Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09069
- Subject:
- XM_017009901.2
- Aligned Length:
- 3339
- Identities:
- 2241
- Gaps:
- 1098
Alignment
Query 1 ATGGGGCCACGAAAGAAAAGTGTGAAAACATGTATCATGAATAATGAAATTCCAGAAGAAATGACAGCAGATGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AACAAAGGACTATATGAATCAACTTTCACATGAAGTACTTTGCCATATTTTTAGGTACCTCCCTCTGCAGGATA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCATGTGTATGGAATGTCTTTCCCGGAAGCTAAAGGAAGCAGTGACCCTATATCTGCGAGTTGTGAGAGTTGTA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GATCTCTGTGCAGGGCGGTGGTGGGAATACATGCCAAGTGGCTTTACAGATGCCAGTTTTCTAACACTATTAAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTATATGGCCTTCACCCTCGATACCTTGAGAGGCGAAGAGTAAGGGGCCATG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGGCTTTTAGCATTCCAGGAGTCCTAGAAGCTTTGCAGTCATGCCCAAACTTAGTGGGTGTGGAAACTTCTCAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCCCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAATGG 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AGCTTTTCCAATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATTCCTATAGGAGCCAAAATTCAAACTTTACATTTAGTTG 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 GGGTGAATGTTCCTGAAATTCCTTGTATCCCAATGCTAAGGCACCTTTATATGAAGTGGGTAAGACTCACTAAA 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 CCACAGCCATTTAAAGACTTCCTTTGTATCAGCTTAAGAACTTTCGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCCACAAA 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 TTCCTTGAAATATGTCCCTTTAGTAACAGGCTTAGCCTCTGCCCGAAACTTGGAACACTTAGAAATGGTTCGAG 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 TTCCTTTCCTTGGAGGTCTTATCCAACATGTTGTTGAAGACAGTTGGAGATCAGGTGGTTTTAGAAATTTGCAC 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 ACTATTGTTCTGGGAGCTTGCAAAAATGCTCTTGAAGTAGATCTTGGTTACCTCATCATTACTGCTGCCCGTAG 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 GTTACATGAAGTTCGGATCCAGCCTTCCCTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAGTTGG 1036
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1037 AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTAGGATATGTAGATGAGTTTTTGCTACAGAGCAGAATGGCTAATGCG 1110
||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------------------ATGGCTAATGCG 12
Query 1111 GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT 86
Query 1185 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 87 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 160
Query 1259 TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 161 TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT 234
Query 1333 TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA 308
Query 1407 GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 309 GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT 382
Query 1481 CCAACAATGACGATAATAATGCCCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGATGAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 CCAACAATGACGATAATAATGCCCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGATGAC 456
Query 1555 TCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGAGCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTAAATGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 457 TCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGAGCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTAAATGA 530
Query 1629 GATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAGCCAGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 GATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAGCCAGG 604
Query 1703 CAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAACCTCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 605 CAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAACCTCA 678
Query 1777 ATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCTAAGAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 ATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCTAAGAA 752
Query 1851 CGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAATTGTCAGTAAGTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 753 CGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAATTGTCAGTAAGTG 826
Query 1925 GAAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGTACAACTCCCATCAGATGGGCCAGTCGAAGCAGTTTCCCCTCGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 827 GAAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGTACAACTCCCATCAGATGGGCCAGTCGAAGCAGTTTCCCCTCGAG 900
Query 1999 GAAAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTCACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCAGCTAGGGATAT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GAAAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTCACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCAGCTAGGGATAT 974
Query 2073 TCCTGAAAAGAAAAAAAACAAGGATGTTTATCCCAGCTGCAGCAGCACCACCGCCAGCACAGTGGGAAACTCCA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 975 TCCTGAAAAGAAAAAAAACAAGGATGTTTATCCCAGCTGCAGCAGCACCACCGCCAGCACAGTGGGAAACTCCA 1048
Query 2147 GCTCACACAACACTGCTTCTCAAAGCCCCGACTTTGTAAGGACGGTGAACAGCGGCGGCTCTTCCGAGCCTAGC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1049 GCTCACACAACACTGCTTCTCAAAGCCCCGACTTTGTAAGGACGGTGAACAGCGGCGGCTCTTCCGAGCCTAGC 1122
Query 2221 CCTACAGAAGTGGATGTGTCCAGGCAGTGTGCCTGCTCCCCCGGTGGGTCAGAGGACTCTGAGGCCATGGAGGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123 CCTACAGAAGTGGATGTGTCCAGGCAGTGTGCCTGCTCCCCCGGTGGGTCAGAGGACTCTGAGGCCATGGAGGA 1196
Query 2295 GGGAGATGCAGAGAGTTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCACAGGCCCCAGGAATCCCAAAGGAGAACTAGCA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 GGGAGATGCAGAGAGTTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCACAGGCCCCAGGAATCCCAAAGGAGAACTAGCA 1270
Query 2369 GGTGTTCTGATGAGGAACGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATGGCCCGGATGAAGTAGCCAAAACA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271 GGTGTTCTGATGAGGAACGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATGGCCCGGATGAAGTAGCCAAAACA 1344
Query 2443 AAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACTAGTACAAGTGATCCTGTGATCGAGGA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1345 AAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACTAGTACAAGTGATCCTGTGATCGAGGA 1418
Query 2517 TGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGTCACTATGACCAATTGTGGAATCACAG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1419 TGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGTCACTATGACCAATTGTGGAATCACAG 1492
Query 2591 ATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAGGTGCAGGGTACTAAAACATTTAAAG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 ATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAGGTGCAGGGTACTAAAACATTTAAAG 1566
Query 2665 GTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGAAACTGAACATGGATCAGGTACTAGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1567 GTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGAAACTGAACATGGATCAGGTACTAGA 1640
Query 2739 CCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACGCCCAATGCAGCAGGTGGACACTCTAA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1641 CCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACGCCCAATGCAGCAGGTGGACACTCTAA 1714
Query 2813 CTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTATTATCCATGAATTCAGTAACCCTCCC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1715 CTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTATTATCCATGAATTCAGTAACCCTCCC 1788
Query 2887 AATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCAAACATCAATCAAGAGCTCATTAAATA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1789 AATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCAAACATCAATCAAGAGCTCATTAAATA 1862
Query 2961 TGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATACCCCAAGTACCCCTGGGGGAGAGAAA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1863 TGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATACCCCAAGTACCCCTGGGGGAGAGAAA 1936
Query 3035 TCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTTCTGACTTCCCTTGGCTGAGGTCATTA 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1937 TCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTTCTGACTTCCCTTGGCTGAGGTCATTA 2010
Query 3109 CGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGATGAAGAAAGCACTATCTATGCTCCTAG 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2011 CGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGATGAAGAAAGCACTATCTATGCTCCTAG 2084
Query 3183 AAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGAGGAAATTTCAGAGATGCGTCAGATGA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2085 AAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGAGGAAATTTCAGAGATGCGTCAGATGA 2158
Query 3257 AGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTGATGTCAATGGAGAGCCAGTTGAAGAT 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 AGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTGATGTCAATGGAGAGCCAGTTGAAGAT 2232
Query 3331 GACTACATT 3339
|||||||||
Sbjct 2233 GACTACATT 2241
