Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08657
• Subject: NM_019943.2
• Aligned Length: 1931
• Identities: 1635
• Gaps: 25

Alignment

Query    1  ATGATGCCGTTTCCGGTGACAACCCAGGGACCACCGCAGCCGGC-GCCGCCGCCGAATCGCTACGGCGTCTCCT  73
            ||||||||.|||.|||||||.|||||.|||.|||..||.||||| .||||| |||||.|..|.||||.|.||.|
Sbjct    1  ATGATGCCATTTGCGGTGACCACCCAAGGAGCACAACAACCGGCTCCCGCC-CCGAAGCAGTTCGGCATATCGT  73

Query   74  CGCCTATCAGTCTAGCGGTCCCCAAGGAGACGGACTGCCTCCTCACCCAGAGGCTAATAGAAACCCTCAGGCCC  147
            |.||.|||||.||.||.|.|||||||||.||.|||.||...||||||||||.|||.||.||.||||||..||||
Sbjct   74  CCCCCATCAGCCTGGCCGCCCCCAAGGACACAGACCGCGAACTCACCCAGAAGCTGATCGAGACCCTCCAGCCC  147

Query  148  TTCGGGGTCTTCGAAGAGGAAGAGGAACTGCAGCGCAGGATTTTAGTTTTGGACAAATTAAATAATCTGGTAAA  221
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||||.||
Sbjct  148  TTCGGGGTGTTTGAAGAGGAAGAGGAACTGCAGCGCAGGATTTTAATTTTGCAGAAATTAAATAATCTGGTGAA  221

Query  222  GGAATGGATACGCGAAATCAGTGAAAGCAAGAGTCTTCCCCAGTCTGTAATTGAAAACGTTGGAGGAAAGATTT  295
            |||||||||.||.||||||||||||||||.||.||||||.||..||||||||||.||.|||||.||.||.||||
Sbjct  222  GGAATGGATCCGAGAAATCAGTGAAAGCAGGAATCTTCCACAAGCTGTAATTGAGAATGTTGGGGGGAAAATTT  295

Query  296  TTACGTTTGGCTCTTACAGATTAGGAGTACATACGAAAGGCGCAGATATTGACGCCTTGTGCGTTGCACCAAGT  369
            |||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  296  TTACGTTCGGCTCTTACCGATTAGGAGTACACACGAAAGGTGCAGATATCGATGCTTTGTGCGTTGCACCAAGA  369

Query  370  CATGTGGATCGAAGCGACTTTTTCACCTCATTCTATGCTAAACTGAAACTACAGGAGGAAGTGAAAGATTTAAG  443
            ||.||||||||||..||||||||||||||.|||||||..|||.||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  370  CACGTGGATCGAAATGACTTTTTCACCTCCTTCTATGACAAATTGAAACTACAAGAGGAAGTAAAAGATTTAAG  443

Query  444  GGCTGTCCAGGAGGCATTTGTGCCAGTTATCAAACTGTGTTTTGATGGGATAGAGATTGATATTTTATTTGCAA  517
            .|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  444  AGCTGTTGAGGAGGCCTTTGTGCCGGTTATCAAACTGTGTTTTGATGGAATAGAGATTGATATTTTGTTTGCAA  517

Query  518  GATTAGCACTACAGACTATTCCAGAAGATTTGGACTTAAGAGATGACAGTCTACTTAAAAATTTAGACATTAGA  591
            ||||||||.|.||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  518  GATTAGCATTGCAGACTATTCCAGAAGATTTGGACCTACGAGATGATAGTCTGCTTAAAAATTTAGATATTAGG  591

Query  592  TGCATAAGAATCCTTAATGGTTGCCGGGTAACCGATGAAATTTTACATCTAGTGCCAAACATTGACAACTTCAG  665
            ||||||||||.||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||
Sbjct  592  TGCATAAGAAGCCTTAACGGTTGCCGGGTAACTGATGAGATTTTACATCTAGTACCAAACATTGACAGCTTCAG  665

Query  666  GCTGACTCTGAGAGCCATCAAACTGTGGGCCAAGTGCCACAATATCTATTCCAATATATTAGGTTTCCTCGGAG  739
            |.|.||.|||||||||||||||.|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  666  GTTAACACTGAGAGCCATCAAATTATGGGCCAAATGCCACAACATCTATTCCAATATATTGGGTTTCCTTGGAG  739

Query  740  GTGTTTCCTGGGCCATGCTAGTAGCAAGAACTTGTCAGCTTTATCCAAATGCAGTAGCGTCAACTCTTGTACGG  813
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||.||||||||.||.
Sbjct  740  GTGTTTCCTGGGCTATGCTAGTAGCAAGAACTTGCCAGCTTTACCCAAATGCAATAGCATCCACTCTTGTGCGA  813

Query  814  AAATTCTTCTTGGTATTTTCAGAATGGGAATGGCCAAACCCAGTGTTACTGAAGGAGCCTGAAGAACGGAATCT  887
            |||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||..|.||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct  814  AAATTTTTCTTGGTGTTTTCTGAGTGGGAATGGCCAAATCCAGTGTTGTTAAAAGAACCAGAAGAACGAAATCT  887

Query  888  TAATTTGCCTGTATGGGACCCAAGAGTAAATCCCAGTGATAGGTACCATCTTATGCCTATCATCACACCAGCAT  961
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  888  TAACTTGCCTGTATGGGACCCAAGAGTGAATCCTAGTGACAGGTACCATCTTATGCCTATAATTACACCAGCAT  961

