Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09321
- Subject:
- XM_011527480.1
- Aligned Length:
- 3186
- Identities:
- 3012
- Gaps:
- 174
Alignment
Query 1 ATGCTACGAACCGCAGGCAGGGACGGCCTCTGTCGCCTGTCCACCTACTTGGAAGAACTCGAGGCTGTGGAACT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTACGAACCGCAGGCAGGGACGGCCTCTGTCGCCTGTCCACCTACTTGGAAGAACTCGAGGCTGTGGAACT 74
Query 75 GAAGAAGTTCAAGTTATACCTGGGGACCGCGACAGAGCTGGGAGAAGGCAAGATCCCCTGGGGAAGCATGGAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGAAGTTCAAGTTATACCTGGGGACCGCGACAGAGCTGGGAGAAGGCAAGATCCCCTGGGGAAGCATGGAGA 148
Query 149 AGGCCGGTCCCCTGGAAATGGCCCAGCTGCTCATCACCCACTTCGGGCCAGAGGAGGCCTGGAGGTTGGCTCTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGCCGGTCCCCTGGAAATGGCCCAGCTGCTCATCACCCACTTCGGGCCAGAGGAGGCCTGGAGGTTGGCTCTC 222
Query 223 AGCACCTTTGAGCGGATAAACAGGAAGGACCTGTGGGAGAGAGGACAGAGAGAGGACCTGGTGAGGGATACCCC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGCACCTTTGAGCGGATAAACAGGAAGGACCTGTGGGAGAGAGGACAGAGAGAGGACCTGGTGAGGGATACCCC 296
Query 297 ACCTGGTGGCCCGTCCTCACTTGGGAACCAGTCAACATGCCTTCTGGAAGTCTCTCTTGTCACTCCAAGAAAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACCTGGTGGCCCGTCCTCACTTGGGAACCAGTCAACATGCCTTCTGGAAGTCTCTCTTGTCACTCCAAGAAAAG 370
Query 371 ATCCCCAGGAAACCTACAGGGACTATGTCCGCAGGAAATTCCGGCTCATGGAAGACCGCAATGCGCGCCTAGGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCCCCAGGAAACCTACAGGGACTATGTCCGCAGGAAATTCCGGCTCATGGAAGACCGCAATGCGCGCCTAGGG 444
Query 445 GAATGTGTCAACCTCAGCCACCGGTACACCCGGCTCCTGCTGGTGAAGGAGCACTCAAACCCCATGCAGGTCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAATGTGTCAACCTCAGCCACCGGTACACCCGGCTCCTGCTGGTGAAGGAGCACTCAAACCCCATGCAGGTCCA 518
Query 519 GCAGCAGCTTCTGGACACAGGCCGGGGACACGCGAGGACCGTGGGACACCAGGCTAGCCCCATCAAGATAGAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCAGCAGCTTCTGGACACAGGCCGGGGACACGCGAGGACCGTGGGACACCAGGCTAGCCCCATCAAGATAGAGA 592
Query 593 CCCTCTTTGAGCCAGACGAGGAGCGCCCCGAGCCACCGCGCACCGTGGTCATGCAAGGCGCGGCAGGGATAGGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCTCTTTGAGCCAGACGAGGAGCGCCCCGAGCCACCGCGCACCGTGGTCATGCAAGGCGCGGCAGGGATAGGC 666
Query 667 AAGTCCATGCTGGCACACAAGGTGATGCTGGACTGGGCGGACGGGAAGCTCTTCCAAGGCAGATTTGATTATCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGTCCATGCTGGCACACAAGGTGATGCTGGACTGGGCGGACGGGAAGCTCTTCCAAGGCAGATTTGATTATCT 740
