Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09225
• Subject: NM_001159736.1
• Aligned Length: 1857
• Identities: 1454
• Gaps: 402

Alignment

Query    1  ATGGCGGCAGCTCCGCCGCTTTCCAAGGCCGAGTATCTGAAGCGTTACTTGTCCGGGGCAGATGCCGGCGTCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCAGCTCCGCCGCTTTCCAAGGCCGAGTATCTGAAGCGTTACTTGTCCGGGGCAGATGCCGGCGTCGA  74

Query   75  CCGGGGATCTGAGTCCGGTCGCAAGCGTCGCAAAAAGCGGCCGAAGCCTGGCGGGGCCGGCGGCAAGGGAATGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGGGATCTGAGTCCGGTCGCAAGCGTCGCAAAAAGCGGCCGAAGCCTGGCGGGGCCGGCGGCAAGGGAATGC  148

Query  149  GGATTGTGGATGATGATGTGAGCTGGACAGCTATCTCCACAACCAAACTAGAAAAGGAGGAAGAGGAAGATGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGATTGTGGATGATGATGTGAGCTGGACAGCTATCTCCACAACCAAACTAGAAAAGGAGGAAGAGGAAGATGAT  222

Query  223  GGAGATTTGCCTGTGGTGGCAGAGTTTGTGGATGAGCGGCCAGAAGAGGTAAAGCAGATGGAGGCCTTTCGTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAGATTTGCCTGTGGTGGCAGAGTTTGTGGATGAGCGGCCAGAAGAGGTAAAGCAGATGGAGGCCTTTCGTTC  296

Query  297  CAGTGCCAAATGGAAGCTTCTGGGAGGCCACAACGAAGACCTACCCTCAAACAGACATTTTCGTCACGATACCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGTGCCAAATGGAAGCTTCTGGGAGGCCACAACGAAGACCTACCCTCAAACAGACATTTTCGTCACGATACCC  370

Query  371  CGGATTCATCTCCTAGGAGGGTCCGTCATGGTACCCCAGATCCATCTCCTAGGAAGGACCGTCATGACACCCCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGATTCATCTCCTAGGAGGGTCCGTCATGGTACCCCAGATCCATCTCCTAGGAAGGACCGTCATGACACCCCG  444

Query  445  GATCCATCTCCTAGGAGGGCCCGTCATGACACCCCAGATCCTTCTCCCCTCAGAGGGGCTCGTCATGACTCAGA  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATCCATCTCCTAGGAGGGCCCGTCATGACACCCCGGATCCTTCTCCCCTCAGAGGGGCTCGTCATGACTCAGA  518

Query  519  CACATCTCCTCCCAGGAGGATCCGTCATGACTCCTCAGACACTTCACCCCCAAGGAGGGCCCGTCATGATTCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACATCTCCTCCCAGGAGGATCCGTCATGACTCCTCAGACACTTCACCCCCAAGGAGGGCCCGTCATGATTCTC  592

Query  593  CAGATCCTTCTCCCCCAAGGAGGCCTCAGCATAATTCTTCAGGTGCATCTCCTAGGAGAGTCCGTCATGATTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct  593  CAGATCCTTCTCCCCCAAGGAGGCCTCAGCATAATTCTTC----------------------------------  632

Query  667  CCAGATCCCTCTCCTCCTAGGCGAGCCCGTCATGGTTCCTCAGATATCTCTTCCCCCAGAAGGGTCCATAACAA  740
                                                                                      
Sbjct  633  --------------------------------------------------------------------------  632

Query  741  CTCCCCTGACACATCTAGGAGGACTCTTGGCTCTTCAGACACACAGCAACTCAGAAGGGCCCGTCATGACTCCC  814
                                                                                      
Sbjct  633  --------------------------------------------------------------------------  632

Query  815  CTGATTTGGCTCCTAATGTCACTTATTCCCTGCCCAGAACCAAAAGTGGTAAAGCCCCAGAAAGAGCCTCTAGC  888
                                                                                      
Sbjct  633  --------------------------------------------------------------------------  632

Query  889  AAGACTTCTCCACATTGGAAGGAGTCAGGAGCCTCCCATTTGTCATTCCCAAAGAACAGCAAATATGAGTATGA  962
                                                                                      
Sbjct  633  --------------------------------------------------------------------------  632

