Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09276
• Subject: XM_011545333.1
• Aligned Length: 1857
• Identities: 1538
• Gaps: 318

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGCCGGGCGTCCCCGGTGCCCCCGCAGCGCGCTGGAAACGCCACATCGTGCGGCAGCTGCGGCTTCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACCGTACGCAAAAGGCGCTTTTCCTGGAGCTGGTGCCGGCCTATAACCATCTCTTAGAGAAGGCTGAGCTGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGACAAGTTCTCAAAGAAGCTGCAGCCGGAGCCAAACAGTGTCACTCCCACCACCCACCAGGGCCCCTGGGAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGTCAGAGCTTGACTCAGACCAAGTCCCATCACTGGTCGCACTGAGGGTGAAGTGGCAGGAGGAGGAGGAGGG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GCTCCGGCTGGTCTGTGGTGAGATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGG  370
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------ATGGCCTACCAGGTGGTGGAGAAGGGCGCGGCCCTGGGCACGCTGGAGTCGG  52

Query  371  AGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   53  AGCTGCAGCAGAGGCAAAGCAGGCTGGCAGCCCTGGAGGCCCGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGGCGCGGGCGCAG  126

Query  445  CAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127  CAGGCCCAGCAGGTGGAGGAGTGGCGGGCGCAGAATGCGGTGCAGCGGGCAGCCTACGAGGCGCTGCGCGCGCA  200

Query  519  CGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  CGTCGGGCTCCGGGAGGCGGCACTGCGCAGGCTCCAGGAAGAGGCGCGCGACCTGCTGGAGAGGCTCGTGCAGC  274

Query  593  GCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  GCAAGGCGCGCGCCGCGGCCGAGCGCAACCTGCGCAACGAGCGCCGGGAGCGGGCCAAGCAGGCGCGGGTGTCC  348

Query  667  CAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGCGATTGGATGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  349  CAGGAGCTGAAGAAGGCTGCCAAGCGGACCGTGAGCATCAGCGAGGGCCCGGACACCCTAGGCGATGGGATGAG  422

Query  741  GGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTGAGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGCTTGTGAGAAGTGGAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  GGAGAGAAGGGAGACTCTGGCTCTGGCCCCTGAGCCAGAGCCCCTGGAGAAGGAAGCTTGTGAGAAGTGGAAGA  496

Query  815  GGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGTGGTGAAGGGGCTTCTGGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  GGCCCTTCAGGTCTGCCTCAGCCACCTCCCTGACGCTGTCCCACTGTGTGGATGTGGTGAAGGGGCTTCTGGAT  570

Query  889  TTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  TTTAAGAAGAGGAGAGGTCACTCAATTGGGGGAGCCCCTGAGCAGCGATACCAGATCATCCCTGTGTGTGTGGC  644

Query  963  TGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  TGCCCGACTTCCTACCCGGGCTCAGGATGTGCTGGATGCCCACCTCTCTGAGGTCAATGCTGTTCGTTTTGGCC  718

Query 1037  CCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  CCAACAGCAGCCTCCTGGCCACTGGAGGGGCTGACCGCCTGATCCACCTCTGGAATGTTGTGGGAAGTCGCCTG  792

Query 1111  GAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  GAGGCCAACCAGACCCTGGAGGGAGCTGGTGGCAGCATCACCAGTGTGGACTTTGACCCCTCGGGCTACCAGGT  866

Query 1185  TTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  TTTAGCAGCAACTTACAACCAGGCTGCCCAGCTCTGGAAGGTGGGGGAGGCACAGTCCAAGGAGACACTGTCTG  940

Query 1259  GACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  GACACAAGGATAAGGTGACAGCTGCCAAATTCAAGCTAACGAGGCACCAGGCAGTGACTGGGAGCCGCGACCGG  1014

Query 1333  ACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTTTCCTACTGTAATGACGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  ACAGTGAAGGAGTGGGACCTCGGCCGTGCCTATTGCTCCAGGACCATCAATGTCCTTTCCTACTGTAATGACGT  1088

Query 1407  GGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTGGGACAGCAGGGGGCCCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  GGTGTGTGGGGACCATATCATCATTAGTGGCCACAATGACCAGAAGATCCGGTTCTGGGACAGCAGGGGGCCCC  1162

Query 1481  ACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  ACTGCACCCAGGTCATCCCTGTGCAGGGCCGGGTCACCTCCCTGAGCCTCAGCCACGACCAACTGCACCTGCTC  1236

Query 1555  AGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  AGCTGTTCCCGAGACAACACACTCAAGGTCATCGACCTGCGTGTCAGCAACATCCGCCAGGTGTTCAGGGCCGA  1310

Query 1629  TGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  TGGCTTCAAGTGTGGTTCTGACTGGACCAAAGCTGTGTTCAGCCCGGACAGAAGCTATGCACTGGCAGGCTCCT  1384

Query 1703  GTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTGCGCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  GTGATGGGGCCCTTTACATCTGGGATGTGGACACCGGGAAACTGGAGAGCAGACTACAGGGACCCCATTGCGCT  1458

Query 1777  GCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCACATGGTGAGCGTGGACCAGGGCAGGAAGGTTGTGCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  GCCGTCAACGCCGTGGCCTGGTGCTACTCCGGGAGCCACATGGTGAGCGTGGACCAGGGCAGGAAGGTTGTGCT  1532

Query 1851  CTGGCAG  1857
            |||||||
Sbjct 1533  CTGGCAG  1539