Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08875
- Subject:
- NM_001282807.2
- Aligned Length:
- 2120
- Identities:
- 1985
- Gaps:
- 130
Alignment
Query 1 ATGGAGTCTAAACCTTCAAGGATTCCAAGAAGAATTTCTGTTCAACCTTCCAGCTCCTTAAGTGCTAGGATGAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTCTGGAAGCAGAGGAAGTAGTTTAAATGAT----ACCTATCACTCAAGAGACTCTTCA----TTTAGATTGGA 140
||||| |.||||.| ||| |||| | |||||
Sbjct 1 --------------------------ATGATTGGCAACTATGA-TCA------TCTT-ATGTCTTTAG------ 34
Query 141 TTCTGAATATCAGTCTACATCAGCATCAGCATCTGCGTCACCATTTCAATCTGCATGGTATAGTGAATCTGAGA 214
||.|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 35 -------TAACA-TCTACATCAGCATCAGCATCTGCGTCACCATTTCAATCTGCATGGTATAGTGAATCTGAGA 100
Query 215 TAACTCAGGGAGCACGCTCAAGATCGCAGAACCAGCAACGGGATCATGATTCAAAAAGACCTAAACTTTCCTGT 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 101 TAACTCAGGGAGCACGCTCAAGATCGCAGAACCAGCAACGGGATCATGATTCAAAAAGACCTAAACTTTCCTGT 174
Query 289 ACAAACTGTACTACCTCAGCTGGGAGAAATGTTGGAAATGGTTTAAACACATTATCAGATTCATCTTGGAGGCA 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 ACAAACTGTACTACCTCAGCTGGGAGAAATGTTGGAAATGGTTTAAACACATTATCAGATTCATCTTGGAGGCA 248
Query 363 TAGTCAAGTTCCTAGATCTTCATCAATGGTACTTGGATCATTTGGAACAGACTTAATGAGAGAGAGGAGAGATT 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249 TAGTCAAGTTCCTAGATCTTCATCAATGGTACTTGGATCATTTGGAACAGACTTAATGAGAGAGAGGAGAGATT 322
Query 437 TGGAGAGAAGAACAGATTCCTCTATTAGTAATCTTATGGATTATAGTCACCGAAGTGGTGATTTCACAACTTCA 510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 TGGAGAGAAGAACAGATTCCTCTATTAGTAATCTTATGGATTATAGTCACCGAAGTGGTGATTTCACAACTTCA 396
Query 511 TCATATGTTCAAGACAGAGTTCCTTCATATTCACAAGGAGCAAGACCAAAAGAAAACTCAATGAGCACTTTACA 584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 TCATATGTTCAAGACAGAGTTCCTTCATATTCACAAGGAGCAAGACCAAAAGAAAACTCAATGAGCACTTTACA 470
Query 585 GTTGAATACATCATCCACAAACCACCAATTGCCTTCTGAACATCAGACCATACTAAGTTCTAGGGATTCCAGAA 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 471 GTTGAATACATCATCCACAAACCACCAATTGCCTTCTGAACATCAGACCATACTAAGTTCTAGGGACTCCAGAA 544
Query 659 ATTCTTTAAGATCAAATTTTTCTTCAAGAGAATCAGAATCTTCCCGAAGCAATACGCAGCCTGGATTTTCTTAC 732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545 ATTCTTTAAGATCAAATTTTTCTTCAAGAGAATCAGAATCTTCCCGAAGCAATACGCAGCCTGGATTTTCTTAC 618
Query 733 AGTTCAAGTAGAGATGAAGCCCCAATCATAAGCAATTCAGAAAGGGTTGTTTCATCTCAAAGACCATTTCAAGA 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619 AGTTCAAGTAGAGATGAAGCCCCAATCATAAGCAATTCAGAAAGGGTTGTTTCATCTCAAAGACCATTTCAAGA 692
Query 807 ATCTTCTGACAATGAAGGTAGGCGGACAACGAGGAGATTGCTGTCACGCATAGCTTCTAGCATGTCATCTACTT 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693 ATCTTCTGACAATGAAGGTAGGCGGACAACGAGGAGATTGCTGTCACGCATAGCTTCTAGCATGTCATCTACTT 766
Query 881 TTTTTTCACGAAGATCTAGTCAGGATTCCTTGAATACAAGATCATTGAATTCTGAAAATTCTTACGTTTCTCCA 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 767 TTTTTTCACGAAGATCTAGTCAGGATTCCTTGAATACAAGATCATTGAATTCTGAAAATTCTTACGTTTCTCCA 840
Query 955 AGAATCTTGACAGCTTCACAGTCCCGTAGTAATGTACCATCAGCTTCTGAAGTTCCCGATAATAGGGCATCTGA 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AGAATCTTGACAGCTTCACAGTCCCGTAGTAATGTACCATCAGCTTCTGAAGTTCCCGATAATAGGGCATCTGA 914
