Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08936
• Subject: NM_001038624.1
• Aligned Length: 1111
• Identities: 964
• Gaps: 17

Alignment

Query    1  ATGGCGTACTCCACAGTGCAGAGAGTCGCTCTGGCTTCTGGGCTTGTCCTGGCTCTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTACTCCACGGTGCAGAGAGTGGCGCTGGCCTCGGGGCTCGTCCTGGCCGTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74

Query   75  GGCCTTCCTGTCCCGCGGGAAGCGGCAGGAGCCGCCGCCGACACCTGAAGGAAAATTGGGCCGATTTCCACCTA  148
            |||||||.||||.|||||||||||.|.|||||||||||||...||.|||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCTTCTTGTCTCGCGGGAAGCGACCGGAGCCGCCGCCGGGCCCGGAAGGAAAATTGGACCGATTTCCACCTA  148

Query  149  TGATGCATCATCACCAGGCACACTCAGATGGCCAGACTCCTGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCCGAG  222
            ||||||||||.|||..|||||.|||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TGATGCATCACCACTCGGCACCCTCAGATGGTCAGACACCAGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCAGAG  222

Query  223  GCATTTGCAAAGGCCAAAGGATCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGTAGTGGAAGAGGTCTGATGGGGCAGAT  296
            ||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  223  GCCTTTGCAAAGGCCAAGGGAGCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGGGGTAGTGGAAGAGGACTGATGGGCCAGAT  296

Query  297  TATTCCGATCTACGGTTTTGGGATTTTTTTATATATACTGTACATTCTATTTAAGCTCTCAAAGGGGAAAACAA  370
            .|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||   ||
Sbjct  297  CATTCCAATCTATGGCTTTGGGATCTTTTTGTACATACTGTACATTTTGTTTAAGCTTTCAAAGGGGAA---AA  367

Query  371  CTGCAGAGGATGGGAAATGCTATACTGCCATGCCTGGAAACACCCACAGGAAAATTACCAGTTTTGAGCTTGCT  444
            |||||||||||.||||.||||..||||||...|||||||||.||||||||||.|||||||..||||||||||.|
Sbjct  368  CTGCAGAGGATCGGAACTGCTCCACTGCCCCACCTGGAAACGCCCACAGGAAGATTACCAACTTTGAGCTTGTT  441

Query  445  CAACTGCAAGAAAAACTGAAGGAGACAGAAGCAGCCATGGAAAAATTATTCAACAGAGTGGGACCTAATGGTGA  518
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  442  CAACTACAAGAAAAACTAAAAGAGACAGAAGAAGCCATGGAAAAATTAATCAACAGAGTTGGACCTAATGGTGA  515

Query  519  G---AGAGCACAGACTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGGTTGCTACATCAGCTCCGAGAAATCACCAGGGTCA  589
            |   |||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  GAGCAGAGCACAGGCTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGATTACTGCATCAGCTCCGAGAAATCACCAGGGTCA  589

Query  590  TGAAAGAAGGAAAATTCATTGACAGATTTTCTCCAGAGAAAGAAGCTGAGGAGGCCCCTTACATGGAGGACTGG  663
            ||||||||||.||.|||||.||||.|   |||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  590  TGAAAGAAGGCAAGTTCATCGACACA---TCTCCAGAGAAGGAAGCTGAGGAAGCCCCATACATGGAGGACTGG  660

Query  664  GAAGGTTACCCTGAAGAGACTTACCCAATTTATGACCTTTCAGACTGTATCAAGCGTAGGCAAGAAACAATCTT  737
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  661  GAAGGTTACCCAGAAGAGACTTATCCAATATATGACCTTTCGGATGGTATCAAGCGTAGGCAAGAAACAATCCT  734

Query  738  GGTGGATTACCCTGACCCAAAAGAACTTTCTGCTGAAGAAATAGCTGAAAGAATGGGAATGATAGAAGAGGAAG  811
            |||||||||||||||||.||||||.|..||||||||||||||.||||||..|||||||..||||||||||||||
Sbjct  735  GGTGGATTACCCTGACCTAAAAGAGCCCTCTGCTGAAGAAATTGCTGAACAAATGGGAGAGATAGAAGAGGAAG  808

Query  812  AATCAGATCATTTGGGTTGGGAAAGTCTGCCCACTGACCCCAGAGCCCAGGAAGATAATTCTGTTACCTCGTGT  885
            .||||||.|.||||.|.|||||...|.|||||||||||||..||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  809  GATCAGAGCGTTTGAGCTGGGATCATTTGCCCACTGACCCTGGAGCCCAGAAAGATAATTCTGTTGCCCCGTGT  882

Query  886  GATCCAAAGCCAGAAACATGTTCCTGCTGTTTTCATGAAGACGAGGATCCTGCTGTCTTGGCAGAGAATGCTGG  959
            |||||.||.||||||.||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  GATCCCAAACCAGAATCATGCTCCTGCTGTGTTCATGAAGAGGAGGATCCTGCTGTCTTGGCAGAGAATGCTGG  956

Query  960  ATTCAGTGCAGATAGCTACCCTGAGCAAGAGGAAACCACCAAAGAAGAGTGGTCCCAAGACTTTAAAGATGAAG  1033
            .||||||||||||.|||||..|||||||||||||.|||||||.|||.|.|.|.||||.|||||||.|.||||||
Sbjct  957  TTTCAGTGCAGATGGCTACAGTGAGCAAGAGGAAGCCACCAAGGAAAACTTGCCCCAGGACTTTACAAATGAAG  1030

Query 1034  GGTTGGGCATCAGCACAGATAAAGCATATACA----GGCAGCATGCTGAGGAAGCGTAACCCCCAGGGTTTAGA  1103
            ||.||||..|||||||.|||||.||    |||    ||..|.|||.||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1031  GGCTGGGAGTCAGCACTGATAATGC----ACACGTGGGTGGTATGTTGAGGAAGCGCAACCCCCAGGGTTTTGA  1100

Query 1104  G  1104
            |
Sbjct 1101  G  1101