Query  962  ACCCACAGCAGAACTCCACATACAACGTGTCTATTTCAACCAGGATGGTCATGATTGAGGAGTTTAAACAGGGG  1035
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  962  ACCCACAGCAGAACTCCACGTACAATGTGTCTGTTTCGACCAGGATGGTCATGATTGAGGAGTTTAAACAAGGA  1035

Query 1036  CTTGCTATCACACACGAGATTTTGCTAAGTAAGGCAGAGTGGTCCAAACTCTTTGAAGCTCCAAGCTTCTTTCA  1109
            ||||||||||||||.||.|||.||||.|.|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1036  CTTGCTATCACACATGAAATTCTGCTGAATAAGGCAGAATGGTCCAAACTTTTTGAAGCTCCAAGCTTTTTTCA  1109

Query 1110  AAAGTACAAGCATTATATTGTACTTCTGGCAAGTGCATCAACAGAAAAACAACATTTAGAATGGGTGGGCTTGG  1183
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1110  AAAATACAAGCATTATATTGTACTTCTGGCAAGTGCGCCAACAGAGAAACAACATTTAGAGTGGGTGGGCTTGG  1183

Query 1184  TGGAATCAAAGATCCGAATCCTGGTTGGGAGCTTGGAGAAGAATGAATTTATTACACTGGCACATGTGAATCCA  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1184  TGGAATCAAAGATCCGAATCCTGGTTGGGAGCCTGGAAAAGAATGAGTTCATTACTCTGGCTCATGTGAATCCT  1257

Query 1258  CAGTCATTTCCAGCACCCAAAGAAAATCCTGATATGGAAGAATTTCGTACAATGTGGGTGATTGGGTTAGGGCT  1331
            |||||.|||||||||||.|||||||.|.||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|
Sbjct 1258  CAGTCGTTTCCAGCACCAAAAGAAACTGCTGACAAGGAAGAATTTCGTACTATGTGGGTGATCGGGTTAGTGTT  1331

Query 1332  AAAAAAGCCAGATAATTCTGAAATTCTCAGCATTGATCTCACCTATGATATCCAGTCTTTCACAGATACTGTTT  1405
            .||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1332  GAAGAAGCCAGAAAACTCTGAAATTCTCAGTATTGATCTCACCTATGATATTCAGTCTTTCACAGATACAGTGT  1405

Query 1406  ATAGGCAAGCAGTGAATAGTAAGATGTTTGAGATGGGTATGAAAATTACTGCAGTGCATTTAAGAAGAAAGGAA  1479
            |.||.||||||.|.||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||||.|||||.|||||||.||||||
Sbjct 1406  ACAGACAAGCAATAAATAGTAAGATGTTTGAGATGGATATGAAGATTGCTGCAATGCATCTAAGAAGGAAGGAA  1479

Query 1480  CTTCACCAGCTGCTGCCTCATCATGTGCTTCAGGACAAGAAAGCACACTCAACAGAAGGTAGAAGATTGACAGA  1553
            |||||.|||||.||.||..|||||||.||||||.|.|||.||.|.||.|.|||||||.||..|||..||||||.
Sbjct 1480  CTTCATCAGCTACTTCCAAATCATGTTCTTCAGAAAAAGGAAACCCATTTAACAGAAAGTGTAAGGCTGACAGC  1553

Query 1554  TTTGAACGACAGCAGCTTTGACTTGTCTGCAGGCTGTGAAAACAGCATGTCTGTGCCTTCATCTACTAGCACTA  1627
            |.|||..|||||||||.||..|||||||..||.|.||||||||||||||.|||..||||||.|||||.||||||
Sbjct 1554  TGTGACTGACAGCAGCCTTCTCTTGTCTATAGACAGTGAAAACAGCATGACTGCTCCTTCACCTACTGGCACTA  1627

Query 1628  TGAAGACAGGCCCATTGATTAGCAGTTCTCAGGGTAGAAACAGTCCTGCCTTGGCTGTAATGACAGCATCTGTG  1701
            ||||||||||.|||.|||.|.|.|...|||||||.||||||||||||||..|||||||.|||.|||||||||||
Sbjct 1628  TGAAGACAGGTCCACTGACTGGAAACCCTCAGGGCAGAAACAGTCCTGCTCTGGCTGTTATGGCAGCATCTGTG  1701

Query 1702  GCTAACATACAGGCTACTGAATTTTCCTTGCAACAGGTGAATACCAATGAAAGTTCAGGGGTTGCATTAAACGA  1775
            .|.|||||||||..|.||||..||||||||||.||.||||||.|||..|||||.|||||..|||||.|.|..||
Sbjct 1702  ACCAACATACAGTTTCCTGATGTTTCCTTGCAGCATGTGAATCCCATAGAAAGCTCAGGAATTGCACTGAGTGA  1775

Query 1776  AAGTATTCCTCACGCTGTCTCTCAGCCTGCCATTTCTCCATCACCAAAGGCC----ATGGTCGCCAGAGTTGTT  1845
            |||.||.|||||...|..|||.||.|||.|||||||.|||.||||.|| |||    |||   .|||||||.|||
Sbjct 1776  AAGCATCCCTCAGATTCCCTCACAACCTACCATTTCACCACCACCTAA-GCCTACAATG---ACCAGAGTGGTT  1845

Query 1846  TCTTCAACATGTCTCATAAGCCATCC----AGACCTTCAGGAAACTCAGCAACAAACATATCTAATCCTA----  1911
            |||||.|||..|||..|||.||||||    ||||||||||||||..|||||||.||||||.|.|||||||    
Sbjct 1846  TCTTCGACACATCTGGTAAACCATCCATCTAGACCTTCAGGAAATACAGCAACGAACATACCCAATCCTATACT  1919

Query 1912  -------  1911
                   
Sbjct 1920  AGGAGTC  1926