Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08591
- Subject:
- NM_026278.3
- Aligned Length:
- 1045
- Identities:
- 861
- Gaps:
- 11
Alignment
Query 1 ATGAAGTTGACCAGTGAAAAGTTGCCCAAGAACCCCTTTTATGCCTCTGTATCTCAGTATGCTGCTAAAAACCA 74
||||||.|||.|||.||.|||||||||||.|||||.|| ||||.|.||||||||||||||.|||.|.||
Sbjct 1 ATGAAGCTGAGCAGCGAGAAGTTGCCCAAAAACCCTTT------CTCTCTGTCTCAGTATGCTGCCAAACAACA 68
Query 75 AAAATTCTTCCAGTGGAAAAAGGAAAAGAC---TGATTACACCCATGCTAATTTGGTGGATAAGGCATTGCAGC 145
.|||||||||||||||||.|||||||||.| |.|||||..|||.||||||||||||||||..|||||||||.
Sbjct 69 GAAATTCTTCCAGTGGAAGAAGGAAAAGCCCGATTATTACCTCCACGCTAATTTGGTGGATACAGCATTGCAGT 142
Query 146 TCTTGAAGGAAAGAATACTGAA-AGGAGACACTCTGGCATATTTCCTACGAGGTCAACTATATTTTGAAGAGGG 218
||.||||.||||||||| .||| |||.||..||.||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 143 TCCTGAAAGAAAGAATA-AGAAGAGGGGATGCTATGGCATATTTTCTAAGAGGCCAACTCTATTTTGAAGAGGG 215
Query 219 ATGGTATGAAGAAGCATTAGAACAGTTTGAAGAAATCAAGGAGAAAGACCATCAAGCAACTTACCAGCTAGGAG 292
.||||||||||||||.||.|.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 216 CTGGTATGAAGAAGCCTTGGCACAGTTTGAGGAAATCCAGGAGAAAGACCATCAAGCAATTTATCAGCTAGGAG 289
Query 293 TGATGTACTATGATGGGCTGGGGACCACTCTAGACGCTGAGAAAGGGGTGGACTATATGAAGAAAATTCTTGAT 366
|||||||.|||||||||||||||||||.|..|.|.|||||.|||||.|||.|.|||||||.|||.||.||.||.
Sbjct 290 TGATGTATTATGATGGGCTGGGGACCATTGCAAATGCTGAAAAAGGAGTGAATTATATGAGGAAGATCCTCGAC 363
Query 367 TCTCCATGTCCCAAAGCAAGACACTTAAAATTTGCAGCTGCTTACAACCTCGGAAGAGCTTATTATGAAGGAAA 440
|||.||||.|||.|..|||..|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 364 TCTTCATGCCCCCAGACAATGCACTTGAAATTCGCTGCTGCTTACAACCTCGGGAGAGCTTATTTTGAAGGAAA 437
Query 441 AGGTGTTAAACGATCAAATGAGGAAGCTGAAAGACTGTGGCTTATCGCAGCAGACAATGGAAATCCCAAAGCTA 514
.||.||.||.||||||.||||||||||.||.|||||||||||..|.||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 438 GGGGGTGAAGCGATCAGATGAGGAAGCAGAGAGACTGTGGCTGCTTGCTGCCGACAATGGAAACCCAAAAGCTA 511
Query 515 GTGTGAAGGCTCAAAGTATGCTCGGGCTGTATTACTCAACCAAGGAGCCCAAGGAGTTAGAAAAGGCATTTTAC 588
||||||||||.||||||||.||.||..|||.|||.||||..||.||||||||.|||||.|||||||||||||.|
Sbjct 512 GTGTGAAGGCGCAAAGTATTCTAGGATTGTTTTATTCAATGAAAGAGCCCAAAGAGTTGGAAAAGGCATTTTTC 585
Query 589 TGGCATTCCGAAGCATGTGGCAATGGGAATCTGGAGTCCCAGGGTGCACTTGGGCTCATGTACTTGTATGGACA 662
||||||||.|||||.||||||||.||.|.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 586 TGGCATTCGGAAGCTTGTGGCAACGGAAGTCTGGAGTCCCAGGGTGCACTTGGTCTCATGTACTTTTACGGACA 659
Query 663 AGGCATCCGGCAGGATACGGAAGCTGCCCTGCAGTGCTTAAGAGAAGCAGCAGAACGCGGAAACGTCTATGCTC 736
.||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||.|.||||||||.||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 660 GGGAATCCGCCAAGACACTGATGCCGCCCTGCACTGCTTACGGGAAGCAGCTGAGCGAGGGAATGTCTATGCCC 733
Query 737 AAGGGAATCTCGTGGAGTATTACTATAAGATGAAATTTTTTACAAAGTGTGTTGCATTTTCCAAAAGGATCGCT 810
|.||||.|||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||.||.
Sbjct 734 AGGGGACTCTTGTGGAATACTACTACAAGATGAAGTTTTTTACCAAGTGTGTTTCGTTTTCCAAAAGGATAGCA 807
Query 811 GACTATGATGAGGTTCACGACATCCCCATGATCGCCCAGGTCACAGACTGTCTCCCGGAGTTCATCGGCAGAGG 884
|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||..||.|||
Sbjct 808 GACTATGATGAAGTCCACGACATCCCCATGATAGCCCACGTCACGGACTGTCTCCCAGAGTTTATCATCAAAGG 881
Query 885 CATGGCAATGGCATCCTTCTACCACGCAAGGTGTCTTCAGCTTGGCTTGGGCATCACCAGGGATGAAACAACCG 958
||||||.|||||..|.||||||||||...|.|||||.|||||.|||||.|||||||..|..||.|||..|.|.|
Sbjct 882 CATGGCCATGGCGGCTTTCTACCACGGGCGCTGTCTCCAGCTGGGCTTAGGCATCATGAAAGACGAAGAATCTG 955
Query 959 CTAAACACTATTATTCTAAAGCTTGTCGTCTGAATCCCGCATTGGCAGATGAACTTCACTCCTTACTTATTCGT 1032
|.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||||..
Sbjct 956 CCAAGCACTACTACTCTAAAGCTTGCCGTCTGAACCCTACATTGGCAGATGAACTTCACTCCTTACTCATTCAC 1029
Query 1033 CAAAGAATT 1041
||.||||||
Sbjct 1030 CAGAGAATT 1038