Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09276
• Subject: NM_001111111.1
• Aligned Length: 1876
• Identities: 1586
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGCCGGGCGTC---------CCCGGTGCCCCCGCAGCGCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCT  65
            |||||.||.||.||||.|         |||.|.||.|||||.||...||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGGACCTGGCGCCCCCTGCGATCCCTGCGCGCCCGCCGCTGTCTGGAAGCGCCACATCGTGCGGCAGCT  74

Query   66  GCGGCTTCGGGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGGTGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGG  139
            |||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct   75  GCGGCATCGGGACCGCACGCAAAAGGCGCTCTTCCTGGAGCTAGTGCCGGCTTATAACCATCTCCTAGAGAAGG  148

Query  140  CTGAGCTGCTGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCAAACAGTGTCACTC-CCACCACCCACCAGGG  212
            ||||.|||||.|.||||||||||.|.|||.||.||.|.||.|||||...||.|| || |||||...||..|||.
Sbjct  149  CTGAACTGCTAGCCAAGTTCTCAGAAAAGTTGAAGTCCGAACCAAAGGATGCCA-TCTCCACCCGACATGAGGA  221

Query  213  CCCCTGGGAGGAG---TCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACTGGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGG  283
            |....||||||||   ||||.|...|.|.|.|||||||||.||||||..|.|.|.||||||||||||||||||.
Sbjct  222  CTGGAGGGAGGAGGTCTCAGGGACAGGCCCTGACCAAGTCTCATCACCAGCCTCTCTGAGGGTGAAGTGGCAGC  295

Query  284  AGGAGGAGGAGGGGCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGC  357
            |||||.||.|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||.|||||.|.|
Sbjct  296  AGGAGAAGAAGGGGCTGCAGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGAAGAAGAGCGCAGCCCTAGAC  369

Query  358  ACGCTGGAGTCGGAGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGA  431
            ||.|||.||||..|||||.||.||.||||...||||.|||.|||||||.|||||.||||||.||||||.|..||
Sbjct  370  ACCCTGCAGTCACAGCTGGAGGAGCGGCAGGACAGGTTGGAAGCCCTGCAGGCCTGCGTGGTGCAGCTACAGGA  443

Query  432  GGCGCGGGCGCAGCAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGG  505
            |||||||||.||||||.|||.||||.|||||||..|||..|||.||||.||.|..|||.|.|.||||||.|||.
Sbjct  444  GGCGCGGGCTCAGCAGTCCCGGCAGCTGGAGGAACGGCAAGCGGAGAACGCAGCACAGAGAGAAGCCTATGAGA  517

Query  506  CGCTGCGCGCGCACGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAG  579
            ||||||.|..|||.|..|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct  518  CGCTGCTCCAGCAAGCTGTGCACCAGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCACGCGACTTGCTGGAG  591

Query  580  AGGCTCGTGCAGCGCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCA  653
            ..|||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||..|.|||.|||||||.||
Sbjct  592  CAGCTTGTGCAGCGTAAGGCGCGCGCCGCCGCTGAGCGCAATCTACGTAATGAGCGTAGAGAGAGGGCCAACCA  665

Query  654  GGCGCGGGTGTCCCAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAG  727
            |||.|.|||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||..|||..||||.||||
Sbjct  666  GGCTCTGGTGTCCCAGGAGCTGAAGAAAGCGGCTAAGCGGACTGTGAGCATCAGCGAGATCCCAAACACTCTAG  739

Query  728  GCGATTGGATGAGGGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTG------AGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAA  795
            ..|||.|||    .||.||||  ||||||.|||||||.||.||||      .|||.|||..|...||||..||.
Sbjct  740  AAGATGGGA----CGAAAGAA--GAGACTGTGGCTCTAGCTCCTGCCGCTCTGCCTGAGTTCTCAGAGAGTGAG  807

Query  796  GCTTGTGAGAAGTGGAAGAGGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGT  869
            .|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct  808  ACTTGTGAAAAATGGAAGAGGCCTTTCAGGTCTGCCTCGGCCACCTCCCTGACACTGTCCCGCTGTGTGGATGT  881

