Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08894
• Subject: NM_023923.4
• Aligned Length: 2136
• Identities: 2103
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  -------------ATG------GA-----------AGATCCATTTGAGGAAGCAGACCAGCCCACTACAGAGCC  44
                         |||      ||           ||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACAAGCTGATGTCTCCAGACCGGTAAATCCAGATGCAGTTGAGGAAGCAGACCAGCCCACTACAGAGCC  74

Query   45  AGGCATGGTCCTGGACAGTGTGGAAGCAGGAGACACAACACCTCCTACCAAAAGGAAGAGCAAGTTCTCAGGCT  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGCATGGTCCTGGACAGTGTGGAAGCAGGAGACACAACACCTCCTACCAAAAGGAAGAGCAAGTTCTCAGGCT  148

Query  119  TTGGCAAGATCTTCAAGCCCTGGAAATGGAGGAAAAAAAAAAGTAGTGATAAATTTAAAGAGACTTCAGAAGTT  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGGCAAGATCTTCAAGCCCTGGAAATGGAGGAAAAAAAAAAGTAGTGATAAATTTAAAGAGACTTCAGAAGTT  222

Query  193  TTAGAACGGAAAATATCTATGCGAAAGCCAAGAGAAGAGCTGGTTAAAAGAGGGGTTCTGTTGGAAGACCCTGA  266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTAGAACGGAAAATATCTATGCGAAAGCCAAGAGAAGAGCTGGTTAAAAGAGGGGTTCTGTTGGAAGACCCTGA  296

Query  267  GCAAGGTGGTGAGGATCCAGGAAAGCCAAGCGATGCCATGTTAAAGAATGGCCATACCACCCCCATAGGGAATG  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAAGGTGGTGAGGATCCAGGAAAGCCAAGCGATGCCATGTTAAAGAATGGCCATACCACCCCCATAGGGAATG  370

Query  341  CCAGATCATCTAGTCCAGTCCAAGTAGAGGAAGAGCCAGTAAGATTAGCAAGTCTTAGGAAAGCTATTCCAGAA  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAGATCATCTAGTCCAGTCCAAGTAGAGGAAGAGCCAGTAAGATTAGCAAGTCTTAGGAAAGCTATTCCAGAA  444

Query  415  GAGGACCTAAAGAAACGACTAGGCTCAACTGGAAGCCAGCCTAATTCTGAAGCAGAGTCTGTTCCTGAGAATGT  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGACCTAAAGAAACGACTAGGCTCAACTGGAAGCCAGCCTAATTCTGAAGCAGAGTCTGTTCCTGAGAATGT  518

Query  489  ACCCAAACCACCTTTACTTCCTCCCAAAAGACCCTTGTCCTCTTCTCATGAAGCAAGTGAAGGGCAAGCAAAGG  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACCCAAACCACCTTTACTTCCTCCCAAAAGACCCTTGTCCTCTTCTCATGAAGCAAGTGAAGGGCAAGCAAAGG  592

Query  563  ATGCCACTTCCTCTGGCGGCACGGCAAGGTTCATCATCTCCACCTCCATCACCACAGCACCCGCTGCCACCACT  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCCACTTCCTCTGGCGGCACGGCAAGGTTCATCATCTCCACCTCCATCACCACAGCACCCGCTGCCACCACT  666

Query  637  GCTGCCACAAGCCTTGCAAAGACTGTTAATCTCTCTGTCACCCCTTCCCCAGCACCCAGGACTCTGCCTGCTGC  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTGCCACAAGCCTTGCAAAGACTGTTAATCTCTCTGTCACCCCTTCCCCAGCACCCAGGACTCTGCCTGCTGC  740

Query  711  TCCTGCCAGCACTAACACTACTGCTACCCCAAGCCTCACTCATATGGTCCCTGCCAAGCAGCCCCCTATCCCTC  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTGCCAGCACTAACACTACTGCTACCCCAAGCCTCACTCATATGGTCCCTGCCAAGCAGCCCCCTATCCCTC  814

Query  785  CCCCTAAACCAGCTCACAGAAATAGCAACCCTGTCATTGCTGAACTGTCCCAAGCAATAAACAGTGGTACATTG  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCTAAACCAGCTCACAGAAATAGCAACCCTGTCATTGCTGAACTGTCCCAAGCAATAAACAGTGGTACATTG  888

Query  859  TTATCAAAACCGTCCCCACCCTTACCACCTAAGAGAGGCATTCCATCAACCTCAGTACCCACCTTGGAGTCTGC  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTATCAAAACCGTCCCCACCCTTACCACCTAAGAGAGGCATTCCATCAACCTCAGTACCCACCTTGGAGTCTGC  962

Query  933  TGCTGCCATCACCACAAAAACACCAAGTGATGAAAGAGAGAAGAGCACGTGTTCTATGGGCTCGGAACTACTAC  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCTGCCATCACCACAAAAACACCAAGTGATGAAAGAGAGAAGAGCACGTGTTCTATGGGCTCGGAACTACTAC  1036

