Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08875
• Subject: NM_020575.2
• Aligned Length: 2135
• Identities: 1824
• Gaps: 79

Alignment

Query    1  ATGGAGTCTAAACCTTCAAGGATTCCAAGAAGAATTTCTGTTCAACCTTCCAGCTCCTTAAGTGCTAGGATGAT  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||..||||.|||||..||||||||.|
Sbjct    1  ATGGAGTCTAAACCTTCCAGGATTCCAAGAAGAATTTCTGTTCAACCCTCTGGCTCTTTAAGCACTAGGATGGT  74

Query   75  GTCTGGAAGCAGAGGAAGTAGTTTAAATGATACCTATCACTCAAGAGACTCTTCATTTAGATTGGATTCTGAAT  148
            ||||||||.||||||||..||||||||||||.|.|||||.||.||||||||.||.||||||.||||||||||||
Sbjct   75  GTCTGGAAACAGAGGAACCAGTTTAAATGATTCATATCATTCTAGAGACTCCTCCTTTAGACTGGATTCTGAAT  148

Query  149  ATCAGTCTACATCAGCATCAGCATCTGCGTCACCATTTCAATCTGCATGGTATAGTGAATCTGAGATAACTCAG  222
            ||||||||.|||||||||||||.|.|||.|||||||.|||..||||.|||||.|||||.|||||||||.|||||
Sbjct  149  ATCAGTCTGCATCAGCATCAGCGTGTGCATCACCATGTCAGCCTGCCTGGTACAGTGAGTCTGAGATACCTCAG  222

Query  223  GGAGCACGCTCAAGATCGCAGAACCAGCAACGGGATCATGATTCAAAAAGACCTAAACTTTCCTGTACAAACTG  296
            |||||.||..||.||.|.||||.||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAGCGCGGGCACGAGCACAGACCCAGCAGCGGGATCATGACTCAAAGAGACCCAAGCTTTCCTGTACAAACTG  296

Query  297  T---ACTACCTCAGCTGGGAGAAATGTTGGAAATGGTTTAAACACATTATCAGATTCATCTTGGAGGCATAGTC  367
            |   .||||||||||||||||.||.|.|||.|.|||.|||||.|||.|.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCATCTACCTCAGCTGGGAGGAACGGTGGGAGTGGGTTAAATACAGTGTCAGATTCTTCTTGGAGGCATAGTC  370

Query  368  AAGTTCCTAGATCTTCATCAATGGTACTTGGATCATTTGGAACAGACTTAATGAGAGAGAGGAGAGATTTGGAG  441
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  371  AAGTTCCCAGATCTTCATCAATGGTACTTGGTTCATTTGGAACAGACTTGATGAGAGAAAGGAGAGATTTGGAC  444

Query  442  AGAAGAACAGATTCCTCTATTAGTAATCTTATGGATTATAGTCACCGAAGTGGTGATTTCACAACTTCATCATA  515
            ||.||||.|||.|||||.||.||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGAGAAGAGAGTCCTCCATCAGCAATCTTATGGATTATAATCACCGAAGTGGTGATTTCACAACTTCATCATA  518

Query  516  TGTTCAAGACAGAGTTC---CTTCATATTCACAAGGAGCAAGACCAAAAGAAAACTCAATGAGCACTTTACAGT  586
            |||||||||.|||||||   |||||||||||||.|||||||||||||||||.||..||.|||||||||||||||
Sbjct  519  TGTTCAAGAAAGAGTTCCTTCTTCATATTCACAGGGAGCAAGACCAAAAGAGAATGCAGTGAGCACTTTACAGT  592

Query  587  TGAATACATCATCCACAAACCACCAATTGCCTTCTGAACATCAGACCATACTAAGTTCTAGGGATTCC---AGA  657
            |||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||..|||.||||||||||||.|||   |||
Sbjct  593  TGAATTCATCATCCACCAATCACCAATTGCCTTCTGACCATCAGACAGTACCAAGTTCTAGGGACTCCAGTAGA  666

