Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09069
- Subject:
- NM_134136.3
- Aligned Length:
- 3584
- Identities:
- 2969
- Gaps:
- 247
Alignment
Query 1 ATGGGGCCACGAAAGAAAAGTGTGAAAACATGTATCATGAATAATGAAATTCCAGAAGAAATGACAGCAGATGA 74
|||||.||||||||||||||||..|||...|||.|.|||.|.|.|||..|..|.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGGACCACGAAAGAAAAGTGCTAAAGTGTGTGTGATGGACAGTGAGGTCGCTGAGGAAATGACAGCCGATGA 74
Query 75 AACAAAGGACTATATGAATCAACTTTCACATGAAGTACTTTGCCATATTTTTAGGTACCTCCCTCTGCAGGATA 148
|...||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct 75 AGAGAAGGACTACATGAACCAGCTGTCACATGAAGTGCTCTGTCATATCTTCAGGTACCTGCCACTACAGGACA 148
Query 149 TCATGTGTATGGAATGTCTTTCCCGGAAGCTAAAGGAAGCAGTGACCCTATATCTGCGAGTTGTGAGAGTTGTA 222
|||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||.|||||||.|||||.||.
Sbjct 149 TCATGTGCATGGAATGCCTCTCTCGGAAGCTAAAGGAGGCAGTCACTCTGTATCTGAGAGTTGTCAGAGTGGTG 222
Query 223 GATCTCTGTGCAGGGCGGTGGTGGGAATACATGCCAAGTGGCTTTACAGATGCCAGTTTTCTAACACTATTAAA 296
|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 223 GATCTCTGTGCAGGGCGCTGGTGGGAATATATGCCAAGTGGCTTCACAGATTCCAGTTTCCTAACCCTTTTGAA 296
Query 297 GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTATATGGCCTTCACCCTCGATACCTTGAGAGGCGAAGAGTAAGGGGCCATG 370
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 297 GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTGTATGGCCTTCACCCTAGATACCTCGAGAGGCGAAGAGTGAGGGGCCAGG 370
Query 371 AGGCTTTTAGCATTCCAGGAGTCCTAGAAGCTTTGCAGTCATGCCCAAACTTAGTGGGTGTGGAAACTTCTCAT 444
|||||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 371 AGGCTTTCAGCATCCCAGGAGTCTTGGAAGCTTTGCAAGCGTGCCCAAACTTGGTGGGTGTAGAAACATCTCAT 444
Query 445 TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCCCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAATGG 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCGCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAACGG 518
Query 519 AGCTTTTCCAATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATTCCTATAGGAGCCAAAATTCAAACTTTACATTTAGTTG 592
|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 519 AGCATTTCCGATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATCCCCATAGGAGCCAAAATCCAAACTTTGCATTTAGTTG 592
Query 593 GGGTGAATGTTCCTGAAATTCCTTGTATCCCAATGCTAAGGCACCTTTATATGAAGTGGGTAAGACTCACTAAA 666
|.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 593 GTGTCAATGTTCCTGAAATCCCTTGTATCCCTATGCTAAGGCACCTGTACATGAAGTGGGTGAGACTCACTAAA 666
Query 667 CCACAGCCATTTAAAGACTTCCTTTGTATCAGCTTAAGAACTTTCGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCCACAAA 740
||||||||.||||||||.||||||||.||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 CCACAGCCGTTTAAAGATTTCCTTTGCATCAGCTTGCGAACTTTTGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCAACAAA 740
Query 741 TTCCTTGAAATATGTCCCTTTAGTAACAGGCTTAGCCTCTGCCCGAAACTTGGAACACTTAGAAATGGTTCGAG 814
.|||||||||||.||.||.||.||||||||..|.||.||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 741 CTCCTTGAAATACGTGCCCTTGGTAACAGGTCTGGCATCTGCCCGTAACCTGGAACACTTGGAAATGGTTCGAG 814
Query 815 TTCCTTTCCTTGGAGGTCTTATCCAACATGTTGTTGAAGACAGTTGGAGATCAGGTGGTTTTAGAAATTTGCAC 888
|.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 815 TCCCTTTCCTGGGAGGTCTCATCCAACACGTGGTTGAAGACAGCTGGAGATCAGGTGGTTTTAGGAACTTGCAC 888
Query 889 ACTATTGTTCTGGGAGCTTGCAAAAATGCTCTTGAAGTAGATCTTGGTTACCTCATCATTACTGCTGCCCGTAG 962
||||||||..|.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 889 ACTATTGTCTTAGGAGCTTGCAAGAATGCCCTGGAAGTAGACCTTGGCTACCTCATCATCACTGCTGCGCGAAG 962
Query 963 GTTACATGAAGTTCGGATCCAGCCTTCCCTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAGTTGG 1036
|||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 GTTACATGAAGTTCGCATCCAGCCTTCTTTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAATTGG 1036
Query 1037 AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTAGGATATGTAGATGAGTTTTTGCTACAGAGCAGAATGGCTAATGCG 1110
