Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09069
• Subject: XM_024446223.1
• Aligned Length: 3564
• Identities: 3338
• Gaps: 225

Alignment

Query    1  ATGGGGCCACGAAAGAAAAGTGTGAAAACATGTATCATGAATAATGAAATTCCAGAAGAAATGACAGCAGATGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCACGAAAGAAAAGTGTGAAAACATGTATCATGAATAATGAAATTCCAGAAGAAATGACAGCAGATGA  74

Query   75  AACAAAGGACTATATGAATCAACTTTCACATGAAGTACTTTGCCATATTTTTAGGTACCTCCCTCTGCAGGATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACAAAGGACTATATGAATCAACTTTCACATGAAGTACTTTGCCATATTTTTAGGTACCTCCCTCTGCAGGATA  148

Query  149  TCATGTGTATGGAATGTCTTTCCCGGAAGCTAAAGGAAGCAGTGACCCTATATCTGCGAGTTGTGAGAGTTGTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATGTGTATGGAATGTCTTTCCCGGAAGCTAAAGGAAGCAGTGACCCTATATCTGCGAGTTGTGAGAGTTGTA  222

Query  223  GATCTCTGTGCAGGGCGGTGGTGGGAATACATGCCAAGTGGCTTTACAGATGCCAGTTTTCTAACACTATTAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATCTCTGTGCAGGGCGGTGGTGGGAATACATGCCAAGTGGCTTTACAGATGCCAGTTTTCTAACACTATTAAA  296

Query  297  GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTATATGGCCTTCACCCTCGATACCTTGAGAGGCGAAGAGTAAGGGGCCATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTATATGGCCTTCACCCTCGATACCTTGAGAGGCGAAGAGTAAGGGGCCATG  370

Query  371  AGGCTTTTAGCATTCCAGGAGTCCTAGAAGCTTTGCAGTCATGCCCAAACTTAGTGGGTGTGGAAACTTCTCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGCTTTTAGCATTCCAGGAGTCCTAGAAGCTTTGCAGGCATGCCCAAACTTAGTGGGTGTGGAAACTTCTCAT  444

Query  445  TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCCCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAATGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCCCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAATGG  518

Query  519  AGCTTTTCCAATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATTCCTATAGGAGCCAAAATTCAAACTTTACATTTAGTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCTTTTCCAATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATTCCTATAGGAGCCAAAATTCAAACTTTACATTTAGTTG  592

Query  593  GGGTGAATGTTCCTGAAATTCCTTGTATCCCAATGCTAAGGCACCTTTATATGAAGTGGGTAAGACTCACTAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGTGAATGTTCCTGAAATTCCTTGTATCCCAATGCTAAGGCACCTTTATATGAAGTGGGTAAGACTCACTAAA  666

Query  667  CCACAGCCATTTAAAGACTTCCTTTGTATCAGCTTAAGAACTTTCGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCCACAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCACAGCCATTTAAAGACTTCCTTTGTATCAGCTTAAGAACTTTCGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCCACAAA  740

Query  741  TTCCTTGAAATATGTCCCTTTAGTAACAGGCTTAGCCTCTGCCCGAAACTTGGAACACTTAGAAATGGTTCGAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCCTTGAAATATGTCCCTTTAGTAACAGGCTTAGCCTCTGCCCGAAACTTGGAACACTTAGAAATGGTTCGAG  814

Query  815  TTCCTTTCCTTGGAGGTCTTATCCAACATGTTGTTGAAGACAGTTGGAGATCAGGTGGTTTTAGAAATTTGCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCCTTTCCTTGGAGGTCTTATCCAACATGTTGTTGAAGACAGTTGGAGATCAGGTGGTTTTAGAAATTTGCAC  888

Query  889  ACTATTGTTCTGGGAGCTTGCAAAAATGCTCTTGAAGTAGATCTTGGTTACCTCATCATTACTGCTGCCCGTAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTATTGTTCTGGGAGCTTGCAAAAATGCTCTTGAAGTAGATCTTGGTTACCTCATCATTACTGCTGCCCGTAG  962

Query  963  GTTACATGAAGTTCGGATCCAGCCTTCCCTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAGTTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTACATGAAGTTCGGATCCAGCCTTCCCTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAGTTGG  1036

Query 1037  AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTAGGATATGTAGATGAGTTTTTGCTACAGAGCAGAATGGCTAATGCG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTAGGATATGTAGATGAGTTTTTGCTACAGAGCAGAATGGCTAATGCG  1110

Query 1111  GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT  1184

Query 1185  CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA  1258

Query 1259  TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT  1332

Query 1333  TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA  1406

Query 1407  GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT  1480

Query 1481  CCAACAATGACGATAATAATGCCCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGATGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCAACAATGACGATAATAATGCCCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGATGAC  1554

Query 1555  TCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGAGCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTAAATGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGAGCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTAAATGA  1628

Query 1629  GATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAGCCAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAGCCAGG  1702

Query 1703  CAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAACCTCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAACCTCA  1776

Query 1777  ATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCTAAGAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCTAAGAA  1850

