Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09257
• Subject: XM_011520426.3
• Aligned Length: 1096
• Identities: 856
• Gaps: 221

Alignment

Query    1  ATGGCTTCTGGAATCCTGGTTAATGTAAAGGAGGAGGTGACCTGCCCCATCTGCCTGGAACTCCTGACACAACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCTGGAATCCTGGTTAATGTAAAGGAGGAGGTGACCTGCCCCATCTGCCTGGAACTCCTGACACAACC  74

Query   75  CCTGAGCCTGGACTGCGGCCACAGCTTCTGCCAAGCATGCCTCACTGCAAACCACAAGAAGTCCATGCTAGACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGAGCCTGGACTGCGGCCACAGCTTCTGCCAAGCATGCCTCACTGCAAACCACAAGAAGTCCATGCTAGACA  148

Query  149  AAGGAGAGAGTAGCTGCCCTGTGTGCCGGATCAGTTACCAGCCTGAGAACATACGGCCTAATCGGCATGTAGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGGAGAGAGTAGCTGCCCTGTGTGCCGGATCAGTTACCAGCCTGAGAACATACGGCCTAATCGGCATGTAGCC  222

Query  223  AACATAGTGGAGAAGCTCAGGGAGGTCAAGTTGAGCCCAGAGGGGCAGAAAGTTGATCATTGTGCACGCCATGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACATAGTGGAGAAGCTCAGGGAGGTCAAGTTGAGCCCAGAGGGGCAGAAAGTTGATCATTGTGCACGCCATGG  296

Query  297  AGAGAAACTTCTACTCTTCTGTCAGGAGGACGGGAAGGTCATTTGCTGGCTTTGTGAGCGGTCTCAGGAGCACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGAAACTTCTACTCTTCTGTCAGGAGGACGGGAAGGTCATTTGCTGGCTTTGTGAGCGGTCTCAGGAGCACC  370

Query  371  GTGGTCACCACACGTTCCTCACAGAGGAGGTTGCCCGGGAGTACCAAGTGAAGCTCCAGGCAGCTCTGGAGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGGTCACCACACGTTCCTCACAGAGGAGGTTGCCCGGGAGTACCAAGTGAAGCTCCAGGCAGCTCTGGAGATG  444

Query  445  CTGAGGCAGAAGCAGCAGGAAGCTGAAGAGTTGGAAGCTGACATCAGAGAAGAGAAAGCTTCCTGGAAGACTCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAGGCAGAAGCAGCAGGAAGCTGAAGAGTTAGAAGCTGACATCAGAGAAGAGAAAGCTTCCTGGAAGACTCA  518

Query  519  AATACAGTATGACAAAACCAACGTCTTGGCAGATTTTGAGCAACTGAGAGACATCCTGGACTGGGAGGAGAGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATACAGTATGACAAAACCAACGTCTTGGCAGATTTTGAGCAACTGAGAGACATCCTGGACTGGGAGGAGAGCA  592

Query  593  ATGAGCTGCAAAACCTGGAGAAGGAGGAGGAAGACATTCTGAAAAGCCTTACGAACTCTGAAACTGAGATGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAGCTGCAAAACCTGGAGAAGGAGGAGGAAGACATTCTGAAAAGCCTTACGAACTCTGAAACTGAGATGGTG  666

Query  667  CAGCAGACCCAGTCCCTGAGAGAGCTCATCTCAGATCTGGAGCATCGGCTGCAGGGGTCAGTGATGGAGCTGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCAGACCCAGTCCCTGAGAGAGCTCATCTCAGATCTGGAGCATCGGCTGCAGGGGTCAGTGATGGAGCTGCT  740

Query  741  TCAGGGTGTGGATGGCGTCATAAAAAGGACGGAGAACGTGACCTTGAAGAAGCCAGAAACTTTTCCAAAAAATC  814
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  741  TCAGGGTGTGGATGGCGTCATAAAA-------------------------------------------------  765

Query  815  AAAGGAGAGTGTTTCGAGCTCCTGATCTGAAAGGAATGCTAGAAGTGTTTAGAGAGCTGACAGATGTCCGACGC  888
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  ----------------------------------------------------AGAGCTGACAGATGTCCGACGC  787

Query  889  TACTGGGG-TAAGGAGAAGTCACATTATCATAAGCCACCCTGCGGCTTATCATTATTATTATCTTTATCTTTTA  961
            |||||||| |  ||||                        |||                               
Sbjct  788  TACTGGGGCT--GGAG------------------------TGC-------------------------------  804

Query  962  GAATTTTATGTTCTCTATTAGGCTCA-TG----------TTTTAAGATTTATG--ATTCTCCTTCC-AAGACAC  1021
             |||...|.|.||||     ||.||| ||          .|.|.|||||.|.|  ||||||||.|| .||.|.|
Sbjct  805  -AATGGCACGATCTC-----GGTTCACTGCAACCTCCACCTCTCAGATTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTC  872

Query 1022  ACA--TAAC-----TTAC-----CCCTCCTTA----------------------------  1041
            .||  ||.|     ||||     |||.||  |                            
Sbjct  873  CCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACC--ACCACCCCTGGCTAAATTTGTATTTTCAG  930