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1037 AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTGGGATATGTAGATGAGTTCTTGCTACAGAGCAGAATGGCGAATGCA 1110
Query 1111 GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT 1184
|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 GATTTGGTGAAGTATGGCTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATTACTGATATAGGGATGAAGGCAGT 1184
Query 1185 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTATAACTGTCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 1258
Query 1259 TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT 1332
|||||||||||||.||.||||..|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259 TCTCAGACCACTCGAGGTGGATGCGACTGGTTGATATCAACCTCGTGCGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGATTCT 1332
Query 1333 TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA 1406
||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1333 TTTGGCCAGTTTGTTGAATTATTGCCCAGCCTGGAATTTATTTCTCTGGACCAGATGTTCCGTGAGCCACCCAA 1406
Query 1407 GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT 1480
|||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1407 GGGCTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGAACTGGAATTGGGGTTTCCTCAGCGCTTGTCAGCAACCAGAATT 1480
Query 1481 CCAACAATGAC---GATAATAATGC-CCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGA 1550
||||||||||| ||.|||||||| ||| ||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1481 CCAACAATGACAATGACAATAATGCTCCA-AATAACAACGCCAACCTCCATGATAACAATCACCATCACCCAGA 1553
Query 1551 TGACTCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGA-GCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTA 1623
|||.||.||.||.||.|||||||||||.|.|||.||.||..||||||| ||| ||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1554 TGATTCGGATGACGACAATGACTTTCGTCCAGACCTACAAGCAGGAGAGGCA-CAATTTGCAGCCGATGCGTTG 1626
Query 1624 AATGAGATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAG 1697
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||.|||||||||||||||..||..||||||||||.
Sbjct 1627 AATGAGATGGAAGACATGGTCCAGGAAGATGGAGAACTGGTAGCCGAGAGTGGAAATGGTATGCCAGCTCACAA 1700
Query 1698 CCAGGCAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAA 1771
.|.||.|.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1701 TCGGGAAGTTCTTCCTGTGGATGCTGATGAGGAACAAGCAGGACCTAGTGGTCTACAACGCGTGGTAAAACCTA 1774
Query 1772 CCTCAATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCT 1845
|..|||||.|||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1775 CACCAATTGCTGATCACGATTCAGAGAGCGATGATGAAGAAGATAGTTTAGAACTCCAAGAAGTCTGGGCTCCT 1848
Query 1846 AAGAACGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAATTGTCAGT 1919
|||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||||..||||||||.|||..|.||||
Sbjct 1849 AAGAATGGCACCCGGCGTTACTCAGAGCGGGAAGAAAAGACTGGAGACTCAGGACAGTCCAGGGAAACGGCAGT 1922
Query 1920 AAGTGGAAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGT---ACAACTCCCATCAGATGGGCCAGTCGAAGCAGTTTC 1990
||||||.|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||.||||.|||||||.||||||.|||||
Sbjct 1923 AAGTGGGAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGTGCAACAACTCCCACCAGACGGGCCAGGCGAAGCCGTTTC 1996
Query 1991 CCCTCGAGGAAAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTCACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCAGCT 2064
||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997 CCCTGGAGGAGAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTGACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCAGCT 2070
Query 2065 AGGGATATTCCTGAAAAGAAAAAAAACAAGGATGTTTATCCCAGCTGCAGCAGCACCA------------CCGC 2126
||||||.||.||||||||||||||..|||||||||.|||||||||||||||||||.|| ||||
Sbjct 2071 AGGGATGTTTCTGAAAAGAAAAAATCCAAGGATGTCTATCCCAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACAGCCGC 2144
Query 2127 CAGCACAGTGGGAAACTCCAGCTCACACAACACTGCTTCTCAAAGCCCCGACTTTGTAAGGACGGTGAACAGCG 2200
||||||||.|||||||.|||||||||.||.|||||||||.||.|||||.|||||||.|||||||||||.||||.
