Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09043
• Subject: NR_135607.2
• Aligned Length: 1969
• Identities: 1394
• Gaps: 574

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------------ATGGCAGAAGCTGTTTTCC  19
                                                                   |||||||||||.|||||||
Sbjct    1  GTTGCCGGGGTAACGGCGAGCGCGTGGGGCCAAGAAAGAATACCTCCTCTGAAAAATGGCAGAAGCAGTTTTCC  74

Query   20  ATGCCCCAAAGAGGAAAAGAAGAGTGTATGAGACTTACGAGTCTCCATTGCCAATCCCTTTTGGTCAGGACCAT  93
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATGCCCCAAAGAGGAAAAGAAGAGTGTATGAGACTTACGAGTCTCCATTGCCAATCCCTTTTGGTCAGGACCAT  148

Query   94  GGTCCTCTGAAAGAATTCAAGATATTCCGTGCTGAAATGATTAACAACAATGTGATTGTGAGGAATGCGGAGGA  167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGTCCTCTGAAAGAATTCAAGATATTCCGTGCTGAAATGATTAACAACAATGTGATTGTGAGGAATGCGGAGGA  222

Query  168  CATTGAGCAGCTCTATGGGAAAGGTTATTTTGGAAAAGGTATTCTTTCAAGAAGCCGTCCAAGCTTCACAATTT  241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATTGAGCAGCTCTATGGGAAAGGTTATTTTGGAAAAGGTATTCTTTCAAGAAGCCGTCCAAGCTTCACAATTT  296

Query  242  CAGATCCTAAACTGGTTGCTAAATGGAAAGATATGAAGACAAACATGCCTATCATCACATCAAAGAGGTATCAG  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGATCCTAAACTGGTTGCTAAATGGAAAGATATGAAGACAAACATGCCTATCATCACATCAAAGAGGTATCAG  370

Query  316  CATAGTGTTGAGTGGGCAGCAGAGCTGATGCGTAGACAGGGGCAGGATGAGAGTACAGTGCGCAGAATCCTCAA  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CATAGTGTTGAGTGGGCAGCAGAGCTGATGCGTAGACAGGGGCAGGATGAGAGTACAGTGCGCAGAATCCTCAA  444

Query  390  GGATTACACGAAACCGCTTGAGCATCCTCCTGTGAAAAGGAATGAAGAGGCTCAAGTGCATGACAAGCTTAACT  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGATTACACGAAACCGCTTGAGCATCCTCCTGTGAAAAGGAATGAAGAGGCTCAAGTGCATGACAAGCTTAACT  518

Query  464  CTGGAATGGTTTCCAACATGGAAGGCACAGCAGGGGGAGAGAGACCTTCTGTGGTAAACGGGGACTCTGGAAAG  537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGGAATGGTTTCCAACATGGAAGGCACAGCAGGGGGAGAGAGACCTTCTGTGGTAAACGGGGACTCTGGAAAG  592

Query  538  TCAGGTGGTGTGGGTGATCCCCGTGAGCCATTAGGCTGCCTGCAGGAGGGCTCTGGCTGCCACCCAACAACAGA  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAGGTGGTGTGGGTGATCCCCGTGAGCCATTAGGCTGCCTGCAGGAGGGCTCTGGCTGCCACCCAACAACAGA  666

Query  612  GAGCTTTGAGAAAAGCGTGCGAGAGGATGCCTCACCTCTGCCCCATGTCTGTTGCTGCAAACAAGATGCTCTCA  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCTTTGAGAAAAGCGTGCGAGAGGATGCCTCACCTCTGCCCCATGTCTGTTGCTGCAAACAAGATGCTCTCA  740

Query  686  TCCTCCAGCGTGGCCTTCATCATGAAGACGGCAGCCAGCACATCGGCCTCCTGCATCCTGGGGACAGAGGGCCT  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTCCAGCGTGGCCTTCATCATGAAGACGGCAGCCAGCACATCGGCCTCCTGCATCCTGGGGACAGAGGGCCT  814

Query  760  GACCATGAGTACGTGCTGGTCGAGGAAGCGGAGTGTGCCATGAGCGAGAGGGAGGCTGCCCCAAATGAGGAATT  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACCATGAGTACGTGCTGGTCGAGGAAGCGGAGTGTGCCATGAGCGAGAGGGAGGCTGCCCCAAATGAGGAATT  888