Query  658  AATTCTTTAAGATCAAATTTTTCTTCAAGAGAATCAGAATCTTCCCGAAGCAATACGCAGCCTGGATTTTCTTA  731
            |.||||||.||||||.||||||||.|||||.||||||||||||..||.|.||.|.|.||.||||.||||||.||
Sbjct  667  AGTTCTTTCAGATCACATTTTTCTCCAAGACAATCAGAATCTTTTCGCAACAGTTCACATCCTGCATTTTCATA  740

Query  732  CAGTTCAAGTAGAGATGAAGCCCCAATCATAAGCAATTCAGAAAGGGTTGTTTCATCTCAAAGACCATTTCAAG  805
            ...||||||||||.|||||.|.||||..||||||||||||||||||   |.|||||||||.|||||||.||.||
Sbjct  741  TTTTTCAAGTAGAAATGAAACTCCAACTATAAGCAATTCAGAAAGG---GGTTCATCTCAGAGACCATATCGAG  811

Query  806  AATCTTCTGACAATGAAGGTAGGCGGACAACGAGGAGATTGCTGTCACGCATAGCTTCTAGCATGTCATCTACT  879
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  AATCTTCTGACAATGAAGGTAGGCGTACAACTAGGAGATTGCTGTCACGGATAGCTTCTAGCATGTCATCTACT  885

Query  880  TTTTTTTCACGAAGATCTAGTCAGGATTCCTTGAATACAAGATCATTGAATTCTGAAAATTCTTACGTTTCTCC  953
            |||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||   |||..|||||||
Sbjct  886  TTTTTCTCACGAAGATCTAGTCAAGATTCCTTGAATACAAGATCTTTGAGTTCTGAAAA---TTATATTTCTCC  956

Query  954  AAGAATCTTGACAGCTTCACAGTCCCGTAGTAATGTACCATCAGCT-----TCTGA----AGTTCCCGATAATA  1018
            .||||.|.|||   ||||||||||.||.|.|||||.|.|.||  ||     |||||    |||    ||....|
Sbjct  957  GAGAACCCTGA---CTTCACAGTCTCGGAATAATGGAACCTC--CTCGTCCTCTGACGTCAGT----GAGGGCA  1021

Query 1019  GGGCATCTGAAGCTTCTCAGGGATTTCGATTTCTTAGGCGAAGATGGGGTTTGTCATCTCTTAGCCACAATCAT  1092
            |||||.|||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 1022  GGGCAGCTGAAGCATCTCAGGGATTTAGATTTCTTAGGCGAAGATGGGGGTTGTCGTCGCTCAGCCAAAATCAT  1095

Query 1093  AGCTCTGAGTCAGATTCAGAAAATTTTAACCAAGAATCTGAAGGTAGAAATACAGGACCATGGTTATCTTCCTC  1166
            ||||||||..||||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1096  AGCTCTGAACCAGAGGCAGAAAATTTTAACCAAGAATCAGAAGGTAGAAATTCAGGACCATGGTTGTCTTCTTC  1169

Query 1167  ACTTAGAAATAGATGCACACCTTTGTTCTCTAGAAGGAGGCGAGAGGGAAGAGATGAATCTTCAAGGATACCTA  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||..|||
Sbjct 1170  ACTTAGAAATAGATGCACACCTTTGTTCTCGAGAAGGAGGCGAGAGGGAAGGGATGAGTCTTCAAGAATGTCTA  1243

Query 1241  CCTCTGATACATCATCTAGATCTCATATTTTTAGAAGAGAATCAAATGAAGTGGTTCACCTTGAAGCACAGAAT  1314
            |.||.|||..|.||.||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||..|
Sbjct 1244  CGTCAGATGTACCACCTAGATCTCATATTTTCAGAAGAGATTCAAATGAAGTAGTTCATCTTGAAGCACAGGGT  1317

Query 1315  GA-TCCTCTTGGAGCTGCTGCCAACAGACCACAAGCATCTGCAGCATCAAGCAGTGCCACAACAGGTGGCTCTA  1387
            || ||| |||||.||||||||||||.|||||||||||||||.|||.|||||||||||..|..||||||||||.|
Sbjct 1318  GACTCC-CTTGGGGCTGCTGCCAACCGACCACAAGCATCTGGAGCGTCAAGCAGTGCTGCTGCAGGTGGCTCCA  1390

