Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09043
- Subject:
- XR_002959593.1
- Aligned Length:
- 2047
- Identities:
- 1394
- Gaps:
- 652
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AAGAAAGGTAAGGGCCCTGGGCGAGGAAAGCGCGGCCCTTTCCGAGTTTGGTGTTTTGCAGCGAAAGGAAATCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------ATGGCAGAAGCTG 13
|||||||||||.|
Sbjct 75 CGCTCTTCCGAAAGTCCTCCAGGGCGAGAGAGGAAAGGGCCTAGAATACCTCCTCTGAAAAATGGCAGAAGCAG 148
Query 14 TTTTCCATGCCCCAAAGAGGAAAAGAAGAGTGTATGAGACTTACGAGTCTCCATTGCCAATCCCTTTTGGTCAG 87
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTTTCCATGCCCCAAAGAGGAAAAGAAGAGTGTATGAGACTTACGAGTCTCCATTGCCAATCCCTTTTGGTCAG 222
Query 88 GACCATGGTCCTCTGAAAGAATTCAAGATATTCCGTGCTGAAATGATTAACAACAATGTGATTGTGAGGAATGC 161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACCATGGTCCTCTGAAAGAATTCAAGATATTCCGTGCTGAAATGATTAACAACAATGTGATTGTGAGGAATGC 296
Query 162 GGAGGACATTGAGCAGCTCTATGGGAAAGGTTATTTTGGAAAAGGTATTCTTTCAAGAAGCCGTCCAAGCTTCA 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGGACATTGAGCAGCTCTATGGGAAAGGTTATTTTGGAAAAGGTATTCTTTCAAGAAGCCGTCCAAGCTTCA 370
Query 236 CAATTTCAGATCCTAAACTGGTTGCTAAATGGAAAGATATGAAGACAAACATGCCTATCATCACATCAAAGAGG 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAATTTCAGATCCTAAACTGGTTGCTAAATGGAAAGATATGAAGACAAACATGCCTATCATCACATCAAAGAGG 444
Query 310 TATCAGCATAGTGTTGAGTGGGCAGCAGAGCTGATGCGTAGACAGGGGCAGGATGAGAGTACAGTGCGCAGAAT 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TATCAGCATAGTGTTGAGTGGGCAGCAGAGCTGATGCGTAGACAGGGGCAGGATGAGAGTACAGTGCGCAGAAT 518
Query 384 CCTCAAGGATTACACGAAACCGCTTGAGCATCCTCCTGTGAAAAGGAATGAAGAGGCTCAAGTGCATGACAAGC 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTCAAGGATTACACGAAACCGCTTGAGCATCCTCCTGTGAAAAGGAATGAAGAGGCTCAAGTGCATGACAAGC 592
Query 458 TTAACTCTGGAATGGTTTCCAACATGGAAGGCACAGCAGGGGGAGAGAGACCTTCTGTGGTAAACGGGGACTCT 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTAACTCTGGAATGGTTTCCAACATGGAAGGCACAGCAGGGGGAGAGAGACCTTCTGTGGTAAACGGGGACTCT 666
Query 532 GGAAAGTCAGGTGGTGTGGGTGATCCCCGTGAGCCATTAGGCTGCCTGCAGGAGGGCTCTGGCTGCCACCCAAC 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAAAGTCAGGTGGTGTGGGTGATCCCCGTGAGCCATTAGGCTGCCTGCAGGAGGGCTCTGGCTGCCACCCAAC 740
Query 606 AACAGAGAGCTTTGAGAAAAGCGTGCGAGAGGATGCCTCACCTCTGCCCCATGTCTGTTGCTGCAAACAAGATG 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AACAGAGAGCTTTGAGAAAAGCGTGCGAGAGGATGCCTCACCTCTGCCCCATGTCTGTTGCTGCAAACAAGATG 814
Query 680 CTCTCATCCTCCAGCGTGGCCTTCATCATGAAGACGGCAGCCAGCACATCGGCCTCCTGCATCCTGGGGACAGA 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTCTCATCCTCCAGCGTGGCCTTCATCATGAAGACGGCAGCCAGCACATCGGCCTCCTGCATCCTGGGGACAGA 888
Query 754 GGGCCTGACCATGAGTACGTGCTGGTCGAGGAAGCGGAGTGTGCCATGAGCGAGAGGGAGGCTGCCCCAAATGA 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGCCTGACCATGAGTACGTGCTGGTCGAGGAAGCGGAGTGTGCCATGAGCGAGAGGGAGGCTGCCCCAAATGA 962
