Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09276
• Subject: XM_006508226.3
• Aligned Length: 1948
• Identities: 1530
• Gaps: 161

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2
                                                                                    ||
Sbjct    1  ATGGAGTCCCCGGGAGGCTCCGCCCCCCTGCTCGGGCTGGAGCTTTGCGCGGCCGCTAGGGACTCGGCGGCCAT  74

Query    3  GGCGGGGCCGGGCGTC---------CCCGGTGCCCCCGCAGCGCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGC  67
            |||.||.||.||||.|         |||.|.||.|||||.||...||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCAGGACCTGGCGCCCCCTGCGATCCCTGCGCGCCCGCCGCTGTCTGGAAGCGCCACATCGTGCGGCAGCTGC  148

Query   68  GGCTTCGGGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGGTGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCT  141
            |||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  149  GGCATCGGGACCGCACGCAAAAGGCGCTCTTCCTGGAGCTAGTGCCGGCTTATAACCATCTCCTAGAGAAGGCT  222

Query  142  GAGCTGCTGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCAAACAGTGTCACTC-CCACCACCCACCAGGGCC  214
            ||.|||||.|.||||||||||.|.|||.||.||.|.||.|||||...||.|| || |||||...||..|||.|.
Sbjct  223  GAACTGCTAGCCAAGTTCTCAGAAAAGTTGAAGTCCGAACCAAAGGATGCCA-TCTCCACCCGACATGAGGACT  295

Query  215  CCTGGGAGGAG---TCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACTGGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAG  285
            ...||||||||   ||||.|...|.|.|.|||||||||.||||||..|.|.|.||||||||||||||||||.||
Sbjct  296  GGAGGGAGGAGGTCTCAGGGACAGGCCCTGACCAAGTCTCATCACCAGCCTCTCTGAGGGTGAAGTGGCAGCAG  369

Query  286  GAGGAGGAGGGGCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCAC  359
            |||.||.|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||.|||||.|.|||
Sbjct  370  GAGAAGAAGGGGCTGCAGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGAAGAAGAGCGCAGCCCTAGACAC  443

Query  360  GCTGGAGTCGGAGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGG  433
            .|||.||||..|||||.||.||.||||...||||.|||.|||||||.|||||.||||||.||||||.|..||||
Sbjct  444  CCTGCAGTCACAGCTGGAGGAGCGGCAGGACAGGTTGGAAGCCCTGCAGGCCTGCGTGGTGCAGCTACAGGAGG  517

Query  434  CGCGGGCGCAGCAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCG  507
            |||||||.||||||.|||.||||.|||||||..|||..|||.||||.||.|..|||.|.|.||||||.|||.||
Sbjct  518  CGCGGGCTCAGCAGTCCCGGCAGCTGGAGGAACGGCAAGCGGAGAACGCAGCACAGAGAGAAGCCTATGAGACG  591

Query  508  CTGCGCGCGCACGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAG  581
            ||||.|..|||.|..|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||..
Sbjct  592  CTGCTCCAGCAAGCTGTGCACCAGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCACGCGACTTGCTGGAGCA  665

Query  582  GCTCGTGCAGCGCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGG  655
            |||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||..|.|||.|||||||.||||
Sbjct  666  GCTTGTGCAGCGTAAGGCGCGCGCCGCCGCTGAGCGCAATCTACGTAATGAGCGTAGAGAGAGGGCCAACCAGG  739

Query  656  CGCGGGTGTCCCAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGC  729
            |.|.|||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||..|||..||||.||||..
Sbjct  740  CTCTGGTGTCCCAGGAGCTGAAGAAAGCGGCTAAGCGGACTGTGAGCATCAGCGAGATCCCAAACACTCTAGAA  813

Query  730  GATTGGATGAGGGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTG------AGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGC  797
            |||.|||    .||.||||  ||||||.|||||||.||.||||      .|||.|||..|...||||..||..|
Sbjct  814  GATGGGA----CGAAAGAA--GAGACTGTGGCTCTAGCTCCTGCCGCTCTGCCTGAGTTCTCAGAGAGTGAGAC  881

