Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09284
Subject:
NM_054093.3
Aligned Length:
3212
Identities:
2764
Gaps:
10

Alignment

Query    1  ATGTTCACCCTGTCTCAGACCTCGAGAGCATGGTTCATCGATAGAGCCCGTCAGGCACGAGAAGAAAGGCTTGT  74
            ||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGTTCACTGTATCTCAGACCTCCAGAGCATGGTTCATCGACAGAGCCCGGCAGGCACGAGAAGAGAGGCTGGT  74

Query   75  GCAGAAGGAACGGGAGCGGGCAGCTGTTGTGATCCAGGCCCATGTCCGGAGTTTTCTCTGTCGGAGTCGACTGC  148
            |||||||||.||||||||..||||.||...|||||||||||..|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  GCAGAAGGAGCGGGAGCGCTCAGCGGTGACGATCCAGGCCCTAGTCCGCAGTTTCCTCTGCCGGAGGCGACTGC  148

Query  149  AGAGAGATATCAGGAGAGAGATTGATGACTTTTTTAAAGCAGATGACCCTGAGTCCACTAAAAGAAGTGCACTT  222
            |.|||||.|||||||.||||||||||||.|||||||..||.|||||..|||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAGAGACATCAGGAAAGAGATTGATGAGTTTTTTAGTGCTGATGAGTCTGGGTCCAGTAAAAGAAGTGCACTT  222

Query  223  TGTATTTTCAAGATTGCCAGGAAACTGCTGTTCCTATTCAGAATCAAAGAGGATAATGAGAGATTTGAGAAGTT  296
            ||||||||.|||||||||||||.|||||||||..|||.||.||..|..|||||.|..||||||.|.||||||||
Sbjct  223  TGTATTTTTAAGATTGCCAGGAGACTGCTGTTTATATGCAAAACTACCGAGGACAGCGAGAGACTGGAGAAGTT  296

Query  297  GTGTCGCAGCATCCTGAGCAGCATGGATGCTGAGAATGAGCCTAAGGTGTGGTATGTGTCCCTGGCTTGTTCTA  370
            ||||||.||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||...||.|
Sbjct  297  GTGTCGAAGCATCCTGAACAGCATGGATGCCGAGAATGAGCCAAAGGTGTGGTACGTGTCCCTGGCTCTCTCCA  370

Query  371  AGGACCTCACCCTCCTTTGGATTCAACAGATCAAGAACATTTTGTGGTACTGCTGTGATTTTCTCAAGCAGCTC  444
            ||||||||||.||.||.||||||.|.||||||||||.|||..|||||.||||||||||..||||...|||||||
Sbjct  371  AGGACCTCACGCTGCTGTGGATTAAGCAGATCAAGAGCATCCTGTGGCACTGCTGTGAGCTTCTGGGGCAGCTC  444

Query  445  AAGCCTGAAATCCTGCAGGACTCCCGACTCATCACCCTGTACCTCACGATGCTTGTCACCTTCACAGACACTTC  518
            |||||.||.|||.|.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCCAGAGATCTTACAGGACTCCAGGCTCATCACGCTGTACCTCACCATGCTTGTGACCTTCACAGACACTTC  518

Query  519  AACGTGGAAAATTCTTCGGGGAAAAGGTGAAAGTCTTCGACCAGCGATGAACCACATTTGTGCAAATATAATGG  592
            |||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  AACATGGAAGATTCTCCGGGGAAAAGGTGAGAGCCTTCGGCCAGCCCTGAACCACATTTGCGCAAATATAATGG  592

Query  593  GACATCTCAACCAGCATGGATTTTATTCTGTGCTGCAGATATTGTTAACCCGTGGCCTGGCAAGACCCCGTCCT  666
            |.|||||||||||||.||||.||||.|||||..|||||.||.||.|.|||||.||||||||.||.|||||.||.
Sbjct  593  GCCATCTCAACCAGCGTGGACTTTACTCTGTATTGCAGGTACTGCTGACCCGAGGCCTGGCCAGGCCCCGGCCC  666

Query  667  TGTCTATCCAAAGGCACTTTAACAGCAGCTTTTTCTCTAGCGTTACGCCCTGTGATTGCTGCACAGTTCTCAGA  740
            |||||.||||||||||..|||||||||||.||.|||||.||..|.|||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  667  TGTCTGTCCAAAGGCATGTTAACAGCAGCCTTCTCTCTGGCCCTGCGCCCTGTGGTTGCTGCGCAGTTCTCAGA  740