Query  963  CCCTGACATCTCTCCTCCACGAAAAAAGCAAGCAAAATCCCATTTTGGAGACAAGAAGCAGCTTGATTCCAAAG  1036
                                                                                    ||
Sbjct  633  ------------------------------------------------------------------------AG  634

Query 1037  GTGACTGCCAGAAAGCAACTGATTCAGACCTTTCTTCTCCACGGCATAAACAAAGTCCAGGGCACCAGGATTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  635  GTGACTGCCAGAAAGCAACTGATTCAGACCTTTCTTCTCCACGGCATAAACAAAGTCCAGGGCACCAGGATTCT  708

Query 1111  GATTCAGATCTGTCACCTCCACGGAATAGACCTAGACACCGGAGCTCTGATTCTGACCTCTCTCCACCAAGGAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  GATTCAGATCTGTCACCTCCACGGAATAGACCTAGACACCGGAGCTCTGATTCTGACCTCTCTCCACCAAGGAG  782

Query 1185  GAGACAGAGGACCAAATCTTCTGATTCTGACCTGTCCCCGCCTCGAAGGAGTCAGCCTCCTGGAAAGAAGGCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  GAGACAGAGGACCAAATCTTCTGATTCTGACCTGTCCCCGCCTCGAAGGAGTCAGCCTCCTGGAAAGAAGGCTG  856

Query 1259  CACACATGTATTCTGGGGCTAAAACTGGGTTGGTGTTAACTGACATACAGCGAGAACAGCAGGAGCTCAAGGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  857  CACACATGTATTCTGGGGCTAAAACTGGGTTGGTGTTAACTGACATACAGCGAGAACAGCAGGAGCTCAAGGAA  930

Query 1333  CAGGATCAAGAAACCATGGCATTTGAAGCTGAATTTCAATATGCTGAAACCGTATTTCGAGATAAGTCTGGTCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  931  CAGGATCAAGAAACCATGGCATTTGAAGCTGAATTTCAATATGCTGAAACCGTATTTCGAGATAAGTCTGGTCG  1004

Query 1407  TAAGAGGAATTTGAAACTCGAACGTTTAGAGCAAAGGAGGAAAGCAGAAAAGGACTCAGAGAGAGATGAGCTGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005  TAAGAGGAATTTGAAACTCGAACGTTTAGAGCAAAGGAGGAAAGCAGAAAAGGACTCAGAGAGAGATGAGCTGT  1078

Query 1481  ATGCCCAGTGGGGAAAAGGGCTTGCCCAGAGCCGGCAACAGCAACAAAATGTGGAGGATGCAATGAAAGAGATG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079  ATGCCCAGTGGGGAAAAGGGCTTGCCCAGAGCCGGCAACAGCAACAAAATGTGGAGGATGCAATGAAAGAGATG  1152

Query 1555  CAAAAGCCTCTGGCCCGCTATATTGATGACGAAGATCTGGATAGGATGCTAAGAGAACAGGAAAGAGAGGGGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153  CAAAAGCCTCTGGCCCGCTATATTGATGACGAAGATCTGGATAGGATGCTAAGAGAACAGGAAAGAGAGGGGGA  1226

Query 1629  CCCTATGGCCAACTTCATCAAGAAGAATAAGGCCAAGGAGAACAAGAATAAAAAAGTGAGACCTCGCTACAGTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227  CCCTATGGCCAACTTCATCAAGAAGAATAAGGCCAAGGAGAACAAGAATAAAAAAGTGAGACCTCGCTACAGTG  1300

Query 1703  GTCCAGCACCTCCTCCCAACAGATTTAATATCTGGCCTGGATATCGCTGGGACGGAGTGGACAGATCCAATGGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301  GTCCAGCACCTCCTCCCAACAGATTTAATATCTGGCCTGGATATCGCTGGGACGGAGTGGACAGATCCAATGGA  1374

Query 1777  TTTGAACAGAAGCGCTTTGCCAGGCTTGCCAGCAAGAAGGCAGTGGAGGAACTTGCCTACAAATGGAGTGTTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375  TTTGAACAGAAGCGCTTTGCCAGGCTTGCCAGCAAGAAGGCAGTGGAGGAACTTGCCTACAAATGGAGTGTTGA  1448

Query 1851  GGATATG  1857
            |||||||
Sbjct 1449  GGATATG  1455