Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08739
• Subject: XM_011535168.1
• Aligned Length: 2106
• Identities: 1970
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGGCAGAGGGCAGCGGGGAAGTGGTCGCAGTGTCTGCGACCGGGGCTGCCAACGGCCTCAACAATGGGGCAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGAGGGCAGCGGGGAAGTGGTCGCAGTGTCTGCGACCGGGGCTGCCAACGGCCTCAACAATGGGGCAGG  74

Query   75  CGGGACCTCGGCGACGACCTGCAACCCGCTGTCGCGCAAGCTGCATAAGATCCTGGAGACGCGGCTGGACAACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGGACCTCGGCGACGACCTGCAACCCGCTGTCGCGCAAGCTGCATAAGATCCTGGAGACGCGGCTGGACAACG  148

Query  149  ACAAGGAGATGTTAGAAGCTCTCAAGGCACTTTCAACCTTTTTTGTTGAAAATAGTCTGCGGACTCGAAGAAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAAGGAGATGTTAGAAGCTCTCAAGGCACTTTCAACCTTTTTTGTTGAAAATAGTCTGCGGACTCGAAGAAAT  222

Query  223  TTACGTGGAGATATTGAACGTAAAAGTTTAGCCATCAATGAAGAATTTGTAAGCATTTTCAAGGAAGTGAAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTACGTGGAGATATTGAACGTAAAAGTTTAGCCATCAATGAAGAATTTGTAAGCATTTTCAAGGAAGTGAAGGA  296

Query  297  GGAACTTGAAAGCATAAGCGAAGATGTTCAAGCAATGAGCAACTGTTGTCAAGATATGACAAGTCGCCTACAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAACTTGAAAGCATAAGCGAAGATGTTCAAGCAATGAGCAACTGTTGTCAAGATATGACAAGTCGCCTACAGG  370

Query  371  CAGCAAAGGAACAGACTCAAGATTTAATAGTAAAAACCACTAAGCTTCAATCTGAAAGCCAAAAATTAGAGATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGCAAAGGAACAGACTCAAGATTTAATAGTAAAAACCACTAAGCTTCAATCTGAAAGCCAAAAATTAGAGATA  444

Query  445  AGAGCTCAAGTTGCAGATGCCTTCTTATCCAAGTTCCAACTGACTTCTGATGAAATGAGTCTTCTCCGAGGTAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGAGCTCAAGTTGCAGATGCCTTCTTATCCAAGTTCCAACTGACTTCTGATGAAATGAGTCTTCTCCGAGGTAC  518

Query  519  AAGAGAAGGACCCATTACTGAGGATTTTTTCAAGGCACTGGGAAGAGTAAAACAGATTCATAATGATGTCAAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGAGAAGGACCCATTACTGAGGATTTTTTCAAGGCACTGGGAAGAGTAAAACAGATTCATAATGATGTCAAAG  592

Query  593  TTCTCTTGCGTACAAATCAACAAACGGCAGGTTTAGAAATTATGGAACAGATGGCCTTACTTCAAGAAACGGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCTCTTGCGTACAAATCAACAAACGGCAGGTTTAGAAATTATGGAACAGATGGCCTTACTTCAAGAAACGGCT  666

Query  667  TATGAAAGACTTTACCGATGGGCTCAAAGTGAATGCAGAACATTGACACAAGAATCATGTGACGTATCTCCGGT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  TATGAAAGACTTTACCGATGGGCTCAAAGTGAATGCAGAACATTGACACAAGAATCATGTGACGTATCTCCAGT  740

Query  741  ATTGACACAGGCAATGGAAGCCCTGCAGGACAGACCTGTCTTATATAAATATACCTTAGATGAATTTGGAACAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTGACACAGGCAATGGAAGCCCTGCAGGACAGACCTGTCTTATATAAATATACCTTAGATGAATTTGGAACAG  814

Query  815  CCAGAAGAAGTACAGTTGTTCGTGGATTTATTGATGCGCTCACAAGAGGGGGCCCCGGAGGTACACCTAGACCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGAAGAAGTACAGTTGTTCGTGGATTTATTGATGCGCTCACAAGAGGGGGCCCCGGAGGTACACCTAGACCA  888

Query  889  ATTGAAATGCATTCTCATGACCCTTTGAGGTATGTAGGAGATATGTTGGCTTGGCTCCATCAAGCTACTGCTTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGAAATGCATTCTCATGACCCTTTGAGGTATGTAGGAGATATGTTGGCTTGGCTCCATCAAGCTACTGCTTC  962

Query  963  TGAAAAGGAACACCTTGAAGCTCTCTTAAAGCATGTAACTACACAAGGTGTTGAAGAAAATATTCAAGAAGTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAAAAGGAACACCTTGAAGCTCTCTTAAAGCATGTAACTACACAAGGTGTTGAAGAAAATATTCAAGAAGTTG  1036

