Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08936
• Subject: NM_001311161.1
• Aligned Length: 1108
• Identities: 964
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGGCGTACTCCACAGTGCAGAGAGTCGCTCTGGCTTCTGGGCTTGTCCTGGCTCTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTACTCCACGGTGCAGAGAGTGGCGCTGGCCTCGGGGCTCGTCCTGGCCGTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74

Query   75  GGCCTTCCTGTCCCGCGGGAAGCGGCAGGAGCCGCCGCCGACACCTGAAGGAAAATTGGGCCGATTTCCACCTA  148
            |||||||.||||.|||||||||||.|.|||||||||||||...||.|||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCTTCTTGTCTCGCGGGAAGCGACCGGAGCCGCCGCCGGGCCCGGAAGGAAAATTGGACCGATTTCCACCTA  148

Query  149  TGATGCATCATCACCAGGCACACTCAGATGGCCAGACTCCTGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCCGAG  222
            ||||||||||.|||..|||||.|||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TGATGCATCACCACTCGGCACCCTCAGATGGTCAGACACCAGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCAGAG  222

Query  223  GCATTTGCAAAGGCCAAAGGATCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGTAGTGGAAGAGGTCTGATGGGGCAGAT  296
            ||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  223  GCCTTTGCAAAGGCCAAGGGAGCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGGGGTAGTGGAAGAGGACTGATGGGCCAGAT  296

Query  297  TATTCCGATCTACGGTTTTGGGATTTTTTTATATATACTGTACATTCTATTTAAGCTCTCAAAGGGGAAAACAA  370
            .|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||   ||
Sbjct  297  CATTCCAATCTATGGCTTTGGGATCTTTTTGTACATACTGTACATTTTGTTTAAGCTTTCAAAGGGGAA---AA  367

Query  371  CTGCAGAGGATGGGAAATGCTATACTGCCATGCCTGGAAACACCCACAGGAAAATTACCAGTTTTGAGCTTGCT  444
            |||||||||||.||||.||||..||||||...|||||||||.||||||||||.|||||||..||||||||||.|
Sbjct  368  CTGCAGAGGATCGGAACTGCTCCACTGCCCCACCTGGAAACGCCCACAGGAAGATTACCAACTTTGAGCTTGTT  441

Query  445  CAACTGCAAGAAAAACTGAAGGAGACAGAAGCAGCCATGGAAAAATTATTCAACAGAGTGGGACCTAATGGTGA  518
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  442  CAACTACAAGAAAAACTAAAAGAGACAGAAGAAGCCATGGAAAAATTAATCAACAGAGTTGGACCTAATGGTGA  515

Query  519  GAGAGCACAGACTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGGTTGCTACATCAGCTCCGAGAAATCACCAGGGTCATGA  592
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  GAGAGCACAGGCTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGATTACTGCATCAGCTCCGAGAAATCACCAGGGTCATGA  589

Query  593  AAGAAGGAAAATTCATTGACAGATTTTCTCCAGAGAAAGAAGCTGAGGAGGCCCCTTACATGGAGGACTGGGAA  666
            |||||||.||.|||||.||||.|   |||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  590  AAGAAGGCAAGTTCATCGACACA---TCTCCAGAGAAGGAAGCTGAGGAAGCCCCATACATGGAGGACTGGGAA  660

Query  667  GGTTACCCTGAAGAGACTTACCCAATTTATGACCTTTCAGACTGTATCAAGCGTAGGCAAGAAACAATCTTGGT  740
            ||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  661  GGTTACCCAGAAGAGACTTATCCAATATATGACCTTTCGGATGGTATCAAGCGTAGGCAAGAAACAATCCTGGT  734

Query  741  GGATTACCCTGACCCAAAAGAACTTTCTGCTGAAGAAATAGCTGAAAGAATGGGAATGATAGAAGAGGAAGAAT  814
            ||||||||||||||.||||||.|..||||||||||||||.||||||..|||||||..||||||||||||||.||
Sbjct  735  GGATTACCCTGACCTAAAAGAGCCCTCTGCTGAAGAAATTGCTGAACAAATGGGAGAGATAGAAGAGGAAGGAT  808

Query  815  CAGATCATTTGGGTTGGGAAAGTCTGCCCACTGACCCCAGAGCCCAGGAAGATAATTCTGTTACCTCGTGTGAT  888
            ||||.|.||||.|.|||||...|.|||||||||||||..||||||||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  809  CAGAGCGTTTGAGCTGGGATCATTTGCCCACTGACCCTGGAGCCCAGAAAGATAATTCTGTTGCCCCGTGTGAT  882

Query  889  CCAAAGCCAGAAACATGTTCCTGCTGTTTTCATGAAGACGAGGATCCTGCTGTCTTGGCAGAGAATGCTGGATT  962
            ||.||.||||||.||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  883  CCCAAACCAGAATCATGCTCCTGCTGTGTTCATGAAGAGGAGGATCCTGCTGTCTTGGCAGAGAATGCTGGTTT  956

Query  963  CAGTGCAGATAGCTACCCTGAGCAAGAGGAAACCACCAAAGAAGAGTGGTCCCAAGACTTTAAAGATGAAGGGT  1036
            ||||||||||.|||||..|||||||||||||.|||||||.|||.|.|.|.||||.|||||||.|.||||||||.
Sbjct  957  CAGTGCAGATGGCTACAGTGAGCAAGAGGAAGCCACCAAGGAAAACTTGCCCCAGGACTTTACAAATGAAGGGC  1030

Query 1037  TGGGCATCAGCACAGATAAAGCATATACA----GGCAGCATGCTGAGGAAGCGTAACCCCCAGGGTTTAGAG  1104
            ||||..|||||||.|||||.||    |||    ||..|.|||.||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1031  TGGGAGTCAGCACTGATAATGC----ACACGTGGGTGGTATGTTGAGGAAGCGCAACCCCCAGGGTTTTGAG  1098