Query  798  TTGTGAGAAGTGGAAGAGGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGTGG  871
            ||||||.||.|||||||||||.||||                                                
Sbjct  882  TTGTGAAAAATGGAAGAGGCCTTTCA------------------------------------------------  907

Query  872  TGAAGGGGCTTCTGGATTTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATC  945
                   |||||        |||||.||.|||||||||||..|||||||.||.|||||||||||.|||||.|.|
Sbjct  908  -------GCTTC--------AAGAAAAGAAGAGGTCACTCGGTTGGGGGCGCACCTGAGCAGCGGTACCAAAGC  966

Query  946  ATCCCTGTGTGTGTGGCTGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAA  1019
            |||||||||||||||.||||||.|.||||..|||.||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  967  ATCCCTGTGTGTGTGTCTGCCCAAATTCCCTCCCAGGCTCAGGATGTCTTGGATGCCCATCTCTCTGAGGTCAA  1040

Query 1020  TGCTGTTCGTTTTGGCCCCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATG  1093
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1041  TGCTGTTTGTTTTGGCCCCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGGCTGATCCACCTCTGGAATG  1114

Query 1094  TTGTGGGAAGTCGCCTGGAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGAC  1167
            ||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1115  TTGTAGGAGGTCGCCTGGAGGCCAACCAGACCCTGGAAGGAGCTGGCGGCAGCATCACCAGTGTGGATTTTGAC  1188

Query 1168  CCCTCGGGCTACCAGGTTTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTC  1241
            |||||.||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||
Sbjct 1189  CCCTCAGGCTCCCAGGTTTTGGCAGCTACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGAGAGACTCAGTC  1262

Query 1242  CAAGGAGACACTGTCTGGACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGA  1315
            ||||||.|||.||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1263  CAAGGAAACATTGTCCGGACACAAGGACAAAGTGACTGCTGCCAAATTCAAGCTAACAAGGCACCAGGCAGTGA  1336

Query 1316  CTGGGAGCCGCGACCGGACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTT  1389
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1337  CTGGGAGCCGAGACCGGACAGTGAAGGAGTGGGACCTGGGCCGCGCCTACTGTTCCAGGACTATCAATGTACTT  1410

Query 1390  TCCTACTGTAATGACGTGGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTG  1463
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1411  TCCTACTGCAATGACGTGGTGTGCGGGGACCACATCATCATCAGTGGCCACAATGACCAAAAGATCCGGTTCTG  1484

Query 1464  GGACAGCAGGGGGCCCCACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACG  1537
            ||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||..|||||||.|.|
Sbjct 1485  GGACAGCAGGGGCCCTCACTGCATCCAGGTCATCCCCGTGCAGGGCCGGGTTACCTCCCTGCACCTCAGCTATG  1558

Query 1538  ACCAACTGCACCTGCTCAGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGC  1611
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||.
Sbjct 1559  ACCAGCTGCATCTGCTTAGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTTATCGACCTGCGAATCAGCAATATCCGA  1632

Query 1612  CAGGTGTTCAGGGCCGATGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTA  1685
            ||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1633  CAGGTGTTCAGGGCAGATGGCTTCAAGTGCAGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCTGACAGAAGCTA  1706

Query 1686  TGCACTGGCAGGCTCCTGTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTAC  1759
            |||||||||||||||.|...|.||.|.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1707  TGCACTGGCAGGCTCTTCAAACGGCGACCTGTACATCTGGGATGTGAACACCGGGAAACTGGAGACCAGCCTAC  1780

Query 1760  AGGGACCCCATTGCGCTGCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCACATGGTGAGCGTGGACCAG  1833
            ||||||||||.|||.||||.||.||.||||||||.|||||||.||||||||.||||.|.|||||.||||||||.
Sbjct 1781  AGGGACCCCACTGCACTGCTGTTAATGCCGTGGCTTGGTGCTTCTCCGGGAACCACGTTGTGAGTGTGGACCAA  1854

Query 1834  GGCAGGAAGGTTGTGCTCTGGCAG  1857
            |||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1855  GGCAGGAAGGTGGTGCTCTGGCAC  1878