Query 1029 AGCTTCTCAGGGATTTCGATTTCTTAGGCGAAGATGGGGTTTGTCATCTCTTAGCCACAATCATAGCTCTGAGT 1102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 AGCTTCTCAGGGATTTCGATTTCTTAGGCGAAGATGGGGTTTGTCATCTCTTAGCCACAATCATAGCTCTGAGT 988
Query 1103 CAGATTCAGAAAATTTTAACCAAGAATCTGAAGGTAGAAATACAGGACCATGGTTATCTTCCTCACTTAGAAAT 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 989 CAGATTCAGAAAATTTTAACCAAGAATCTGAAGGTAGAAATACAGGACCATGGTTATCTTCCTCACTTAGAAAT 1062
Query 1177 AGATGCACACCTTTGTTCTCTAGAAGGAGGCGAGAGGGAAGAGATGAATCTTCAAGGATACCTACCTCTGATAC 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 AGATGCACACCTTTGTTCTCTAGAAGGAGGCGAGAGGGAAGAGATGAATCTTCAAGGATACCTACCTCTGATAC 1136
Query 1251 ATCATCTAGATCTCATATTTTTAGAAGAGAATCAAATGAAGTGGTTCACCTTGAAGCACAGAATGATCCTCTTG 1324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 ATCATCTAGATCTCATATTTTTAGAAGAGAATCAAATGAAGTGGTTCACCTTGAAGCACAGAATGATCCTCTTG 1210
Query 1325 GAGCTGCTGCCAACAGACCACAAGCATCTGCAGCATCAAGCAGTGCCACAACAGGTGGCTCTACATCAGATTCG 1398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 GAGCTGCTGCCAACAGACCACAAGCATCTGCAGCATCAAGCAGTGCCACAACAGGTGGCTCTACATCAGATTCG 1284
Query 1399 GCTCAAGGTGGAAGAAATACAGGAATATCAGGGATTCTTCCTGGTTCCTTATTCCGGTTTGCAGTCCCCCCAGC 1472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1285 GCTCAAGGTGGAAGAAATACAGGAATATCAGGGATTCTTCCTGGTTCCTTATTCCGGTTTGCAGTCCCTCCAGC 1358
Query 1473 ACTTGGGAGTAATTTGACCGACAATGTCATGATCACAGTAGATATTATTCCTTCAGGTTGGAATTCAGCTGATG 1546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359 ACTTGGGAGTAATTTGACCGACAATGTCATGATCACAGTAGATATTATTCCTTCAGGTTGGAATTCAGCTGATG 1432
Query 1547 GTAAAAGTGATAAAACTAAAAGTGCGCCTTCAAGAGATCCAGAAAGATTGCAGAAAATAAAAGAGAGCCTCCTT 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 GTAAAAGTGATAAAACTAAAAGTGCGCCTTCAAGAGATCCAGAAAGATTGCAGAAAATAAAAGAGAGCCTCCTT 1506
Query 1621 TTAGAGGACTCAGAAGAAGAAGAAGGTGACTTATGTAGAATTTGTCAAATGGCAGCTGCATCATCATCTAATTT 1694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507 TTAGAGGACTCAGAAGAAGAAGAAGGTGACTTATGTAGAATTTGTCAAATGGCAGCTGCATCATCATCTAATTT 1580
Query 1695 GCTGATAGAGCCATGCAAGTGCACAGGAAGTTTGCAGTATGTCCACCAAGACTGTATGAAAAAGTGGTTACAGG 1768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 GCTGATAGAGCCATGCAAGTGCACAGGAAGTTTGCAGTATGTCCACCAAGACTGTATGAAAAAGTGGTTACAGG 1654
Query 1769 CCAAAATTAACTCTGGTTCTTCATTAGAAGCTGTAACCACCTGTGAACTATGTAAAGAGAAGTTGGAGCTTAAC 1842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 CCAAAATTAACTCTGGTTCTTCATTAGAAGCTGTAACCACCTGTGAACTATGTAAAGAGAAGTTGGAGCTTAAC 1728
Query 1843 CTGGAGGATTTTGATATTCATGAACTACATAGAGCTCATGCAAATGAACAAGCTGAGTATGAGTTTATCAGCTC 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 CTGGAGGATTTTGATATTCATGAACTACATAGAGCTCATGCAAATGAACAAGCTGAGTATGAGTTTATCAGCTC 1802
Query 1917 TGGTCTCTACCTAGTGGTGTTATTGCACTTGTGCGAACAAAGCTTTTCTGATATGATGGGAAATACAAATGAAC 1990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803 TGGTCTCTACCTAGTGGTGTTATTGCACTTGTGCGAACAAAGCTTTTCTGATATGATGGGAAATACAAATGAAC 1876
Query 1991 CAAGCACACGTGTCCGATTTATTAACCTTGCAAGAACTCTTCAGGCACATATGGAAGATCTCGAAACTTCAGAG 2064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877 CAAGCACACGTGTCCGATTTATTAACCTTGCAAGAACTCTTCAGGCACATATGGAAGATCTCGAAACTTCAGAG 1950
Query 2065 GATGATTCCGAAGAAGACGGAGACCATAACAGGACATTTGATATTGCC 2112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 GATGATTCCGAAGAAGACGGAGACCATAACAGGACATTTGATATTGCC 1998