Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08948
Subject:
NM_024648.3
Aligned Length:
1030
Identities:
896
Gaps:
110

Alignment

Query    1  ATGGCTCCTCAGCGGAGGGCCGCAACCAAGGCGCCCGAGGGCAACGGAGCGGCCGAGCGCCGGAACCGGAGCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTCCTCAGCGGAGGGCCGCAACCAAGGCGCCCGAGGGCAACGGAGCGGCCGAGCGCCGGAACCGGAGCAG  74

Query   75  CACCAAGAAGGACCGAGCCCCGCGGGAGGTGCAGAGGCTGTGGCAGAGGCCGTGGCTAAGGACCGCGGGCCTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACCAAGAAGGACCGAGCCCCGCGGGAGGTGCAGAGGCTGTGGCAGAGGCCGTGGCTAAGGACCGCGGGCCTGG  148

Query  149  GGGCTGGCTTTGTGCTCACCGCACTCCTGCTCTGGAGCAGCTTGGGGGCCGACGACGGGGTCGCAGAGGTCCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGCTGGCTTTGTGCTCACCGCACTCCTGCTCTGGAGCAGCTTGGGGGCCGACGACGGGGTCGCAGAGGTCCTG  222

Query  223  GCCCGCCGTGGCGAGGTCGTGGCAGGGAGATTCATCGAGGTGCCCTGCTCTGAGGACTACGACAGTCACCGCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCCGCCGTGGCGAGGTCGTGGCAGGGAGATTCATCGAGGTGCCCTGCTCTGAGGACTACGACAGTCACCGCAG  296

Query  297  GTTCGAAGGCTGCACTCCCCGAAAGTGCGGCAGAGGTGTCACCGATGTCGTCATCACCAGGGAGGAAGCGGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTCGAAGGCTGCACTCCCCGAAAGTGCGGCAGAGGTGTCACCGATGTCGTCATCACCAGGGAGGAAGCGGAGC  370

Query  371  GGATTCGCAGCGTAGCTGAAAAGGGGCTCTCCCTGGGAGGATCTGACGGAGGGGCATCCATTCTGGACTTGCAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGATTCGCAGCGTAGCTGAAAAGGGGCTCTCCCTGGGAGGATCTGACGGAGGGGCATCCATTCTGGACTTGCAC  444

Query  445  TCAGGGGCCCTGTCTGTCGGGAAGCACTTTGTGAACCTGTACAGATACTTCGGGGATAAAATACAGAACATCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCAGGGGCCCTGTCTGTCGGGAAGCACTTTGTGAACCTGTACAGATACTTCGGGGATAAAATACAGAACATCTT  518

Query  519  CTCAGAGGAGGACTTCCGGTTATACCGGGAGGTGCGGCAGAAGGTCCAGCTCACCATTGCTGAGGCTTTTGGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCAGAGGAGGACTTCCGGTTATACCGGGAGGTGCGGCAGAAGGTCCAGCTCACCATTGCTGAGGCTTTTGGCA  592

Query  593  TCAGCGCATCCTCGCTGCATCTGACCAAGCCCACCTTCTTCTCCCGCATAAACAGCACGGAAGCGCGGACGGCG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAGCGCATCCTCGCTGCATCTGACCAAGCCCACCTTCTTCTCCCGCATAAACAGCACGGAAGCGCGGACGGCG  666

Query  667  CACGACGAGTACTGGCATGCGCACGTGGACAAGGTGACCTACGGCTCCTTCGACTACACCTCGCTGCTGTACCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACGACGAGTACTGGCATGCGCACGTGGACAAGGTGACCTACGGCTCCTTCGACTACACCTCGCTGCTGTACCT  740

Query  741  CTCCAACTACCTGGAGGACTTCGGCGGAGGGCGGTTCATGTTCATGGAGGAGGGTGCCAACAAGACGGTGGAGC  814
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Sbjct  741  CTCCAACTACCTGGAGGACTTCGGCGGAGGGCGGTTCATGTTCATGGAGGAGGGTGCCAACAAGACGGTGGAGC  814

Query  815  GGAGAGCTGGATGTTTTTGTTTCCGGATGATGTCTT----GTGGGTTCCAAGAAGTTAATGGACCGAGAGCCAG  884
            .|||||||||    |...||.|||       .||||    ..|||.|||.||||..||   .||||.|.|   |
Sbjct  815  CGAGAGCTGG----TCGCGTCTCC-------TTCTTCACCTCGGGGTCCGAGAACCTA---CACCGCGTG---G  871

Query  885  TGAAGCTGCTGGTGCGAAGGCTGGAGTCAGGTGTCCTCCGGGG-AC-----------TCACCA-----------  935
            .||||                           ||||.|.|||| ||           ||||||           
Sbjct  872  AGAAG---------------------------GTCCACTGGGGCACCCGTTACGCCATCACCATCGCCTTCAGC  918

Query  936  ------CCCGCCCGAGAGGG----GAGAGACACATGCGATTCTGGAAGCTGAGAGCATTGCTTATTGT  993
                  ||||.||   |.||    ||| |||.|| |||.|.|.|                        
Sbjct  919  TGCAACCCCGACC---ATGGCATCGAG-GACCCA-GCGTTCCCG------------------------  957