Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08720
Subject:
NM_001350550.1
Aligned Length:
946
Identities:
561
Gaps:
385

Alignment

Query   1  MVPWVRTMGQKLKQRLRLDVGREICRQYPLFCFLLLCLSAASLLLNRYIHILMIFWSFVVGVVTFYCSLGPDSL  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  LPNIFFTIKYKPKQLGLQELFPQGHSCAVCGKVKCKRHRPSLLLENYQPWLDLKISSKVDASLSEVLELVLENF  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  VYPWYRDVTDDESFVDELRITLRFFASVLIRRIHKVDIPSIITKKLLKAAMKHIEVIVKARQKVKNTEFLQQAA  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  LEEYGPELHVALRSRRDELHYLRKLTELLFPYILPPKATDCRSLTLLIREILSGSVFLPSLDFLADPDTVNHLL  296
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 297  IIFIDDSPPEKATEPASPLVRFLQKFAEPRNKKPSVLKLELKQIREQQDLLFRFMNFLKQEGAVHVLQFCLTVE  370
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 371  EFNDRILRPELSNDEMLSLHEELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYE  444
                          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ---------------MLSLHEELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYE  59

Query 445  HVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKLNRGSLSLDDFRNTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  60  HVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKLNRGSLSLDDFRNTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTT  133

Query 519  MEGAMLPNYGVAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVF  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 134  MEGAMLPNYGVAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVF  207

Query 593  CIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGAFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQK  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 208  CIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGAFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQK  281

Query 667  LLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPS  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282  LLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPS  355

Query 741  RPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEVMTVEGVYDYLMYVGRVVFQVPDWLHHLLMG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356  RPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEVMTVEGVYDYLMYVGRVVFQVPDWLHHLLMG  429

Query 815  TRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAIFCENTEPRSLQDKQKGAKQTFEEMMNYIPDLLV  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430  TRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAIFCENTEPRSLQDKQKGAKQTFEEMMNYIPDLLV  503

Query 889  KCIGEETKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVLLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM  946
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504  KCIGEETKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVLLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM  561