Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08894
- Subject:
- NM_001350161.2
- Aligned Length:
- 2106
- Identities:
- 2057
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGGAAGATCCATTTGAGGAAGCAGACCAGCCCACTACAGAGCCAGGCATGGTCCTGGACAGTGTGGAAGCAGG 74
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------ATGGTCCTGGACAGTGTGGAAGCAGG 26
Query 75 AGACACAACACCTCCTACCAAAAGGAAGAGCAAGTTCTCAGGCTTTGGCAAGATCTTCAAGCCCTGGAAATGGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 AGACACAACACCTCCTACCAAAAGGAAGAGCAAGTTCTCAGGCTTTGGCAAGATCTTCAAGCCCTGGAAATGGA 100
Query 149 GGAAAAAAAAAAGTAGTGATAAATTTAAAGAGACTTCAGAAGTTTTAGAACGGAAAATATCTATGCGAAAGCCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 101 GGAAAAAAAAAAGTAGTGATAAATTTAAAGAGACTTCAGAAGTTTTAGAACGGAAAATATCTATGCGAAAGCCA 174
Query 223 AGAGAAGAGCTGGTTAAAAGAGGGGTTCTGTTGGAAGACCCTGAGCAAGGTGGTGAGGATCCAGGAAAGCCAAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 AGAGAAGAGCTGGTTAAAAGAGGGGTTCTGTTGGAAGACCCTGAGCAAGGTGGTGAGGATCCAGGAAAGCCAAG 248
Query 297 CGATGCCATGTTAAAGAATGGCCATACCACCCCCATAGGGAATGCCAGATCATCTAGTCCAGTCCAAGTAGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249 CGATGCCATGTTAAAGAATGGCCATACCACCCCCATAGGGAATGCCAGATCATCTAGTCCAGTCCAAGTAGAGG 322
Query 371 AAGAGCCAGTAAGATTAGCAAGTCTTAGGAAAGCTATTCCAGAAGAGGACCTAAAGAAACGACTAGGCTCAACT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 AAGAGCCAGTAAGATTAGCAAGTCTTAGGAAAGCTATTCCAGAAGAGGACCTAAAGAAACGACTAGGCTCAACT 396
Query 445 GGAAGCCAGCCTAATTCTGAAGCAGAGTCTGTTCCTGAGAATGTACCCAAACCACCTTTACTTCCTCCCAAAAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 GGAAGCCAGCCTAATTCTGAAGCAGAGTCTGTTCCTGAGAATGTACCCAAACCACCTTTACTTCCTCCCAAAAG 470
Query 519 ACCCTTGTCCTCTTCTCATGAAGCAAGTGAAGGGCAAGCAAAGGATGCCACTTCCTCTGGCGGCACGGCAAGGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 ACCCTTGTCCTCTTCTCATGAAGCAAGTGAAGGGCAAGCAAAGGATGCCACTTCCTCTGGCGGCACGGCAAGGT 544
Query 593 TCATCATCTCCACCTCCATCACCACAGCACCCGCTGCCACCACTGCTGCCACAAGCCTTGCAAAGACTGTTAAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545 TCATCATCTCCACCTCCATCACCACAGCACCCGCTGCCACCACTGCTGCCACAAGCCTTGCAAAGACTGTTAAT 618
Query 667 CTCTCTGTCACCCCTTCCCCAGCACCCAGGACTCTGCCTGCTGCTCCTGCCAGCACTAACACTACTGCTACCCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619 CTCTCTGTCACCCCTTCCCCAGCACCCAGGACTCTGCCTGCTGCTCCTGCCAGCACTAACACTACTGCTACCCC 692
Query 741 AAGCCTCACTCATATGGTCCCTGCCAAGCAGCCCCCTATCCCTCCCCCTAAACCAGCTCACAGAAATAGCAACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693 AAGCCTCACTCATATGGTCCCTGCCAAGCAGCCCCCTATCCCTCCCCCTAAACCAGCTCACAGAAATAGCAACC 766
Query 815 CTGTCATTGCTGAACTGTCCCAAGCAATAAACAGTGGTACATTGTTATCAAAACCGTCCCCACCCTTACCACCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 767 CTGTCATTGCTGAACTGTCCCAAGCAATAAACAGTGGTACATTGTTATCAAAACCGTCCCCACCCTTACCACCT 840
Query 889 AAGAGAGGCATTCCATCAACCTCAGTACCCACCTTGGAGTCTGCTGCTGCCATCACCACAAAAACACCAAGTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AAGAGAGGCATTCCATCAACCTCAGTACCCACCTTGGAGTCTGCTGCTGCCATCACCACAAAAACACCAAGTGA 914
Query 963 TGAAAGAGAGAAGAGCACGTGTTCTATGGGCTCGGAACTACTACCAATGATCTCACCTCGCTCTCCGTCCCCCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 TGAAAGAGAGAAGAGCACGTGTTCTATGGGCTCGGAACTACTACCAATGATCTCACCTCGCTCTCCGTCCCCCC 988
