Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09229
Subject:
NM_001278236.1
Aligned Length:
565
Identities:
533
Gaps:
32

Alignment

Query   1  MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPPPPSPPSDPAQKPPP  74
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Sbjct   1  MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPPPPSPPSDPAQKPPP  74

Query  75  RGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLLACGVLWFSGYGHIWSQNATNLVSSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLL  148
           |||||||||||||||||||||||                                |||||||||||||||||||
Sbjct  75  RGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFL--------------------------------LEPTAWLDSGTWGVPSLLL  116

Query 149  VFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPEDRRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMD  222
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Sbjct 117  VFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPEDRRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMD  190

Query 223  IKPEADPTSLTVKSMGLQERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALD  296
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Sbjct 191  IKPEADPTSLTVKSMGLQERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALD  264

Query 297  PFLLQAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIRGYGGEEKVYI  370
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Sbjct 265  PFLLQAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIRGYGGEEKVYI  338

Query 371  ATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYDGVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKS  444
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Sbjct 339  ATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYDGVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKS  412

Query 445  GTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEEAAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQ  518
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Sbjct 413  GTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEEAAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQ  486

Query 519  EGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE  565
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Sbjct 487  EGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE  533