Query 1037  TTGGGCATATCACTGAAGGTGTGTGCAGGCCTCTAAAGGTTCGAATTGAGCAAGTAATAGTTGCTGAACCTGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGGGCATATCACTGAAGGTGTGTGCAGGCCTCTAAAGGTTCGAATTGAGCAAGTAATAGTTGCTGAACCTGGG  1110

Query 1111  GCAGTTTTATTATATAAAATTTCTAATCTCCTCAAATTTTATCACCATACAATCAGTGGTATTGTTGGAAATAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCAGTTTTATTATATAAAATTTCTAATCTCCTCAAATTTTATCACCATACAATCAGTGGTATTGTTGGAAATAG  1184

Query 1185  TGCAACTGCATTATTGACTACCATTGAAGAAATGCATTTGCTAAGCAAAAAAATATTCTTCAATAGCTTGAGTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCAACTGCATTATTGACTACCATTGAAGAAATGCATTTGCTAAGCAAAAAAATATTCTTCAATAGCTTGAGTC  1258

Query 1259  TTCATGCAAGTAAATTAATGGACAAGGTTGAACTCCCACCACCTGATCTTGGACCAAGTTCTGCACTAAATCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCATGCAAGTAAATTAATGGACAAGGTTGAACTCCCACCACCTGATCTTGGACCAAGTTCTGCACTAAATCAG  1332

Query 1333  ACACTCATGTTGCTGCGTGAAGTTTTAGCATCTCACGATTCTTCAGTTGTACCATTAGATGCTCGTCAAGCTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACACTCATGTTGCTGCGTGAAGTTTTAGCATCTCACGATTCTTCAGTTGTACCATTAGATGCTCGTCAAGCTGA  1406

Query 1407  TTTTGTGCAGGTTTTATCATGTGTCTTGGATCCTCTCCTACAGATGTGTACTGTATCAGCCAGCAATTTAGGCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTTTGTGCAGGTTTTATCATGTGTCTTGGATCCTCTCCTACAGATGTGTACTGTATCAGCCAGCAATTTAGGCA  1480

Query 1481  CAGCTGACATGGCCACTTTCATGGTCAATTCACTATATATGATGAAGACAACATTAGCTCTATTTGAATTCACT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGCTGACATGGCCACTTTCATGGTCAATTCACTATATATGATGAAGACAACATTAGCTCTATTTGAATTCACT  1554

Query 1555  GACAGACGTCTGGAAATGCTACAGTTTCAGATCGAAGCACATTTGGACACACTTATAAATGAGCAAGCCTCTTA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACAGACGTCTGGAAATGCTACAGTTTCAGATCGAAGCACATTTGGACACACTTATAAATGAGCAAGCCTCTTA  1628

Query 1629  TGTTTTAACTAGGGTAGGCTTGAGTTACATCTATAACACTGTACAGCAACATAAACCTGAACAGGGCTCTTTAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGTTTTAACTAGGGTAGGCTTGAGTTACATCTATAACACTGTACAGCAACATAAACCTGAACAGGGCTCTTTAG  1702

Query 1703  CTAATATGCCCAACCTAGATTCTGTGACACTGAAGGCTGCAATGGTTCAGTTTGATCGTTATCTGTCAGCCCCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTAATATGCCCAACCTAGATTCTGTGACACTGAAGGCTGCAATGGTTCAGTTTGATCGTTATCTGTCAGCCCCA  1776

Query 1777  GACAACCTATTGATACCACAGCTGAACTTTCTTCTAAGTGCCACAGTGAA------------------------  1826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        
Sbjct 1777  GACAACCTATTGATACCACAGCTGAACTTTCTTCTAAGTGCCACAGTGAAGCCTTCAGCTGATTGGATGGAGCC  1850

Query 1827  --------------------------------------------------------------------------  1826
                                                                                      
Sbjct 1851  CGCCCCATTGACGGTGAATCTTCTTCACTCAGTCTTCCAACTTACATGCCAATCTCCTGTGGAAACACCCTCAC  1924

Query 1827  -------------------------------------AGAGCAGATCGTAAAACAATCTACAGAATTAGTCTGC  1863
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGACACACCCGGAAATTATGCTTTATCAACTAACTAGAGAGCAGATCGTAAAACAATCTACAGAATTAGTCTGC  1998

Query 1864  AGAGCCTATGGTGAAGTGTATGCAGCCGTGATGAATCCAATCAATGAATACAAAGATCCAGAGAACATTCTTCA  1937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGAGCCTATGGTGAAGTGTATGCAGCCGTGATGAATCCAATCAATGAATACAAAGATCCAGAGAACATTCTTCA  2072

Query 1938  CCGATCGCCGCAGCAAGTGCAGACGCTTCTTTCC  1971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCGATCGCCGCAGCAAGTGCAGACGCTTCTTTCC  2106