Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09069
- Subject:
- XM_006525498.1
- Aligned Length:
- 3587
- Identities:
- 2969
- Gaps:
- 250
Alignment
Query 1 ATGGGGCCACGAAAGAAAAGTGTGAAAACATGTATCATGAATAATGAAATTCCAGAAGAAATGACAGCAGATGA 74
|||||.||||||||||||||||..|||...|||.|.|||.|.|.|||..|..|.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGGACCACGAAAGAAAAGTGCTAAAGTGTGTGTGATGGACAGTGAGGTCGCTGAGGAAATGACAGCCGATGA 74
Query 75 AACAAAGGACTATATGAATCAACTTTCACATGAAGTACTTTGCCATATTTTTAGGTACCTCCCTCTGCAGGATA 148
|...||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct 75 AGAGAAGGACTACATGAACCAGCTGTCACATGAAGTGCTCTGTCATATCTTCAGGTACCTGCCACTACAGGACA 148
Query 149 TCATGTGTATGGAATGTCTTTCCCGGAAGCTAAAGGAAGCAGTGACCCTATATCTGCGAGTTGTGAGAGTTGTA 222
|||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||.|||||||.|||||.||.
Sbjct 149 TCATGTGCATGGAATGCCTCTCTCGGAAGCTAAAGGAGGCAGTCACTCTGTATCTGAGAGTTGTCAGAGTGGTG 222
Query 223 GATCTCTGTGCAGGGCGGTGGTGGGAATACATGCCAAGTGGCTTTACAGATGCCAGTTTTCTAACACTATTAAA 296
|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 223 GATCTCTGTGCAGGGCGCTGGTGGGAATATATGCCAAGTGGCTTCACAGATTCCAGTTTCCTAACCCTTTTGAA 296
Query 297 GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTATATGGCCTTCACCCTCGATACCTTGAGAGGCGAAGAGTAAGGGGCCATG 370
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 297 GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTGTATGGCCTTCACCCTAGATACCTCGAGAGGCGAAGAGTGAGGGGCCAGG 370
Query 371 AGGCTTTTAGCATTCCAGGAGTCCTAGAAGCTTTGCAGTCATGCCCAAACTTAGTGGGTGTGGAAACTTCTCAT 444
|||||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 371 AGGCTTTCAGCATCCCAGGAGTCTTGGAAGCTTTGCAAGCGTGCCCAAACTTGGTGGGTGTAGAAACATCTCAT 444
Query 445 TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCCCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAATGG 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCGCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAACGG 518
Query 519 AGCTTTTCCAATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATTCCTATAGGAGCCAAAATTCAAACTTTACATTTAGTTG 592
|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 519 AGCATTTCCGATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATCCCCATAGGAGCCAAAATCCAAACTTTGCATTTAGTTG 592
Query 593 GGGTGAATGTTCCTGAAATTCCTTGTATCCCAATGCTAAGGCACCTTTATATGAAGTGGGTAAGACTCACTAAA 666
|.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 593 GTGTCAATGTTCCTGAAATCCCTTGTATCCCTATGCTAAGGCACCTGTACATGAAGTGGGTGAGACTCACTAAA 666
Query 667 CCACAGCCATTTAAAGACTTCCTTTGTATCAGCTTAAGAACTTTCGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCCACAAA 740
||||||||.||||||||.||||||||.||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 CCACAGCCGTTTAAAGATTTCCTTTGCATCAGCTTGCGAACTTTTGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCAACAAA 740
Query 741 TTCCTTGAAATATGTCCCTTTAGTAACAGGCTTAGCCTCTGCCCGAAACTTGGAACACTTAGAAATGGTTCGAG 814
.|||||||||||.||.||.||.||||||||..|.||.||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 741 CTCCTTGAAATACGTGCCCTTGGTAACAGGTCTGGCATCTGCCCGTAACCTGGAACACTTGGAAATGGTTCGAG 814
Query 815 TTCCTTTCCTTGGAGGTCTTATCCAACATGTTGTTGAAGACAGTTGGAGATCAGGTGGTTTTAGAAATTTGCAC 888
|.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 815 TCCCTTTCCTGGGAGGTCTCATCCAACACGTGGTTGAAGACAGCTGGAGATCAGGTGGTTTTAGGAACTTGCAC 888
Query 889 ACTATTGTTCTGGGAGCTTGCAAAAATGCTCTTGAAGTAGATCTTGGTTACCTCATCATTACTGCTGCCCGTAG 962
||||||||..|.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 889 ACTATTGTCTTAGGAGCTTGCAAGAATGCCCTGGAAGTAGACCTTGGCTACCTCATCATCACTGCTGCGCGAAG 962
Query 963 GTTACATGAAGTTCGGATCCAGCCTTCCCTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAGTTGG 1036
|||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 GTTACATGAAGTTCGCATCCAGCCTTCTTTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAATTGG 1036
Query 1037 AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTAGGATATGTAGATGAGTTTTTGCTACAGAGCAGAATGGCTAATGCG 1110
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1037 AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTGGGATATGTAGATGAGTTCTTGCTACAGAGCAGAATGGCGAATGCA 1110
Query 1111 GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT 1184
|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 GATTTGGTGAAGTATGGCTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATTACTGATATAGGGATGAAGGCAGT 1184
Query 1185 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTATAACTGTCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 1258
Query 1259 TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT 1332
|||||||||||||.||.||||..|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259 TCTCAGACCACTCGAGGTGGATGCGACTGGTTGATATCAACCTCGTGCGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGATTCT 1332
Query 1333 TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA 1406