Query 741 CTTCTACATCAACTGCAGGGAGATGAACCAGAGTGCCACGGAATGCAGCATGCAAGACCTCATCTTCAGCTGCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTCTACATCAACTGCAGGGAGATGAACCAGAGTGCCACGGAATGCAGCATGCAAGACCTCATCTTCAGCTGCT 814
Query 815 GGCCTGAGCCCAGCGCGCCTCTCCAGGAGCTCATCCGAGTTCCCGAGCGCCTCCTTTTCATCATCGACGGCTTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGCCTGAGCCCAGCGCGCCTCTCCAGGAGCTCATCCGAGTTCCCGAGCGCCTCCTTTTCATCATCGACGGCTTC 888
Query 889 GATGAGCTCAAGCCTTCTTTCCACGATCCTCAGGGACCCTGGTGCCTCTGCTGGGAGGAGAAACGGCCCACGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GATGAGCTCAAGCCTTCTTTCCACGATCCTCAGGGACCCTGGTGCCTCTGCTGGGAGGAGAAACGGCCCACGGA 962
Query 963 GCTGCTTCTTAACAGCTTAATTCGGAAGAAGCTGCTCCCTGAGCTATCTTTGCTCATCACCACACGGCCCACGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTGCTTCTTAACAGCTTAATTCGGAAGAAGCTGCTCCCTGAGCTATCTTTGCTCATCACCACACGGCCCACGG 1036
Query 1037 CTTTGGAGAAGCTCCACCGTCTGCTGGAGCACCCCAGGCATGTGGAGATCCTGGGCTTCTCTGAGGCAGAAAGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTTTGGAGAAGCTCCACCGTCTGCTGGAGCACCCCAGGCATGTGGAGATCCTGGGCTTCTCTGAGGCAGAAAGG 1110
Query 1111 AAGGAATACTTCTACAAGTATTTCCACAATGCAGAGCAGGCGGGCCAAGTCTTCAATTACGTGAGGGACAACGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGGAATACTTCTACAAGTATTTCCACAATGCAGAGCAGGCGGGCCAAGTCTTCAATTACGTGAGGGACAACGA 1184
Query 1185 GCCTCTCTTCACCATGTGCTTCGTCCCCCTGGTGTGCTGGGTGGTGTGTACCTGCCTCCAGCAGCAGCTGGAGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCCTCTCTTCACCATGTGCTTCGTCCCCCTGGTGTGCTGGGTGGTGTGTACCTGCCTCCAGCAGCAGCTGGAGG 1258
Query 1259 GTGGGGGGCTGTTGAGACAGACGTCCAGGACCACCACTGCAGTGTACATGCTCTACCTGCTGAGTCTGATGCAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTGGGGGGCTGTTGAGACAGACGTCCAGGACCACCACTGCAGTGTACATGCTCTACCTGCTGAGTCTGATGCAA 1332
Query 1333 CCCAAGCCGGGGGCCCCGCGCCTCCAGCCCCCACCCAACCAGAGAGGGTTGTGCTCCTTGGCGGCAGATGGGCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCCAAGCCGGGGGCCCCGCGCCTCCAGCCCCCACCCAACCAGAGAGGGTTGTGCTCCTTGGCGGCAGATGGGCT 1406
Query 1407 CTGGAATCAGAAAATCCTATTTGAGGAGCAGGACCTCCGGAAGCACGGCCTAGACGGGGAAGACGTCTCTGCCT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTGGAATCAGAAAATCCTATTTGAGGAGCAGGACCTCCGGAAGCACGGCCTAGACGGGGAAGACGTCTCTGCCT 1480
Query 1481 TCCTCAACATGAACATCTTCCAGAAGGACATCAACTGTGAGAGGTACTACAGCTTCATCCACTTGAGTTTCCAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCTCAACATGAACATCTTCCAGAAGGACATCAACTGTGAGAGGTACTACAGCTTCATCCACTTGAGTTTCCAG 1554
Query 1555 GAATTCTTTGCAGCTATGTACTATATCCTGGACGAGGGGGAGGGCGGGGCAGGCCCAGACCAGGACGTGACCAG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAATTCTTTGCAGCTATGTACTATATCCTGGACGAGGGGGAGGGCGGGGCAGGCCCAGACCAGGACGTGACCAG 1628
