Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09276
- Subject:
- XM_005274376.5
- Aligned Length:
- 1859
- Identities:
- 1800
- Gaps:
- 49
Alignment
Query 1 ATGGCGGGGCCGGGCGTCCCCGGTGCCCCCGCAGCGCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGCGGCTTCG 74
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Sbjct 1 ATGGCGGGGCCGGGCGTCCCCGGTGCCCCCGCAGCGCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGCGGCTTCG 74
Query 75 GGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGGTGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCTGAGCTGC 148
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Sbjct 75 GGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGGTGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCTGAGCTGC 148
Query 149 TGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCAAACAGTGTCACTCCCACCACCCACCAGGGCCCCTGGGAG 222
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Sbjct 149 TGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCAAACAGTGTCACTCCCACCACCCACCAGGGCCCCTGGGAG 222
Query 223 GAGTCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACTGGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAGGAGGAGGAGGG 296
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Sbjct 223 GAGTCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACTGGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAGGAGGAGGAGGG 296
Query 297 GCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGG 370
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Sbjct 297 GCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGG 370
Query 371 AGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAG 444
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Sbjct 371 AGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAG 444
Query 445 CAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCA 518
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Sbjct 445 CAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCA 518
Query 519 CGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGC 592
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Sbjct 519 CGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGC 592
Query 593 GCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCC 666
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Sbjct 593 GCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCC 666
Query 667 CAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGCGATTGGATGAG 740
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Sbjct 667 CAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGCGATGGGATGAG 740
Query 741 GGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTGAGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGCTTGTGAGAAGTGGAAGA 814
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Sbjct 741 GGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTGAGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGCTTGTGAGAAGTGGAAGA 814
Query 815 GGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGTGGTGAAGGGGCTTCTGGAT 888
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Sbjct 815 GGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGTGGTGAAGGGGCTTCTGGAT 888
Query 889 TTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGC 962
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Sbjct 889 TTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGC 962
Query 963 TGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCC 1036
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Sbjct 963 TGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCC 1036
Query 1037 CCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTG 1110
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Sbjct 1037 CCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTG 1110
Query 1111 GAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGT 1184
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Sbjct 1111 GAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGT 1184
Query 1185 TTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTG 1258
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Sbjct 1185 TTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTG 1258
Query 1259 GACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGG 1332
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Sbjct 1259 GACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGG 1332
Query 1333 ACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTTTCCTACTGTAATGACGT 1406
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Sbjct 1333 ACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTTTCCTACTGTAATGACGT 1406
Query 1407 GGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTGGGACAGCAGGGGGCCCC 1480
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Sbjct 1407 GGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTGGGACAGCAGGGGGCCCC 1480
Query 1481 ACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTC 1554
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Sbjct 1481 ACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTC 1554
Query 1555 AGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGA 1628
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Sbjct 1555 AGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGA 1628
Query 1629 TGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCT 1702
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Sbjct 1629 TGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCT 1702
Query 1703 GTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTGCGCT 1776
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Sbjct 1703 GTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTG---- 1772
Query 1777 GCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCA--CATGGTGAGCGTGGACCAGGGCAGGAAGGTTGTG 1848
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Sbjct 1773 ---GT----------ACCTGAATCT-CTC------TCATCCATG--GAGTGT-CACCA-----------TTTTC 1812
Query 1849 CTCTGGCAG 1857
Sbjct 1813 --------- 1812