Query  834  GGTGCAAAGAAACAGGTTAATATGCAGAAGAAATCCATATAGGATCTTTGAGTATTTGCAACTCAGCCTAGAAG  907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGCAAAGAAACAGGTTAATATGCAGAAGAAATCCATATAGGATCTTTGAGTATTTGCAACTCAGCCTAGAAG  962

Query  908  AGGCCTTTTTCTTGGTCTATGCTCTGGGATGTTTAAGTATTTACTATGAGAAGGAGCCTTTAACGATAGTGAAG  981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGCCTTTTTCTTGGTCTATGCTCTGGGATGTTTAAGTATTTACTATGAGAAGGAGCCTTTAACGATAGTGAAG  1036

Query  982  CTCTGGAAAGCTTTCACTGTAGTTCAGCCCACGTTCAGAACCACCTACATGGCCTACCATTACTTTCGAAGCAA  1055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCTGGAAAGCTTTCACTGTAGTTCAGCCCACGTTCAGAACCACCTACATGGCCTACCATTACTTTCGAAGCAA  1110

Query 1056  GGGCTGGGTGCCCAAAGTGGGACTCAAGTACGGGACAGATTTACTGCTATATCGGAAAGGCCCTCCATTTTACC  1129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGCTGGGTGCCCAAAGTGGGACTCAAGTACGGGACAGATTTACTGCTATATCGGAAAGGCCCTCCATTTTACC  1184

Query 1130  ATGCAAGTTATTCTGTCATTATCGAGCTAGTTGATGACCATTTTGAAGGCTCTCTCCGCAGGCCTCTCAGTTGG  1203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATGCAAGTTATTCTGTCATTATCGAGCTAGTTGATGACCATTTTGAAGGCTCTCTCCGCAGGCCTCTCAGTTGG  1258

Query 1204  AAGTCCCTGGCTGCCTTGAGCAGAGTTTCCGTTAATGTCTCTAAGGAACTTATGCTGTGCTATTTGATTAAACC  1277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGTCCCTGGCTGCCTTGAGCAGAGTTTCCGTTAATGTCTCTAAGGAACTTATGCTGTGCTATTTGATTAAACC  1332

Query 1278  CTCTACTATGACTGACAAGGAAATGGAGTCACCAGAATGTATGAAAAGGATTAAAGTTCAGGAGGTGATTCTGA  1351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCTACTATGACTGACAAGGAAATGGAGTCACCAGAATGTATGAAAAGGATTAAAGTTCAGGAGGTGATTCTGA  1406

Query 1352  GTCGATGGGTTTCTTCACGAGAGAGGAGTGACCAAGACGATCTT------------------------------  1395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct 1407  GTCGATGGGTTTCTTCACGAGAGAGGAGTGACCAAGACGATCTTTAACAATTCAACCTCAAATTTCTAATTTCA  1480

Query 1396  --------------------------------------------------------------------------  1395
                                                                                      
Sbjct 1481  CCAACAACTATTTATTGAGGGCTAGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTCCAATGCTGCGATCTTGGATCAC  1554

Query 1396  --------------------------------------------------------------------------  1395
                                                                                      
Sbjct 1555  TGCAACCTCTGCCTGCTGGGTTTAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGCA  1628

Query 1396  --------------------------------------------------------------------------  1395
                                                                                      
Sbjct 1629  CCACCACACACGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAAC  1702

Query 1396  --------------------------------------------------------------------------  1395
                                                                                      
Sbjct 1703  TCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGAGTACAGGCGTGAGCCACTGCATCCAG  1776

Query 1396  --------------------------------------------------------------------------  1395
                                                                                      
Sbjct 1777  CTCTTAGCATGTGCTTTTAAAGTAAAAACCACGAGGAGAAGGTACTCATTACTTCATAACTTGTGTCTCACCCA  1850

Query 1396  --------------------------------------------------------------------------  1395
                                                                                      
Sbjct 1851  CCTTGCTGTCTTCACATCCCCACTTTCTGTATGCACATTGGAAGGTGAATTTGTTCAGCTCACATTAATTTATA  1924

Query 1396  ---------------------------------------------  1395
                                                         
Sbjct 1925  GGAATAATTTTCATTGCTCTGTGAATAAAATGTGCTACCACTTTA  1969