Query 1007  CAATGATCTCACCTCGCTCTCCGTCCCCCCCACTGCCTACTCATATACCTCCAGAGCCTCCACGCACCCCTCCA  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAATGATCTCACCTCGCTCTCCGTCCCCCCCACTGCCTACTCATATACCTCCAGAGCCTCCACGCACCCCTCCA  1110

Query 1081  TTCCCTGCTAAGACTTTTCAAGTTGTGCCAGAAATTGAGTTTCCACCATCCTTAGATCTACACCAGGAGATTCC  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCCCTGCTAAGACTTTTCAAGTTGTGCCAGAAATTGAGTTTCCACCATCCTTAGATCTACACCAGGAGATTCC  1184

Query 1155  CCAGCAGGAAGATCAGAAAAAGGAAGTCCCCAAGAGGATACTGGACCAGAACTTTGGGGAGCCCCATATACCCT  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCAGCAGGAAGATCAGAAAAAGGAAGTCCCCAAGAGGATACTGGACCAGAACTTTGGGGAGCCCCATATACCCT  1258

Query 1229  CTAGGCTGCCTCCACTCCCACTGCATATTCGAATCCAGCAGGCCCTCACCAGCCCACTTCCCATGACTCCTATT  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTAGGCTGCCTCCACTCCCACTGCATATTCGAATCCAGCAGGCCCTCACCAGCCCACTTCCCATGACTCCTATT  1332

Query 1303  CTGGAGGGTTCTCACAGAGCTCATTCGTTGCTTTTTGAAAACAGTGACAGCTTTTCTGAGGACAGCAGTACGCT  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGAGGGTTCTCACAGAGCTCATTCGTTGCTTTTTGAAAACAGTGACAGCTTTTCTGAGGACAGCAGTACGCT  1406

Query 1377  GGGTCGGACCAGGTCTCTTCCCATCACTATTGAAATGCTAAAAGTTCCAGACGATGAAGAAGAAGAGGAGCAAA  1450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGTCGGACCAGGTCTCTTCCCATCACTATTGAAATGCTAAAAGTTCCAGACGATGAAGAAGAAGAGGAGCAAA  1480

Query 1451  CCTGTCCATCCACATTCAGTGAAGAAATGACACCTACCTCAGTCATTCCTAAATTACCACAGTGTCTACGGGAG  1524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCTGTCCATCCACATTCAGTGAAGAAATGACACCTACCTCAGTCATTCCTAAATTACCACAGTGTCTACGGGAG  1554

Query 1525  GAAGAAGAGAAGGAGAGCGACTCTGATTCAGAAGGTCCCATTCAGTACCGAGATGAAGAAGATGAAGATGAAAG  1598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAGAAGAGAAGGAGAGCGACTCTGATTCAGAAGGTCCCATTCAGTACCGAGATGAAGAAGATGAAGATGAAAG  1628

Query 1599  CTATCAGAGTGCTCTTGCCAACAAAGTGAAGAGGAAAGACACACTGGCAATGAAGTTGAACCACAGACCCAGTG  1672
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTATCAGAGTGCTCTCGCCAACAAAGTGAAGAGGAAAGACACACTGGCAATGAAGTTGAACCACAGACCCAGTG  1702

Query 1673  AACCAGAGTTGAACCTGAATTCTTGGCCTTGTAAAAGCAAGGAGGAGTGGAATGAAATACGGCACCAGATTGGA  1746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AACCAGAGTTGAACCTGAATTCTTGGCCTTGTAAAAGCAAGGAGGAGTGGAATGAAATACGGCACCAGATTGGA  1776

Query 1747  AACACACTGATCCGGCGACTGAGTCAAAGACCAACACCAGAAGAACTAGAACAACGCAATATATTGCAACCTAA  1820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AACACACTGATCCGGCGACTGAGTCAAAGACCAACACCAGAAGAACTAGAACAACGCAATATATTGCAACCTAA  1850

Query 1821  AAATGAAGCTGATCGTCAGGCAGAAAAACGAGAAATTAAACGTCGGCTCACTAGAAAGCTCAGTCAAAGGCCAA  1894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAATGAAGCTGATCGTCAGGCAGAAAAACGAGAAATTAAACGTCGGCTCACTAGAAAGCTCAGTCAAAGGCCAA  1924

Query 1895  CTGTCGCTGAACTCCTTGCCAGGAAGATTCTGAGGTTTAATGAATATGTAGAGGTAACAGATGCTCAAGATTAT  1968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTGTCGCTGAACTCCTTGCCAGGAAGATTCTGAGGTTTAATGAATATGTAGAGGTAACAGATGCTCAAGATTAT  1998

Query 1969  GACCGGCGAGCCGACAAACCTTGGACCAAACTGACCCCTGCTGACAAGGCTGCCATAAGAAAAGAATTAAATGA  2042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GACCGGCGAGCCGACAAACCTTGGACCAAACTGACCCCTGCTGACAAGGCTGCCATAAGAAAAGAATTAAATGA  2072

Query 2043  ATTTAAAAGCTCCGAGATGGAGGTTCATGAAGAGAGCAAACATTTTACACGCTACCATCGTCCA  2106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATTTAAAAGCTCCGAGATGGAGGTTCATGAAGAGAGCAAACATTTTACACGCTACCATCGTCCA  2136