Query 1629 GCTGTTGACCGAGTACGCGTTTTCTGAAAGGAGCTTCCTGGCACTCACCAGCCGCTTCCTGTTTGGACTCCTGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCTGTTGACCGAGTACGCGTTTTCTGAAAGGAGCTTCCTGGCACTCACCAGCCGCTTCCTGTTTGGACTCCTGA 1702
Query 1703 ACGAGGAGACCAGGAGCCACCTGGAGAAGAGTCTCTGCTGGAAGGTCTCGCCGCACATCAAGATGGACCTGTTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACGAGGAGACCAGGAGCCACCTGGAGAAGAGTCTCTGCTGGAAGGTCTCGCCGCACATCAAGATGGACCTGTTG 1776
Query 1777 CAGTGGATCCAAAGCAAAGCTCAGAGCGACGGCTCCACCCTGCAGCAGGGCTCCTTGGAGTTCTTCAGCTGCTT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAGTGGATCCAAAGCAAAGCTCAGAGCGACGGCTCCACCCTGCAGCAGGGCTCCTTGGAGTTCTTCAGCTGCTT 1850
Query 1851 GTACGAGATCCAGGAGGAGGAGTTTATCCAGCAGGCCCTGAGCCACTTCCAGGTGATCGTGGTCAGCAACATTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GTACGAGATCCAGGAGGAGGAGTTTATCCAGCAGGCCCTGAGCCACTTCCAGGTGATCGTGGTCAGCAACATTG 1924
Query 1925 CCTCCAAGATGGAGCACATGGTCTCCTCGTTCTGTCTGAAGCGCTGCAGGAGCGCCCAGGTGCTGCACTTGTAT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCTCCAAGATGGAGCACATGGTCTCCTCGTTCTGTCTGAAGCGCTGCAGGAGCGCCCAGGTGCTGCACTTGTAT 1998
Query 1999 GGCGCCACCTACAGCGCGGACGGGGAAGACCGCGCGAGGTGCTCCGCAGGAGCGCACACGCTGTTGGTGCAGCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GGCGCCACCTACAGCGCGGACGGGGAAGACCGCGCGAGGTGCTCCGCAGGAGCGCACACGCTGTTGGTGCAGCT 2072
Query 2073 ---ACCAGAGAGGACCGTTCTGCTGGACGCCTACAGTGAACATCTGGCAGCGGCCCTGTGCACCAATCCAAACC 2143
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CAGACCAGAGAGGACCGTTCTGCTGGACGCCTACAGTGAACATCTGGCAGCGGCCCTGTGCACCAATCCAAACC 2146
Query 2144 TGATAGAGCTGTCTCTGTACCGAAATGCCCTGGGCAGCCGGGGGGTGAAGCTGCTCTGTCAAGGACTCAGACAC 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGATAGAGCTGTCTCTGTACCGAAATGCCCTGGGCAGCCGGGGGGTGAAGCTGCTCTGTCAAGGACTCAGACAC 2220
Query 2218 CCCAACTGCAAACTTCAGAACCTGAGGCTGAAGAGGTGCCGCATCTCCAGCTCAGCCTGCGAGGACCTCTCTGC 2291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCCAACTGCAAACTTCAGAACCTGAGGCTGAAGAGGTGCCGCATCTCCAGCTCAGCCTGCGAGGACCTCTCTGC 2294
Query 2292 AGCTCTCATAGCCAATAAGAATTTGACAAGGATGGATCTCAGTGGCAACGGCGTTGGATTCCCAGGCATGATGC 2365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGCTCTCATAGCCAATAAGAATTTGACAAGGATGGATCTCAGTGGCAACGGCGTTGGATTCCCAGGCATGATGC 2368