Query  741  CAATCTGATTCGGCCGTTCCTCATCCACATCATGTCTGTGCCTGCTCTGGTGACTCATCTCAGCACAGTGACCC  814
            ||||||.||.||.||.|||.||||||||.|||||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||.|||.|||
Sbjct  741  CAATCTTATGCGACCATTCATCATCCACGTCATGTCGGTACCTGCTCTCGTGGCTCATCTCAGCACCGTGGCCC  814

Query  815  CTGAGCGCCTCACTGTTTTAGAATCCCATGACATGCTTCGTAAATTCATCATATTTTTAAGAGACCAAGATCGA  888
            |||||||||||...||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||..|.|||||...|||.|||
Sbjct  815  CTGAGCGCCTCGGCGTTTTAGAGTCCCATGACATGCTTCGTAAATTCATCGTCTTCCTGAGAGATAGAGACCGA  888

Query  889  TGCCGTGATGTATGTGAAAGTTTAGAAGGATGCCATACGCTTTGTCTAATGGGCAACCTCCTACACTTGGGCTC  962
            |||||.||||..|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  889  TGCCGCGATGCTTGTGAGAGTTTAGAAGGCTGCCATACCCTGTGTCTCATGGGCAATCTCCTGCACTTGGGCTC  962

Query  963  CCTCAGCCCCAGAGTGTTAGAGGAGGAGACAGATGGGTTCGTGAGTTTGCTCACCCAGACGCTGTGCTACTGTC  1036
            ||||||||.|||..||||||||||.||||..||||||||.|||||...||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct  963  CCTCAGCCTCAGGCTGTTAGAGGAAGAGATGGATGGGTTTGTGAGCGCGCTCACGCAGATGCTGTGCTACTGTC  1036

Query 1037  AGAAGTATGTGTCTCAGAAGAAGTCCAACCTGACCCACTGGCATCCTGTCCTTGGCTGGTTCTCCCAATCTGTG  1110
            |||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||.|||||
Sbjct 1037  AGAAGTACGTGGCTCAGAAGAAGTCCAACCTGACCCACTGGCACCCTGTGCTCGGCTGGTTTTCCCAACCTGTG  1110

Query 1111  GATTATGGCCTTAACGAGTCAATGCACTTGATCACCAAACAGCTGCAGTTCTTGTGGGGGGTGCCTCTGATCCG  1184
            |||||.|||||.||.||.||.|||.||.||||||||||.||||||||||||.||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 1111  GATTACGGCCTCAATGATTCCATGTACCTGATCACCAAGCAGCTGCAGTTCCTGTGGGCGGTGCCTCTCATCCG  1184

Query 1185  GATCTTCTTCTGTGACATCCTGAGCAAGAAGCTACTGGAG-AGCCAGGAGCCAGCCCACG-------CACAGCC  1250
            .||..|||||.|||||||||||||||.||||||.|||||| |..|| |||||.|||| ||       |.|||||
Sbjct 1185  CATTCTCTTCAGTGACATCCTGAGCAGGAAGCTGCTGGAGCATGCA-GAGCCGGCCC-CGGTGCAACCGCAGCC  1256

Query 1251  AGCATCCCCTCAGAATGTGCTCCCAGTGAAGAGTCTCCTAAAGCGTGCTTTTCAAAAGTCGGCATCAGTCCGGA  1324
            ..|.||.||.||||..||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 1257  GTCCTCACCGCAGACGGTGCTCCCCGTGAAGAGCCTCCTCAAGCGTGCGTTTCAGAAGTCGGCTTCGGTTCGGA  1330

Query 1325  ATATTCTCAGGCCTGTCGGGGGTAAACGGGTCGACTCTGCAGAAGTCCAGAAGGTTTGCAACATCTGTGTCCTC  1398
            |.||.|||||||||||.|||||....||.||||||||.||.||.||.|.||||||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 1331  ACATCCTCAGGCCTGTTGGGGGCCGCCGTGTCGACTCCGCTGAGGTGCGGAAGGTCTGCAACATTTGCGTGCTC  1404

Query 1399  TACCAGACCTCGCTGACAACTCTCACACAGATTCGGCTGCAGATACTCACAGGTCTCACTTACCTTGATGACCT  1472
            |||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1405  TACCAGACCTCGCTGACGACCCTCACCCAGATCCGCCTGCAGATCCTCACAGGTCTTACGTACCTGGATGACCT  1478

Query 1473  GCTTCCCAAACTGTGGGCATTTATCTGTGAGCTCGGGCCCCACGGAGGGTTAAAGCTCTTCTTGGAATGCCTGA  1546
            |||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||.||||.|||||||
Sbjct 1479  GCTGCCCAAGCTCTGGGCGTTTATCTGTGAGCTGGGGCCCCACGGCGGGCTCAAGCTCTTCCTGGAGTGCCTGA  1552