Query 1388  CATCAGATTCGGCTCAAGGTGGAAGAAATACAGGAATATCAGGGATTCTTCCTGGTTCCTTATTCCGGTTTGCA  1461
            |..||||.|.|.||||.||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1391  CCCCAGAGTTGCCTCAGGGTGGAAGAAATCCAGGACTAACAGGGATTCTTCCTGGCTCCTTGTTCCGGTTTGCA  1464

Query 1462  GTCCCCCCAGCACTTGGGAGTAATTTGACCGACAATGTCATGATCACAGTAGATATTATTCCTTCAGGTTGGAA  1535
            |||||.||||||||.||.||||||.||.|.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1465  GTCCCACCAGCACTCGGCAGTAATCTGGCTGACAATGTCATGATTACTGTAGATATTATTCCTTCTGGTTGGAA  1538

Query 1536  TTCAGCTGATGGTAAAAGTGATAAAACTAAAAGTGCGCCTTCAAGAGATCCAGAAAGATTGCAGAAAATAAAAG  1609
            ||||.|||||||.||||.|||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|.||||||||.||||
Sbjct 1539  TTCAACTGATGGGAAAAATGATAAAGCTAAAAGTGCACCTTCAAGAGACCCAGAAAAACTTCAGAAAATCAAAG  1612

Query 1610  AGAGCCTCCTTTTAGAGGACTC---AGAAGAAGAAGAAGGTGACTTATGTAGAATTTGTCAAATGGCAGCTGCA  1680
            |.||||||||||||||||||||   .||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1613  AAAGCCTCCTTTTAGAGGACTCTGATGATGAAGAAGAAGGGGACTTATGTAGAATTTGTCAGATGGCAGCAGCG  1686

Query 1681  TCATCATCTAATTTGCTGATAGAGCCATGCAAGTGCACAGGAAGTTTGCAGTATGTCCACCAAGACTGTATGAA  1754
            ||||||||||||||..||||||||||.|||||.||||||||.||..|||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1687  TCATCATCTAATTTATTGATAGAGCCGTGCAAATGCACAGGGAGCCTGCAGTACGTCCATCAAGAGTGTATGAA  1760

Query 1755  AAAGTGGTTACAGGCCAAAATTAACTCTGGTTCTTCATTAGAAGCTGTAACCACCTGTGAACTATGTAAAGAGA  1828
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1761  AAAGTGGTTACAAGCCAAAATTAATTCTGGCTCTTCATTAGAGGCTGTGACTACCTGTGAACTCTGTAAAGAGA  1834

Query 1829  AGTTGGAGCTTAACCTGGAGGATTTTGATATTCATGAACTACATAGAGCTCATGCAAATGAACAAGCTGAGTAT  1902
            |||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1835  AGTTGCAACTTAACCTGGAGGATTTTGATATTCATGAACTACATAGAGCTCATGCAAATGAACAAGCTGAGTAT  1908

Query 1903  GAGTTTATCAGCTCTGGTCTCTACCTAGTGGTGTTATTGCACTTGTGCGAACAAAGCTTTTCTGATATGATGGG  1976
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909  GAGTTTATCAGCTCTGGTCTCTACCTAGTTGTCTTACTGCACTTGTGTGAACAAAGCTTTTCTGATATGATGGG  1982

Query 1977  AAATACAAATGAACCAAGCACACGTGTCCGATTTATTAACCTTGCAAGAACTCTTCAGGCACATATGGAAGATC  2050
            ||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1983  AAATACAATTGAACCAAGCACTCGTGTCCGATTTATTAACCTTGCAAGAACTCTTCAGGCACATATGGAAGATC  2056

Query 2051  TCGAAACTTCAGAGGATG-ATTCCGAAGAAGACGGAGACCATAACAGGACATTTGATATTGCC  2112
            |||||||||||||||||| ||||                                        
Sbjct 2057  TCGAAACTTCAGAGGATGAATTC----------------------------------------  2079