Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08591
• Subject: XM_006714265.4
• Aligned Length: 1041
• Identities: 747
• Gaps: 294

Alignment

Query    1  ATGAAGTTGACCAGTGAAAAGTTGCCCAAGAACCCCTTTTATGCCTCTGTATCTCAGTATGCTGCTAAAAACCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAAATTCTTCCAGTGGAAAAAGGAAAAGACTGATTACACCCATGCTAATTTGGTGGATAAGGCATTGCAGCTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGAAGGAAAGAATACTGAAAGGAGACACTCTGGCATATTTCCTACGAGGTCAACTATATTTTGAAGAGGGATGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TATGAAGAAGCATTAGAACAGTTTGAAGAAATCAAGGAGAAAGACCATCAAGCAACTTACCAGCTAGGAGTGAT  296
                                                                                    ||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2

Query  297  GTACTATGATGGGCTGGGGACCACTCTAGACGCTGAGAAAGGGGTGGACTATATGAAGAAAATTCTTGATTCTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    3  GTACTATGATGGGCTGGGGACCACTCTAGACGCTGAGAAAGGGGTGGACTATATGAAGAAAATTCTTGATTCTC  76

Query  371  CATGTCCCAAAGCAAGACACTTAAAATTTGCAGCTGCTTACAACCTCGGAAGAGCTTATTATGAAGGAAAAGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   77  CATGTCCCAAAGCAAGACACTTAAAATTTGCAGCTGCTTACAACCTCGGAAGAGCTTATTATGAAGGAAAAGGT  150

Query  445  GTTAAACGATCAAATGAGGAAGCTGAAAGACTGTGGCTTATCGCAGCAGACAATGGAAATCCCAAAGCTAGTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  151  GTTAAACGATCAAATGAGGAAGCTGAAAGACTGTGGCTTATCGCAGCAGACAATGGAAATCCCAAAGCTAGTGT  224

Query  519  GAAGGCTCAAAGTATGCTCGGGCTGTATTACTCAACCAAGGAGCCCAAGGAGTTAGAAAAGGCATTTTACTGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  225  GAAGGCTCAAAGTATGCTCGGGCTGTATTACTCAACCAAGGAGCCCAAGGAGTTAGAAAAGGCATTTTACTGGC  298

Query  593  ATTCCGAAGCATGTGGCAATGGGAATCTGGAGTCCCAGGGTGCACTTGGGCTCATGTACTTGTATGGACAAGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299  ATTCCGAAGCATGTGGCAATGGGAATCTGGAGTCCCAGGGTGCACTTGGGCTCATGTACTTGTATGGACAAGGC  372

Query  667  ATCCGGCAGGATACGGAAGCTGCCCTGCAGTGCTTAAGAGAAGCAGCAGAACGCGGAAACGTCTATGCTCAAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  373  ATCCGGCAGGATACGGAAGCTGCCCTGCAGTGCTTAAGAGAAGCAGCAGAACGCGGAAACGTCTATGCTCAAGG  446

Query  741  GAATCTCGTGGAGTATTACTATAAGATGAAATTTTTTACAAAGTGTGTTGCATTTTCCAAAAGGATCGCTGACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  447  GAATCTCGTGGAGTATTACTATAAGATGAAATTTTTTACAAAGTGTGTTGCATTTTCCAAAAGGATCGCTGACT  520

Query  815  ATGATGAGGTTCACGACATCCCCATGATCGCCCAGGTCACAGACTGTCTCCCGGAGTTCATCGGCAGAGGCATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  521  ATGATGAGGTTCACGACATCCCCATGATCGCCCAGGTCACAGACTGTCTCCCGGAGTTCATCGGCAGAGGCATG  594

Query  889  GCAATGGCATCCTTCTACCACGCAAGGTGTCTTCAGCTTGGCTTGGGCATCACCAGGGATGAAACAACCGCTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  595  GCAATGGCATCCTTCTACCACGCAAGGTGTCTTCAGCTTGGCTTGGGCATCACCAGGGATGAAACAACCGCTAA  668

Query  963  ACACTATTATTCTAAAGCTTGTCGTCTGAATCCCGCATTGGCAGATGAACTTCACTCCTTACTTATTCGTCAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  669  ACACTATTATTCTAAAGCTTGTCGTCTGAATCCCGCATTGGCAGATGAACTTCACTCCTTACTTATTCGTCAAA  742

Query 1037  GAATT  1041
            |||||
Sbjct  743  GAATT  747