Query  870  GGTGAAGGGGCTTCTGGATTTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGA  943
            ||||||||||||..||||.||.|||||.||.|||||||||||..|||||||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  882  GGTGAAGGGGCTGTTGGACTTCAAGAAAAGAAGAGGTCACTCGGTTGGGGGCGCACCTGAGCAGCGGTACCAAA  955

Query  944  TCATCCCTGTGTGTGTGGCTGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTC  1017
            .||||||||||||||||.||||||.|.||||..|||.||||||||||||..||||||||||.||||||||||||
Sbjct  956  GCATCCCTGTGTGTGTGTCTGCCCAAATTCCCTCCCAGGCTCAGGATGTCTTGGATGCCCATCTCTCTGAGGTC  1029

Query 1018  AATGCTGTTCGTTTTGGCCCCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAA  1091
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1030  AATGCTGTTTGTTTTGGCCCCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGGCTGATCCACCTCTGGAA  1103

Query 1092  TGTTGTGGGAAGTCGCCTGGAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTG  1165
            ||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1104  TGTTGTAGGAGGTCGCCTGGAGGCCAACCAGACCCTGGAAGGAGCTGGCGGCAGCATCACCAGTGTGGATTTTG  1177

Query 1166  ACCCCTCGGGCTACCAGGTTTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAG  1239
            |||||||.||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||
Sbjct 1178  ACCCCTCAGGCTCCCAGGTTTTGGCAGCTACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGAGAGACTCAG  1251

Query 1240  TCCAAGGAGACACTGTCTGGACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGT  1313
            ||||||||.|||.||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1252  TCCAAGGAAACATTGTCCGGACACAAGGACAAAGTGACTGCTGCCAAATTCAAGCTAACAAGGCACCAGGCAGT  1325

Query 1314  GACTGGGAGCCGCGACCGGACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCC  1387
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1326  GACTGGGAGCCGAGACCGGACAGTGAAGGAGTGGGACCTGGGCCGCGCCTACTGTTCCAGGACTATCAATGTAC  1399

Query 1388  TTTCCTACTGTAATGACGTGGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTC  1461
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1400  TTTCCTACTGCAATGACGTGGTGTGCGGGGACCACATCATCATCAGTGGCCACAATGACCAAAAGATCCGGTTC  1473

Query 1462  TGGGACAGCAGGGGGCCCCACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCA  1535
            ||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||..|||||||.|
Sbjct 1474  TGGGACAGCAGGGGCCCTCACTGCATCCAGGTCATCCCCGTGCAGGGCCGGGTTACCTCCCTGCACCTCAGCTA  1547

Query 1536  CGACCAACTGCACCTGCTCAGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCC  1609
            .|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||.||||
Sbjct 1548  TGACCAGCTGCATCTGCTTAGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTTATCGACCTGCGAATCAGCAATATCC  1621

Query 1610  GCCAGGTGTTCAGGGCCGATGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGC  1683
            |.||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1622  GACAGGTGTTCAGGGCAGATGGCTTCAAGTGCAGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCTGACAGAAGC  1695

Query 1684  TATGCACTGGCAGGCTCCTGTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACT  1757
            |||||||||||||||||.|...|.||.|.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 1696  TATGCACTGGCAGGCTCTTCAAACGGCGACCTGTACATCTGGGATGTGAACACCGGGAAACTGGAGACCAGCCT  1769

Query 1758  ACAGGGACCCCATTGCGCTGCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCACATGGTGAGCGTGGACC  1831
            ||||||||||||.|||.||||.||.||.||||||||.|||||||.||||||||.||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 1770  ACAGGGACCCCACTGCACTGCTGTTAATGCCGTGGCTTGGTGCTTCTCCGGGAACCACGTTGTGAGTGTGGACC  1843

Query 1832  AGGGCAGGAAGGTTGTGCTCTGGCAG  1857
            |.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1844  AAGGCAGGAAGGTGGTGCTCTGGCAC  1869