Query 2366 TGCTTTGCGAGGGCCTGCGGCATCCCCAGTGCAGGCTGCAGATGATTCAGTTGAGGAAGTGTCAGCTGGAGTCC 2439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGCTTTGCGAGGGCCTGCGGCATCCCCAGTGCAGGCTGCAGATGATTCAGTTGAGGAAGTGTCAGCTGGAGTCC 2442
Query 2440 GGGGCTTGTCAGGAGATGGCTTCTGTGCTCGGCACCAACCCACATCTGGTTGAGTTGGACCTGACAGGAAATGC 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GGGGCTTGTCAGGAGATGGCTTCTGTGCTCGGCACCAACCCACATCTGGTTGAGTTGGACCTGACAGGAAATGC 2516
Query 2514 ACTGGAGGATTTGGGCCTGAGGTTACTATGCCAGGGACTGAGGCACCCAGTCTGCAGACTACGGACTTTGTGGC 2587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 ACTGGAGGATTTGGGCCTGAGGTTACTATGCCAGGGACTGAGGCACCCAGTCTGCAGACTACGGACTTTGTGGC 2590
Query 2588 TGAAGATCTGCCGCCTCACTGCTGCTGCCTGTGACGAGCTGGCCTCAACTCTCAGTGTGAACCAGAGCCTGAGA 2661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TGAAGATCTGCCGCCTCACTGCTGCTGCCTGTGACGAGCTGGCCTCAACTCTCAGTGTGAACCAGAGCCTGAGA 2664
Query 2662 GAGCTGGACCTGAGCCTGAATGAGCTGGGGGACCTCGGGGTGCTGCTGCTGTGTGAGGGCCTCAGGCATCCCAC 2735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GAGCTGGACCTGAGCCTGAATGAGCTGGGGGACCTCGGGGTGCTGCTGCTGTGTGAGGGCCTCAGGCATCCCAC 2738
Query 2736 GTGCAAGCTCCAGACCCTGCGGTTGGGCATCTGCCGGCTGGGCTCTGCCGCCTGTGAGGGTCTTTCTGTGGTGC 2809
||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GTGCAAGCTCCAGACCCTGC------------------------------------------------------ 2758
Query 2810 TCCAGGCCAACCACAACCTCCGGGAGCTGGACTTGAGTTTCAACGACCTGGGAGACTGGGGCCTGTGGTTGCTG 2883
Sbjct 2759 -------------------------------------------------------------------------- 2758
Query 2884 GCTGAGGGGCTGCAACATCCCGCCTGCAGACTCCAGAAACTGTGGCTGGATAGCTGTGGCCTCACAGCCAAGGC 2957
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2759 -------------------------------------------GGCTGGATAGCTGTGGCCTCACAGCCAAGGC 2789
Query 2958 TTGTGAGAATCTTTACTTCACCCTGGGGATCAACCAGACCTTGACCGACCTTTACCTGACCAACAACGCCCTAG 3031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2790 TTGTGAGAATCTTTACTTCACCCTGGGGATCAACCAGACCTTGACCGACCTTTACCTGACCAACAACGCCCTAG 2863
Query 3032 GGGACACAGGTGTCCGACTGCTTTGCAAGCGGCTGAGCCATCCTGGCTGCAAACTCCGAGTCCTCTGGTTATTT 3105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2864 GGGACACAGGTGTCCGACTGCTTTGCAAGCGGCTGAGCCATCCTGGCTGCAAACTCCGAGTCCTCTGGTTATTT 2937
Query 3106 GGGATGGACCTGAATAAAATGACCCACAGTAGGTTGGCAGCGCTTCGAGTAACAAAACCTTATTTGGACATTGG 3179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2938 GGGATGGACCTGAATAAAATGACCCACAGTAGGTTGGCAGCGCTTCGAGTAACAAAACCTTATTTGGACATTGG 3011
Query 3180 CTGC 3183
||||
Sbjct 3012 CTGC 3015