Query 1547  ACAATGACACTGAAGAGTCCAAGCAACTCTTGGCCATGCTGATGCTGTTCTGTGACTGTTCGCGGCACCTCATC  1620
            ||||||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1553  ACAATGACACTGGAGAGTCCAAGCAGCTCCTGGCCATGCTGATGCTCTTCTGTGACTGTTCCCGGCACCTCATC  1626

Query 1621  ACAATCCTTGATGACATTGAAGTTTATGAAGAACAGATTTCATTCAAACTGGAAGAGCTGGTCACTATCTCCTC  1694
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1627  ACCATCCTCGATGACATTGAAGTTTATGAAGAACAGATCTCCTTCAAGCTGGAAGAGCTGGTCACCATCTCCTC  1700

Query 1695  TTTCCTGAATTCTTTTGTGTTTAAGATGATCTGGGATGGAATTGTAGAGAACGCCAAGGGTGAGACCTTGGAGC  1768
            .|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701  GTTCCTCAATTCCTTCGTGTTTAAGATGATCTGGGACGGAATTGTAGAGAATGCCAAGGGTGAGACCTTGGAGC  1774

Query 1769  TGTTCCAGTCTGTCCACGGGTGGCTTATGGTGCTGTACGAGCGGGACTGCCGGCGGCGCTTCACCCCCGAGGAC  1842
            ||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||..|.||.||||||
Sbjct 1775  TGTTCCAGTCCGTCCATGGCTGGCTGATGGTGCTGTATGAGCGAGACTGCCGCCGGCGCTTTGCTCCGGAGGAC  1848

Query 1843  CACTGGCTGCGAAAGGATCTCAAACCTAGCGTGCTCTTCCAAGAACTCGACAGGGACAGAAAACGGGCACAGTT  1916
            ||||||||.||.|.|||.|||||.|||.|.|||||||||||.||.|||||||.||||.|||...||||.|||.|
Sbjct 1849  CACTGGCTACGGAGGGACCTCAAGCCTGGTGTGCTCTTCCAGGAGCTCGACAAGGACCGAAGGAGGGCTCAGCT  1922

Query 1917  GATCCTGCAGTACATCCCACATGTCATCCCTCACAAAAACAGAGTTCTACTGTTTCGAACCATGGTTACCAAGG  1990
            |.||||||||.|||||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|.||||||||.|||||
Sbjct 1923  GGTCCTGCAGCACATCCCCCACGTCGTGCCTCACAAGAACAGAGTTCTTCTGTTCCGGAACATGGTTATCAAGG  1996

Query 1991  AGAAGGAGAAACTGGGGCTGGTGGAAACCAGCTCTGCCTCCCCGCATGTCACTCACATCACCATCCGCCGGTCC  2064
            ||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||..|||||
Sbjct 1997  AGAAAGAGAAGCTGGGGCTTGTGGAGACCAGCTCTGCCTCTCCTCACGTCACCCACATCACCATCCGAAGGTCC  2070

Query 2065  AGGATGCTGGAGGACGGCTACGAGCAGCTTAGGCAGCTCTCCCAGCACGCCATGAAGGGGGTCATCCGTGTGAA  2138
            .|||||.||||||||||||||||.|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 2071  CGGATGTTGGAGGACGGCTACGAACAGCTCCGGCAGCTTTCCCAGCATGCCATGAAGGGTGTGATCCGAGTGAA  2144

Query 2139  GTTTGTCAATGACCTCGGGGTGGACGAAGCAGGGATTGATCAAGACGGTGTTTTTAAGGAGTTCTTGGAAGAGA  2212
            |||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||..|||||||||
Sbjct 2145  GTTTGTCAACGACCTCGGGGTGGACGAGGCTGGGATTGACCAGGATGGTGTCTTCAAGGAGTTTCTGGAAGAGA  2218

Query 2213  TCATCAAGAGAGTTTTTGACCCAGCACTCAATCTGTTCAAGACAACCAGTGGGGATGAGAGGCTGTACCCCTCA  2286
            ||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 2219  TCATCAAGAGGGTGTTTGACCCCGCACTCAACCTGTTCAAGACAACCAGCGGGGATGAGCGGCTGTACCCATCA  2292

Query 2287  CCCACATCCTACATCCATGAGAATTACCTGCAGCTCTTCGAGTTTGTGGGGAAGATGCTGGGGAAGGCTGTGTA  2360
            |||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2293  CCCACGTCCTACATTCACGAGAATTACCTGCAGCTCTTCGAGTTTGTGGGGAAGATGCTGGGAAAGGCAGTGTA  2366

