Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09020
• Subject: NM_001040451.3
• Aligned Length: 1800
• Identities: 1799
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCATCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCATCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAG  74

Query   75  CCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTCTTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTCTTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAAC  148

Query  149  ATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATTCTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATTCTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAA  222

Query  223  CTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTCCAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTCCAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGG  296

Query  297  CCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGATTATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGATTATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAAC  370

Query  371  ATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGAAGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGAAGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTG  444

Query  445  GTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAGACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAGACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGA  518

Query  519  TTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAGGAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAGGAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTG  592

Query  593  ATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCACAGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCACAGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGAT  666

Query  667  GGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGA  740

Query  741  AGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGAAGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGAAGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAAC  814

Query  815  AGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGGTCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGGTCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGG  888

Query  889  AAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAGAACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAGAACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAAC  962

Query  963  CGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAGAAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAGAAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCC  1036

Query 1037  AGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAAAGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAAAGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAG  1110

Query 1111  CAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAGTTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAGTTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGA  1184

Query 1185  AAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGAGCTGAGGAGCGGAGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCG  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGGGCTGAGGAGCGGAGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCG  1258

Query 1259  GGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCAATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCAATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAA  1332

Query 1333  TCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACGAGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACGAGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGAT  1406

Query 1407  GGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTTCAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTTCAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGA  1480

Query 1481  TCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCTCAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCTCAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGAT  1554

Query 1555  ATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAGATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAGATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTG  1628

Query 1629  TGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAACTGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAACTGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCT  1702

Query 1703  CCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGTGTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGTGTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTG  1776

Query 1777  CAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC  1800
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC  1800