Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09268
- Subject:
- XM_017013929.1
- Aligned Length:
- 1512
- Identities:
- 1155
- Gaps:
- 357
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCTCAGCGAAAAGTTCTTTAGAGGGACGATATCCTTTATACAATCGTATAATTTTATATGTTCACTTTGT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAGATTACACACACAGACGGTGACCAGCGATGATCCAGGCGTCTCGGTCGTTAGCGGGTATCCTGGGGGCTGTC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TCCCTGACCACGACCCCCCAGTGGGGTTTCTTTCCGAGGGTCCCGCCCCTCGCAGCTGCTCTTTGATAAAGGGC 222
Query 1 ----------------------------------------------------------------ATGGGGTGCG 10
||||||||||
Sbjct 223 GGAGGAACGGGGCTGGCTGCTTCCCGAGTCCCCAGGTCCCGCGAGCGGCGGGCGTGTTGCGGGTATGGGGTGCG 296
Query 11 GCGCCAGCAGGAAGGTGGTCCCGGGGCCACCAGCGCTGGCTTGGGCCAAGCACGAAGGTCAAAACCAAGCCGGC 84
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCGCCAGCAGGAAGGTGGTCCCGGGGCCACCAGCGCTGGCTTGGGCCAAGCACGAAGGTCAAAACCAAGCCGGC 370
Query 85 GTCGGAGGCGCGGGGCCTGGGCCCGAGGCGGCGGCCCAGGCGGCGCAGAGGATACAGGTGGCTCGCTTCCGAGC 158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTCGGAGGCGCGGGGCCTGGGCCCGAGGCGGCGGCCCAGGCGGCGCAGAGGATACAGGTGGCTCGCTTCCGAGC 444
Query 159 CAAGTTCGACCCCCGGGTCCTTGCC------------------------------------------------- 183
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAAGTTCGACCCCCGGGTCCTTGCCAGGGAGTTCAGAGGATGGGAAAAAAGAGAGCAGGAGCAGCAGCAAACAA 518
Query 184 ----------------------AGATATGACATCAAAGCTCTTATTGGGACAGGCAGTTTCAGCAGGGTTGTCA 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGGAAGGAATTCCTATCTTCGGAGATATGACATCAAAGCTCTTATTGGGACAGGCAGTTTCAGCAGGGTTGTCA 592
Query 236 GGGTAGAGCAGAAGACCACCAAGAAACCTTTTGCAATAAAAGTGATGGAAACCAGAGAGAGGGAAGGTAGAGAA 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGTAGAGCAGAAGACCACCAAGAAACCTTTTGCAATAAAAGTGATGGAAACCAGAGAGAGGGAAGGTAGAGAA 666
Query 310 GCGTGCGTGTCTGAGCTGAGCGTCCTGCGGCGGGTTAGCCATCGTTACATTGTCCAGCTCATGGAGATCTTTGA 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCGTGCGTGTCTGAGCTGAGCGTCCTGCGGCGGGTTAGCCATCGTTACATTGTCCAGCTCATGGAGATCTTTGA 740
Query 384 GACTGAGGATCAAGTTTACATGGTAATGGAGCTGGCTACCGGAGGGGAGCTCTTTGATCGACTCATTGCTCAGG 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GACTGAGGATCAAGTTTACATGGTAATGGAGCTGGCTACCGGAGGGGAGCTCTTTGATCGACTCATTGCTCAGG 814
Query 458 GATCCTTTACAGAGCGGGATGCCGTCAGGATCCTCCAGATGGTTGCTGATGGGATTAGGTATTTGCATGCGCTG 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GATCCTTTACAGAGCGGGATGCCGTCAGGATCCTCCAGATGGTTGCTGATGGGATTAGGTATTTGCATGCGCTG 888
Query 532 CAGATAACTCATAGGAATCTAAAGCCTGAAAACCTCTTATACTATCATCCAGGTGAAGAGTCGAAAATTTTAAT 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAGATAACTCATAGGAATCTAAAGCCTGAAAACCTCTTATACTATCATCCAGGTGAAGAGTCGAAAATTTTAAT 962
Query 606 TACAGATTTTGGTTTGGCATACTCCGGGAAAAAAAGTGGTGACTGGACAATGAAGACACTCTGTGGGACCCCAG 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TACAGATTTTGGTTTGGCATACTCCGGGAAAAAAAGTGGTGACTGGACAATGAAGACACTCTGTGGGACCCCAG 1036
Query 680 AGTACATAGCTCCTGAGGTTTTGCTAAGGAAGCCTTATACCAGTGCAGTGGACATGTGGGCTCTTGGTGTGATC 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGTACATAGCTCCTGAGGTTTTGCTAAGGAAGCCTTATACCAGTGCAGTGGACATGTGGGCTCTTGGTGTGATC 1110
Query 754 ACATATGCTTTACTTAGCGGATTCCTGCCTTTTGATGATGAAAGCCAGACAAGGCTTTACAGGAAGATTCTGAA 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACATATGCTTTACTTAGCGGATTCCTGCCTTTTGATGATGAAAGCCAGACAAGGCTTTACAGGAAGATTCTGAA 1184
Query 828 AGGCAAATATAATTATACAGGAGAGCCTTGGCCAAGCATTTCCCACTTGGCGAAGGACTTTATAGACAAACTAC 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGGCAAATATAATTATACAGGAGAGCCTTGGCCAAGCATTTCCCACTTGGCGAAGGACTTTATAGACAAACTAC 1258
Query 902 TGATTTTGGAGGCTGGTCATCGCATGTCAGCTGGCCAGGCCCTGGACCATCCCTGGGTGATCACCATGGCTGCA 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGATTTTGGAGGCTGGTCATCGCATGTCAGCTGGCCAGGCCCTGGACCATCCCTGGGTGATCACCATGGCTGCA 1332
Query 976 GGGTCTTCCATGAAGAATCTCCAGAGGGCCATATCCCGAAACCTCATGCAGAGGGCCTCTCCCCACTCTCAGAG 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGGTCTTCCATGAAGAATCTCCAGAGGGCCATATCCCGAAACCTCATGCAGAGGGCCTCTCCCCACTCTCAGAG 1406
Query 1050 TCCTGGATCTGCACAGTCTTCTAAGTCACATTATTCTCACAAATCCAGGCATATGTGGAGCAAGAGAAACTTAA 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCCTGGATCTGCACAGTCTTCTAAGTCACATTATTCTCACAAATCCAGGCATATGTGGAGCAAGAGAAACTTAA 1480
Query 1124 GGATAGTAGAATCGCCACTGTCTGCGCTTTTG 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGATAGTAGAATCGCCACTGTCTGCGCTTTTG 1512