCAAACTTGTCAATTCGAAGTTCATCATCCATAATGTATAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  548  TTGGCCTGGATTCCTTAGAAGAAGTTTTAGACGTCAAACTTGTCAATTCGAAGTTCATCATCCATAATGTATAT  621

Query  667  AGTGTTAGCAAGCAGGGAGTTGTTATTCTTGATGACAAGTCAAAAGAACTTCCTCATTGGGTGCTGTCAGCTAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  622  AGTGTTAGCAAGCAGGGAGTTGTTATTCTTGATGACAAGTCAAAAGAACTTCCTCATTGGGTGCTGTCAGCTAT  695

Query  741  GAAGTGTTTGGCAAATTGGCCCAACTGTTCTGATTTGAAGCAGCCTATGTACTTGGGATTTGAAAAAGATGTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  696  GAAGTGTTTGGCAAATTGGCCCAACTGTTCTGATTTGAAGCAGCCTATGTACTTGGGATTTGAAAAAGATGTCT  769

Query  815  TTAAAACCATAGCTGATTACTATGGTCACTTGAAAGAGCCTCTACTTACATTTCATCTTTTTGATGCTTTTGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  770  TTAAAACCATAGCTGATTACTATGGTCACTTGAAAGAGCCTCTACTTACATTTCATCTTTTTGATGCTTTTGTC  843

Query  889  AGTGTACTGGGTTTGTTACAGAAGGAGAAAGTGGCAGTTGAAGCATTTCAGATTTGCTGCCTTCTCCTACCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  844  AGTGTACTGGGTTTGTTACAGAAGGAGAAAGTGGCAGTTGAAGCATTTCAGATTTGCTGCCTTCTCCTACCTCC  917

Query  963  TGAAAATAGGAGAAAGTTACAGCTATTGATGATGATGATGGCAAGGATTTGCTTAAACAAAGAGATGCCACCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  918  TGAAAATAGGAGAAAGTTACAGCTATTGATGAGGATGATGGCAAGGATTTGCTTAAACAAAGAGATGCCACCCC  991

Query 1037  TGTGTGATGGCTTTGGTACCCGAACACTGATGGTTCAGACATTTTCCCGTTGCATCTTGTGTTCCAAGGATGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  992  TGTGTGATGGCTTTGGTACCCGAACACTGATGGTTCAGACATTTTCCCGTTGCATCTTGTGTTCCAAGGATGAA  1065

Query 1111  GTGGACTTGGATGAGTTATTAGCTGCTAGATTGGTAACGTTTCTGATGGACAATTACCAGGAAATTCTGAAACT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1066  GTGGACTTGGATGAGTTATTAGCTGCTAGATTGGTAACGTTTCTGATGGACAATTACCAGGAAATTCTGAAAGT  1139

Query 1185  CCCTTTGGCCTTGCAGACCTCTATAGAGGAGCGTGTGGCTCATCTACGAAGAGTCCAGATAAAATACCCAGGAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140  CCCTTTGGCCTTGCAGACCTCTATAGAGGAGCGTGTGGCTCATCTACGAAGAGTCCAGATAAAATACCCAGGAG  1213

Query 1259  CTGATATGGATATCACTTTATCTGCTCCATCATTTTGCCGTCAAATTAGTCCAGAGGAATTTGAATATCAAAGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214  CTGATATGGATATCACTTTATCTGCTCCATCATTTTGCCGTCAAATTAGTCCAGAGGAATTTGAATATCAAAGA  1287

Query 1333  TCATATGGCTCTCAGGAACCTCTGGCAGCCTTGTTGGAGGAAGTCATAACAGATGCCAAACTCTCCAACAAAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288  TCATATGGCTCTCAGGAACCTCTGGCAGCCTTGTTGGAGGAAGTCATAACAGATGCCAAACTCTCCAACAAAGA  1361

Query 1407  GAAAAAGAAGAAACTGAAGCAGTTTCAGAAATCCTATCCTGAAGTCTATCAAGAACGATTTCCTACACCAGAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362  GAAAAAGAAGAAACTGAAGCAGTTTCAGAAATCCTATCCTGAAGTCTATCAAGAACGATTTCCTACACCAGAAA  1435

Query 1481  GTGCAGCACTTCTGTTTCCTGAAAAACCCAAACCGAAACCACAGCTGCTAATGTGGGCACTAAAGAAGCCTTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436  GTGCAGCACTTCTGTTTCCTGAAAAACCCAAACCGAAACCACAGCTGCTAATGTGGGCACTAAAGAAGCCTTTC  1509

Query 1555  CAACCATTTCAAAGAACTAGAAGTTTTCGAATG  1587
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510  CAACCATTTCAAAGAACTAGAAGTTTTCGAATG  1542