Query 828 GGAATTGGTGCAAAGAAACAGGTTAATATGCAGAAGAAATCCATATAGGATCTTTGAGTATTTGCAACTCAGCC 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAATTGGTGCAAAGAAACAGGTTAATATGCAGAAGAAATCCATATAGGATCTTTGAGTATTTGCAACTCAGCC 1036
Query 902 TAGAAGAGGCCTTTTTCTTGGTCTATGCTCTGGGATGTTTAAGTATTTACTATGAGAAGGAGCCTTTAACGATA 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TAGAAGAGGCCTTTTTCTTGGTCTATGCTCTGGGATGTTTAAGTATTTACTATGAGAAGGAGCCTTTAACGATA 1110
Query 976 GTGAAGCTCTGGAAAGCTTTCACTGTAGTTCAGCCCACGTTCAGAACCACCTACATGGCCTACCATTACTTTCG 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTGAAGCTCTGGAAAGCTTTCACTGTAGTTCAGCCCACGTTCAGAACCACCTACATGGCCTACCATTACTTTCG 1184
Query 1050 AAGCAAGGGCTGGGTGCCCAAAGTGGGACTCAAGTACGGGACAGATTTACTGCTATATCGGAAAGGCCCTCCAT 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGCAAGGGCTGGGTGCCCAAAGTGGGACTCAAGTACGGGACAGATTTACTGCTATATCGGAAAGGCCCTCCAT 1258
Query 1124 TTTACCATGCAAGTTATTCTGTCATTATCGAGCTAGTTGATGACCATTTTGAAGGCTCTCTCCGCAGGCCTCTC 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTTACCATGCAAGTTATTCTGTCATTATCGAGCTAGTTGATGACCATTTTGAAGGCTCTCTCCGCAGGCCTCTC 1332
Query 1198 AGTTGGAAGTCCCTGGCTGCCTTGAGCAGAGTTTCCGTTAATGTCTCTAAGGAACTTATGCTGTGCTATTTGAT 1271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGTTGGAAGTCCCTGGCTGCCTTGAGCAGAGTTTCCGTTAATGTCTCTAAGGAACTTATGCTGTGCTATTTGAT 1406
Query 1272 TAAACCCTCTACTATGACTGACAAGGAAATGGAGTCACCAGAATGTATGAAAAGGATTAAAGTTCAGGAGGTGA 1345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TAAACCCTCTACTATGACTGACAAGGAAATGGAGTCACCAGAATGTATGAAAAGGATTAAAGTTCAGGAGGTGA 1480
Query 1346 TTCTGAGTCGATGGGTTTCTTCACGAGAGAGGAGTGACCAAGACGATCTT------------------------ 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTCTGAGTCGATGGGTTTCTTCACGAGAGAGGAGTGACCAAGACGATCTTTAACAATTCAACCTCAAATTTCTA 1554
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1555 ATTTCACCAACAACTATTTATTGAGGGCTAGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTCCAATGCTGCGATCTTG 1628
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1629 GATCACTGCAACCTCTGCCTGCTGGGTTTAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGG 1702
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1703 CACGCACCACCACACACGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTC 1776
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1777 TGGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGAGTACAGGCGTGAGCCACTGC 1850
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1851 ATCCAGCTCTTAGCATGTGCTTTTAAAGTAAAAACCACGAGGAGAAGGTACTCATTACTTCATAACTTGTGTCT 1924
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1925 CACCCACCTTGCTGTCTTCACATCCCCACTTTCTGTATGCACATTGGAAGGTGAATTTGTTCAGCTCACATTAA 1998
Query 1396 ------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1999 TTTATAGGAATAATTTTCATTGCTCTGTGAATAAAATGTGCTACCACTT 2047