||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1333 TTTGGCCAGTTTGTTGAATTATTGCCCAGCCTGGAATTTATTTCTCTGGACCAGATGTTCCGTGAGCCACCCAA 1406
Query 1407 GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT 1480
|||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1407 GGGCTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGAACTGGAATTGGGGTTTCCTCAGCGCTTGTCAGCAACCAGAATT 1480
Query 1481 CCAACAATGAC---GATAATAATGC-CCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGA 1550
||||||||||| ||.|||||||| ||| ||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1481 CCAACAATGACAATGACAATAATGCTCCA-AATAACAACGCCAACCTCCATGATAACAATCACCATCACCCAGA 1553
Query 1551 TGACTCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGA-GCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTA 1623
|||.||.||.||.||.|||||||||||.|.|||.||.||..||||||| ||| ||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1554 TGATTCGGATGACGACAATGACTTTCGTCCAGACCTACAAGCAGGAGAGGCA-CAATTTGCAGCCGATGCGTTG 1626
Query 1624 AATGAGATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAG 1697
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||.|||||||||||||||..||..||||||||||.
Sbjct 1627 AATGAGATGGAAGACATGGTCCAGGAAGATGGAGAACTGGTAGCCGAGAGTGGAAATGGTATGCCAGCTCACAA 1700
Query 1698 CCAGGCAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAA 1771
.|.||.|.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1701 TCGGGAAGTTCTTCCTGTGGATGCTGATGAGGAACAAGCAGGACCTAGTGGTCTACAACGCGTGGTAAAACCTA 1774
Query 1772 CCTCAATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCT 1845
|..|||||.|||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1775 CACCAATTGCTGATCACGATTCAGAGAGCGATGATGAAGAAGATAGTTTAGAACTCCAAGAAGTCTGGGCTCCT 1848
Query 1846 AAGAACGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAATTG---TC 1916
|||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||||..||||||||.|||..| .|
Sbjct 1849 AAGAATGGCACCCGGCGTTACTCAGAGCGGGAAGAAAAGACTGGAGACTCAGGACAGTCCAGGGAAACGGCAGC 1922
Query 1917 AGTAAGTGGAAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGT---ACAACTCCCATCAGATGGGCCAGTCGAAGCAGT 1987
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||.||||.|||||||.||||||.||
Sbjct 1923 AGTAAGTGGGAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGTGCAACAACTCCCACCAGACGGGCCAGGCGAAGCCGT 1996
Query 1988 TTCCCCTCGAGGAAAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTCACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCA 2061
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997 TTCCCCTGGAGGAGAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTGACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCA 2070
Query 2062 GCTAGGGATATTCCTGAAAAGAAAAAAAACAAGGATGTTTATCCCAGCTGCAGCAGCACCA------------C 2123
|||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||.|||||||||||||||||||.|| |
Sbjct 2071 GCTAGGGATGTTTCTGAAAAGAAAAAATCCAAGGATGTCTATCCCAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACAGC 2144
Query 2124 CGCCAGCACAGTGGGAAACTCCAGCTCACACAACACTGCTTCTCAAAGCCCCGACTTTGTAAGGACGGTGAACA 2197
|||||||||||.|||||||.|||||||||.||.|||||||||.||.|||||.|||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2145 CGCCAGCACAGCGGGAAACGCCAGCTCACCCAGCACTGCTTCCCAGAGCCCGGACTTTGCAAGGACGGTGACCA 2218
Query 2198 GCGGCGGCTCTTCCGAGCCTAGCCCTACAGAAGTGGATGTGTCCAGGCAGTGTGCCTGCTCCCCCGGTGGGTCA 2271
||.||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 2219 GCAGCGGCTCTTCCGAGCCGAGCCCTCCAGAAGTAGATGTATCCAGGCAGTGTGTCTGCTCCCCTGGTGGGTCA 2292
Query 2272 GAGGACTCTGAGGCCATGGAGGAGGGAGATGCAGAGAGTTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCACAGGCCCCA 2345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2293 GAGGACTCTGAGGCCATGGAGGAGGGAGATGCAGAGAGCTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCTCAGGCCCCA 2366
Query 2346 GGAATCCCAAAGGAGAACTAGCAGGTGTTCTGATGAGGAACGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATG 2419
|||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367 GGAGTCTCAAAGGAGAACTGGCAGGTGTTCTGATGAGGAGCGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATG 2440
Query 2420 GCCCGGAT------------------------------------------------------------------ 2427
||.|||||
Sbjct 2441 GCGCGGATGGTACGAGATCCGCCTTTTCCTTTAGGACTCTGCCACAAGGGGGGTCTTCAGGCCCAGCACATGAT 2514
Query 2428 -------------------------------------------------------------------------- 2427
Sbjct 2515 GAGAGGACTAATGGGAGTGGCTGTGGGGCTACAGGTGAGGACAGGAGGGGGAGCTCCCAGCCTGAGAGTTGTGA 2588
Query 2428 -------------------------------------------------------------------------- 2427
Sbjct 2589 CGTGCAGTCTAATGAAGACTATCCTCGGAGGCCCCTAACCAGGGCCAGGAGCAGACTGTCCCATGTACCGCTGA 2662
Query 2428 -----------GAAGTAGCCAAAACAAAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACT 2490
|||||.|||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.