Query 1037 CACTGCCTACTCATATACCTCCAGAGCCTCCACGCACCCCTCCATTCCCTGCTAAGACTTTTCAAGTTGTGCCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 989 CACTGCCTACTCATATACCTCCAGAGCCTCCACGCACCCCTCCATTCCCTGCTAAGACTTTTCAAGTTGTGCCA 1062
Query 1111 GAAATTGAGTTTCCACCATCCTTAGATCTACACCAGGAGATTCCCCAGCAGGAAGATCAGAAAAAGGAAGTCCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 GAAATTGAGTTTCCACCATCCTTAGATCTACACCAGGAGATTCCCCAGCAGGAAGATCAGAAAAAGGAAGTCCC 1136
Query 1185 CAAGAGGATACTGGACCAGAACTTTGGGGAGCCCCATATACCCTCTAGGCTGCCTCCACTCCCACTGCATATTC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 CAAGAGGATACTGGACCAGAACTTTGGGGAGCCCCATATACCCTCTAGGCTGCCTCCACTCCCACTGCATATTC 1210
Query 1259 GAATCCAGCAGGCCCTCACCAGCCCACTTCCCATGACTCCTATTCTGGAGGGTTCTCACAGAGCTCATTCGTTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 GAATCCAGCAGGCCCTCACCAGCCCACTTCCCATGACTCCTATTCTGGAGGGTTCTCACAGAGCTCATTCGTTG 1284
Query 1333 CTTTTTGAAAACAGTGACAGCTTTTCTGAGGACAGCAGTACGCTGGGTCGGACCAGGTCTCTTCCCATCACTAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 CTTTTTGAAAACAGTGACAGCTTTTCTGAGGACAGCAGTACGCTGGGTCGGACCAGGTCTCTTCCCATCACTAT 1358
Query 1407 TGAAATGCTAAAAGTTCCAGACGATGAAGAAGAAGAGGAGCAAACCTGTCCATCCACATTCAGTGAAGAAATGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359 TGAAATGCTAAAAGTTCCAGACGATGAAGAAGAAGAGGAGCAAACCTGTCCATCCACATTCAGTGAAGAAATGA 1432
Query 1481 CACCTACCTCAGTCATTCCTAAATTACCACAGTGTCTACGGGAGGAAGAAGAGAAGGAGAGCGACTCTGATTCA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 CACCTACCTCAGTCATTCCTAAATTACCACAGTGTCTACGGGAGGAAGAAGAGAAGGAGAGCGACTCTGATTCA 1506
Query 1555 GAAGGTCCCATTCAGTACCGAGATGAAGAAGATGAAGATGAAAGCTATCAGAGTGCTCTTGCCAACAAAGTGAA 1628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1507 GAAGGTCCCATTCAGTACCGAGATGAAGAAGATGAAGATGAAAGCTATCAGAGTGCTCTCGCCAACAAAGTGAA 1580
Query 1629 GAGGAAAGACACACTGGCAATGAAGTTGAACCACAGACCCAGTGAACCAGAGTTGAACCTGAATTCTTGGCCTT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 GAGGAAAGACACACTGGCAATGAAGTTGAACCACAGACCCAGTGAACCAGAGTTGAACCTGAATTCTTGGCCTT 1654
Query 1703 GTAAAAGCAAGGAGGAGTGGAATGAAATACGGCACCAGATTGGAAACACACTGATCCGGCGACTGAGTCAAAGA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 GTAAAAGCAAGGAGGAGTGGAATGAAATACGGCACCAGATTGGAAACACACTGATCCGGCGACTGAGTCAAAGA 1728
Query 1777 CCAACACCAGAAGAACTAGAACAACGCAATATATTGCAACCTAAAAATGAAGCTGATCGTCAGGCAGAAAAACG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 CCAACACCAGAAGAACTAGAACAACGCAATATATTGCAACCTAAAAATGAAGCTGATCGTCAGGCAGAAAAACG 1802
Query 1851 AGAAATTAAACGTCGGCTCACTAGAAAGCTCAGTCAAAGGCCAACTGTCGCTGAACTCCTTGCCAGGAAGATTC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803 AGAAATTAAACGTCGGCTCACTAGAAAGCTCAGTCAAAGGCCAACTGTCGCTGAACTCCTTGCCAGGAAGATTC 1876
Query 1925 TGAGGTTTAATGAATATGTAGAGGTAACAGATGCTCAAGATTATGACCGGCGAGCCGACAAACCTTGGACCAAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877 TGAGGTTTAATGAATATGTAGAGGTAACAGATGCTCAAGATTATGACCGGCGAGCCGACAAACCTTGGACCAAA 1950
Query 1999 CTGACCCCTGCTGACAAGGCTGCCATAAGAAAAGAATTAAATGAATTTAAAAGCTCCGAGATGGAGGTTCATGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 CTGACCCCTGCTGACAAGGCTGCCATAAGAAAAGAATTAAATGAATTTAAAAGCTCCGAGATGGAGGTTCATGA 2024
Query 2073 AGAGAGCAAACATTTTACACGCTACCATCGTCCA 2106
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025 AGAGAGCAAACATTTTACACGCTACCATCGTCCA 2058