Query 2361  TGAGGGAATTGTGGTGGACGTGCCATTTGCATCCTTCTTCCTGAGCCAACTGCTTGGGCACCACCACAGCGTCT  2434
            ||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2367  TGAGGGGATCGTGGTAGATGTGCCCTTTGCCTCCTTCTTCCTGAGCCAGATGCTCGGGCACCACCACAGCGTCT  2440

Query 2435  TCTATAGCTCGGTGGATGAACTGCCTTCTCTGGACTCCGAGTTCTATAAAAACCTCACCTCCATCAAGCGCTAT  2508
            ||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2441  TCTACAGCTCCGTGGATGAGCTTCCCTCCCTGGACTCGGAGTTTTATAAAAACCTCACCTCCATCAAGCGCTAC  2514

Query 2509  GATGGGGACATCACTGACCTGGGCCTGACGCTGTCTTACGACGAGGACGTCATGGGTCAGCTTGTTTGCCATGA  2582
            |||||.||||||.|.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 2515  GATGGAGACATCGCAGACCTCGGGCTGACGCTGTCTTACGATGAAGACGTCATGGGTCAGCTCGTCTGCCACGA  2588

Query 2583  ACTGATTCCTGGAGGGAAGACCATTCCTGTTACAAATGAAAATAAAATTAGCTACATCCATCTGATGGCACATT  2656
            ||||.||||.||||||||||||||.||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2589  ACTGGTTCCCGGAGGGAAGACCATCCCGGTTACAGATGAGAACAAAATTAGCTACATCCATCTGATGGCGCATT  2662

Query 2657  TTCGAATGCACACTCAAATAAAAAACCAAACAGCTGCCCTCATTAGCGGATTCCGTTCCATTATCAAACCCGAG  2730
            |.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2663  TCCGAATGCACACTCAAATTAAAAACCAGACAGCTGCTCTTATCAGTGGCTTCCGTTCCATCATCAAGCCCGAG  2736

Query 2731  TGGATCCGAATGTTCTCAACTCCTGAACTGCAGCGTCTCATCTCTGGCGACAATGCTGAGATTGATCTGGAAGA  2804
            |||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2737  TGGATCCGAATGTTCTCTACCCCTGAGCTTCAGCGCCTCATCTCCGGGGACAACGCTGAGATAGATCTGGAAGA  2810

Query 2805  TTTAAAGAAGCACACAGTCTACTACGGTGGTTTCCATGGAAGTCACAGAGTCATCATCTGGCTCTGGGATATTC  2878
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2811  CTTAAAGAAGCACACAGTGTACTACGGTGGCTTTCATGGGAGCCACAGGGTCATCATCTGGCTCTGGGATATCC  2884

Query 2879  TGGCCTCCGACTTCACACCGGATGAGAGAGCTATGTTTCTGAAGTTCGTGACCAGCTGCTCCAGACCCCCGCTC  2952
            ||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 2885  TGGCTTCCGACTTCACGCCTGAAGAAAGAGCCATGTTCCTGAAGTTTGTGACCAGCTGCTCCCGGCCCCCGCTC  2958

Query 2953  CTGGGATTCGCCTACCTCAAGCCTCCATTCTCCATCCGCTGCGTGGAGGTGTCGGACGATCAGGACACCGGGGA  3026
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2959  CTAGGATTCGCCTACCTCAAGCCTCCGTTCTCCATCCGCTGTGTGGAAGTATCAGATGACCAGGACACTGGGGA  3032

Query 3027  CACTCTGGGCAGCGTCCTCCGGGGCTTCTTCACCATCCGCAAGCGGGAGCCAGGCGGCCGCCTGCCCACCTCCT  3100
            .||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||.||||||||.||.|
Sbjct 3033  TACCCTGGGCAGCGTCCTCAGGGGCTTCTTCACCATCCGCAAGAGGGAGCCAGGGGGGCGTCTGCCCACATCTT  3106

Query 3101  CCACCTGCTTCAACCTGCTCAAGCTGCCCAACTACAGCAAGAAGAGCGTCCTCCGCGAGAAGCTGCGCTACGCC  3174
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 3107  CCACTTGCTTCAACCTGCTTAAGCTGCCCAACTACAGCAAGAAGAGCGTACTGCGAGAGAAACTACGCTATGCC  3180

Query 3175  ATCAGCATGAACACGGGCTTTGAACTCTCC  3204
            |||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 3181  ATCAGCATGAACACGGGCTTTGAGCTCTCC  3210