Sbjct 2145 CAGCACAGCGGGAAACGCCAGCTCACCCAGCACTGCTTCCCAGAGCCCGGACTTTGCAAGGACGGTGACCAGCA 2218
Query 2201 GCGGCTCTTCCGAGCCTAGCCCTACAGAAGTGGATGTGTCCAGGCAGTGTGCCTGCTCCCCCGGTGGGTCAGAG 2274
||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 2219 GCGGCTCTTCCGAGCCGAGCCCTCCAGAAGTAGATGTATCCAGGCAGTGTGTCTGCTCCCCTGGTGGGTCAGAG 2292
Query 2275 GACTCTGAGGCCATGGAGGAGGGAGATGCAGAGAGTTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCACAGGCCCCAGGA 2348
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2293 GACTCTGAGGCCATGGAGGAGGGAGATGCAGAGAGCTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCTCAGGCCCCAGGA 2366
Query 2349 ATCCCAAAGGAGAACTAGCAGGTGTTCTGATGAGGAACGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATGGCC 2422
.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2367 GTCTCAAAGGAGAACTGGCAGGTGTTCTGATGAGGAGCGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATGGCG 2440
Query 2423 CGGAT--------------------------------------------------------------------- 2427
|||||
Sbjct 2441 CGGATGGTACGAGATCCGCCTTTTCCTTTAGGACTCTGCCACAAGGGGGGTCTTCAGGCCCAGCACATGATGAG 2514
Query 2428 -------------------------------------------------------------------------- 2427
Sbjct 2515 AGGACTAATGGGAGTGGCTGTGGGGCTACAGGTGAGGACAGGAGGGGGAGCTCCCAGCCTGAGAGTTGTGACGT 2588
Query 2428 -------------------------------------------------------------------------- 2427
Sbjct 2589 GCAGTCTAATGAAGACTATCCTCGGAGGCCCCTAACCAGGGCCAGGAGCAGACTGTCCCATGTACCGCTGATAT 2662
Query 2428 --------GAAGTAGCCAAAACAAAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACTAGT 2493
|||||.|||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 2663 CTGAGTCAGAAGTTGCCAAAACAAAGCCATGCCATGCCATGAAACGAAAGCGAACTGCAGATAAGTCTACCAGC 2736
Query 2494 ACAAGTGATCCTGTGATCGAGGATGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGTCAC 2567
||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2737 ACCAGTGACCCTGTGATTGAAGATGACCACGTACAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAAAATCTTGTTGGAGTCAC 2810
Query 2568 TATGACCAATTGTGGAATCACAGATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAGGT 2641
.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 AATGACCAATTGTGGAATCACAGATCTAGTACTGAAAGACTGCCCCAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAGGT 2884
Query 2642 GCAGGGTACTAAAACATTTAAAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGAAA 2715
||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2885 GCAGGGTACTGAAGCATTTAAAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGAAA 2958
Query 2716 CTGAACATGGATCAGGTACTAGACCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACGCCC 2789
||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 2959 CTAAATATGGACCAGGTACTAGACCAAATACTGAGGATGCCTCCGGAGAGGAACCGGATCATCTACCTGCGCCC 3032
Query 2790 AATGCAGCAGGTGGACACTCTAACTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTATTA 2863
||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 3033 AATGCAGCAGGTAGACACACTAACTCTGGAGCAGAAGCTCTTCAGCGGGCCCTACCCCTATCACATCTGCATCA 3106
Query 2864 TCCATGAATTCAGTAACCCTCCCAATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCAAAC 2937
||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||..|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3107 TCCACGAGTTCAGCAATCCTCCCAACGTGCGGAACAAGGTGCGCATCCGCAATTGGATGGACACGATAGCCAAC 3180
Query 2938 ATCAATCAAGAGCTCATTAAATATGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATACCC 3011
|||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||.|.||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 3181 ATCAATCAAGAGCTCATTAAATACGAATTCTTCCTGGAAGCCACTCGGACTGAAGAGGATTTAAAGAAGTACCC 3254
Query 3012 CAAGTACCCCTGGGGGAGAGAAATCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTTCTG 3085
.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 3255 TAAGTATCCCTGGGGGAGAGAAATCTACACTTTAGAGGGTGTTGTAGATGGAGCGCCGTATTCCATGATTTCCG 3328
Query 3086 ACTTCCCTTGGCTGAGGTCATTACGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGATGAA 3159
||||||||||||||||||||.|.||..|.|||||||||||||||||.||..||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 3329 ACTTCCCTTGGCTGAGGTCACTGCGGACCGCAGAGCCCAACAGCTTTGCCAGATATGATTTTGAAGATGATGAA 3402
Query 3160 GAAAGCACTATCTATGCTCCTAGAAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGAGGA 3233
||.|||||.||||||||||||.||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 3403 GAGAGCACCATCTATGCTCCTCGAAGAAAAGGGCAGTTGTCTGCAGACATTTGTATGGAGACAATAGGAGAGGA 3476
Query 3234 AATTTCAGAGATGCGTCAGATGAAGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTGATG 3307
.||.|||||||||||.||||||||||.|||..||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 3477 GATCTCAGAGATGCGCCAGATGAAGAGGGGCATATTTCAGCGAGTAGTAGCGATTTTTATCCACTACTGTGATG 3550
Query 3308 TCAATGGAGAGCCAGTTGAAGATGACTACATT 3339
||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 3551 TCAATGGAGAGCCAGTTGAAGACGACTACATT 3582