Sbjct 2663 TATCTGAGTCAGAAGTTGCCAAAACAAAGCCATGCCATGCCATGAAACGAAAGCGAACTGCAGATAAGTCTACC 2736
Query 2491 AGTACAAGTGATCCTGTGATCGAGGATGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGT 2564
||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2737 AGCACCAGTGACCCTGTGATTGAAGATGACCACGTACAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAAAATCTTGTTGGAGT 2810
Query 2565 CACTATGACCAATTGTGGAATCACAGATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCA 2638
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 CACAATGACCAATTGTGGAATCACAGATCTAGTACTGAAAGACTGCCCCAAGATGATGTTCATCCATGCTACCA 2884
Query 2639 GGTGCAGGGTACTAAAACATTTAAAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAG 2712
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2885 GGTGCAGGGTACTGAAGCATTTAAAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAG 2958
Query 2713 AAACTGAACATGGATCAGGTACTAGACCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACG 2786
|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2959 AAACTAAATATGGACCAGGTACTAGACCAAATACTGAGGATGCCTCCGGAGAGGAACCGGATCATCTACCTGCG 3032
Query 2787 CCCAATGCAGCAGGTGGACACTCTAACTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTA 2860
|||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3033 CCCAATGCAGCAGGTAGACACACTAACTCTGGAGCAGAAGCTCTTCAGCGGGCCCTACCCCTATCACATCTGCA 3106
Query 2861 TTATCCATGAATTCAGTAACCCTCCCAATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCA 2934
|.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||..|||||||||||.|||||.
Sbjct 3107 TCATCCACGAGTTCAGCAATCCTCCCAACGTGCGGAACAAGGTGCGCATCCGCAATTGGATGGACACGATAGCC 3180
Query 2935 AACATCAATCAAGAGCTCATTAAATATGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATA 3008
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||.|.||||||.||.||||||||.||
Sbjct 3181 AACATCAATCAAGAGCTCATTAAATACGAATTCTTCCTGGAAGCCACTCGGACTGAAGAGGATTTAAAGAAGTA 3254
Query 3009 CCCCAAGTACCCCTGGGGGAGAGAAATCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTT 3082
|||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 3255 CCCTAAGTATCCCTGGGGGAGAGAAATCTACACTTTAGAGGGTGTTGTAGATGGAGCGCCGTATTCCATGATTT 3328
Query 3083 CTGACTTCCCTTGGCTGAGGTCATTACGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGAT 3156
|.|||||||||||||||||||||.|.||..|.|||||||||||||||||.||..||||.||.||||||||.|||
Sbjct 3329 CCGACTTCCCTTGGCTGAGGTCACTGCGGACCGCAGAGCCCAACAGCTTTGCCAGATATGATTTTGAAGATGAT 3402
Query 3157 GAAGAAAGCACTATCTATGCTCCTAGAAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGA 3230
|||||.|||||.||||||||||||.||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 3403 GAAGAGAGCACCATCTATGCTCCTCGAAGAAAAGGGCAGTTGTCTGCAGACATTTGTATGGAGACAATAGGAGA 3476
Query 3231 GGAAATTTCAGAGATGCGTCAGATGAAGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTG 3304
|||.||.|||||||||||.||||||||||.|||..||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 3477 GGAGATCTCAGAGATGCGCCAGATGAAGAGGGGCATATTTCAGCGAGTAGTAGCGATTTTTATCCACTACTGTG 3550
Query 3305 ATGTCAATGGAGAGCCAGTTGAAGATGACTACATT 3339
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 3551 ATGTCAATGGAGAGCCAGTTGAAGACGACTACATT 3585