Query 1851  CGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAATTGTCAGTAAGTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAATTGTCAGTAAGTG  1924

Query 1925  GAAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGTACAACTCCCATCAGATGGGCCAGTCGAAGCAGTTTCCCCTCGAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GAAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGTACAACTCCCATCAGATGGGCCAGTCGAAGCAGTTTCCCCTCGAG  1998

Query 1999  GAAAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTCACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCAGCTAGGGATAT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAAAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTCACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCAGCTAGGGATAT  2072

Query 2073  TCCTGAAAAGAAAAAAAACAAGGATGTTTATCCCAGCTGCAGCAGCACCACCGCCAGCACAGTGGGAAACTCCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCCTGAAAAGAAAAAAAACAAGGATGTTTATCCCAGCTGCAGCAGCACCACCGCCAGCACAGTGGGAAACTCCA  2146

Query 2147  GCTCACACAACACTGCTTCTCAAAGCCCCGACTTTGTAAGGACGGTGAACAGCGGCGGCTCTTCCGAGCCTAGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCTCACACAACACTGCTTCTCAAAGCCCCGACTTTGTAAGGACGGTGAACAGCGGCGGCTCTTCCGAGCCTAGC  2220

Query 2221  CCTACAGAAGTGGATGTGTCCAGGCAGTGTGCCTGCTCCCCCGGTGGGTCAGAGGACTCTGAGGCCATGGAGGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCTACAGAAGTGGATGTGTCCAGGCAGTGTGCCTGCTCCCCCGGTGGGTCAGAGGACTCTGAGGCCATGGAGGA  2294

Query 2295  GGGAGATGCAGAGAGTTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCACAGGCCCCAGGAATCCCAAAGGAGAACTAGCA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGGAGATGCAGAGAGTTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCACAGGCCCCAGGAATCCCAAAGGAGAACTAGCA  2368

Query 2369  GGTGTTCTGATGAGGAACGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATGGCCCGGAT---------------  2427
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 2369  GGTGTTCTGATGAGGAACGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATGGCCCGGATGGTACGAGATCCGCC  2442

Query 2428  --------------------------------------------------------------------------  2427
                                                                                      
Sbjct 2443  TTTTCCTTTAGGACTCTGCCACAAGGGGGGTCTTCAGGCCCAGCACATGATGAGAGGACTAATGGGAGTGGCTC  2516

Query 2428  --------------------------------------------------------------------------  2427
                                                                                      
Sbjct 2517  TGGGGCTACAGGTGAGGACAGGAGGGGGAGCTCCCAGCCTGAGAGTTGTGACGTGCAGTCTAATGAAGACTACC  2590

Query 2428  --------------------------------------------------------------GAAGTAGCCAAA  2439
                                                                          ||||||||||||
Sbjct 2591  CTCGGAGGCCCCTAACCAGGGCCAGGAGCAGACTGTCCCATGTACTGCTGGTATCTGAGTCAGAAGTAGCCAAA  2664

Query 2440  ACAAAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACTAGTACAAGTGATCCTGTGATCGA  2513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  ACAAAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACTAGTACAAGTGATCCTGTGATCGA  2738

Query 2514  GGATGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGTCACTATGACCAATTGTGGAATCA  2587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GGATGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGTCACTATGACCAATTGTGGAATCA  2812

Query 2588  CAGATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAGGTGCAGGGTACTAAAACATTTA  2661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CAGATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAGGTGCAGGGTACTAAAACATTTA  2886

Query 2662  AAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGAAACTGAACATGGATCAGGTACT  2735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGAAACTGAACATGGATCAGGTACT  2960

Query 2736  AGACCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACGCCCAATGCAGCAGGTGGACACTC  2809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  AGACCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACGCCCAATGCAGCAGGTGGACACTC  3034

Query 2810  TAACTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTATTATCCATGAATTCAGTAACCCT  2883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TAACTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTATTATCCATGAATTCAGTAACCCT  3108

Query 2884  CCCAATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCAAACATCAATCAAGAGCTCATTAA  2957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CCCAATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCAAACATCAATCAAGAGCTCATTAA  3182

Query 2958  ATATGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATACCCCAAGTACCCCTGGGGGAGAG  3031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  ATATGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATACCCCAAGTACCCCTGGGGGAGAG  3256

Query 3032  AAATCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTTCTGACTTCCCTTGGCTGAGGTCA  3105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  AAATCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTTCTGACTTCCCTTGGCTGAGGTCA  3330

Query 3106  TTACGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGATGAAGAAAGCACTATCTATGCTCC  3179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  TTACGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGATGAAGAAAGCACTATCTATGCTCC  3404

Query 3180  TAGAAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGAGGAAATTTCAGAGATGCGTCAGA  3253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  TAGAAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGAGGAAATTTCAGAGATGCGTCAGA  3478

Query 3254  TGAAGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTGATGTCAATGGAGAGCCAGTTGAA  3327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  TGAAGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTGATGTCAATGGAGAGCCAGTTGAA  3552

Query 3328  GATGACTACATT  3339
            ||||||||||||
Sbjct 3553  GATGACTACATT  3564