Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09344
• Subject: NM_001172679.2
• Aligned Length: 1224
• Identities: 1220
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCGCCGCCTCTGGCCCCGCTCCCTCCCCGGGACCCAAACGGGGCCGGACCCGAGTGGAGGGAGCCGGGGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCCGCCTCTGGCCCCGCTCCCTCCCCGGGACCCAAACGGGGCCGGACCCGAGTGGAGGGAGCCGGGGGC  74

Query   75  TGTGAGCTTCGCGGACGTGGCCGTGTACTTCTGCCGGGAGGAGTGGGGCTGCTTGCGGCCAGCGCAGAGGGCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGAGCTTCGCGGACGTGGCCGTGTACTTCTGCCGGGAGGAGTGGGGCTGCTTGCGGCCAGCGCAGAGGGCCC  148

Query  149  TGTACCGGGACGTGATGCGGGAGACCTACGGCCACCTGAGCGCTCTCGGAATCGGAGGCAACAAGCCAGCTCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTACCGGGACGTGATGCGGGAGACCTACGGCCACCTGAGCGCTCTCGGAATCGGAGGCAACAAGCCAGCTCTC  222

Query  223  ATCTCCTGGGTGGAGGAGGAGGCCGAACTGTGGGGTCCGGCTGCCCAGGATCCGGAGGTGGCGAAATGTCAGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCTCCTGGGTGGAGGAGGAGGCCGAACTGTGGGGTCCGGCTGCCCAGGATCCGGAGGTGGCGAAATGTCAGAC  296

Query  297  ACAAACGGACCCAGCAGATTCCAGAAACAAGAAAAAGGAAAGACAAAGGGAAGGGACGGGAGCCCTGGAGAAGC  370
            |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAAACGGACC---CAGATTCCAGAAACAAGAAAAAGGAAAGACAAAGGGAAGGGACGGGAGCCCTGGAGAAGC  367

Query  371  CCGACCCTGTGGCCGCCGGGTCTCCTGGGCTGAAGTCTCCCCAAGCCCCCTCGGCCGGGCCCCCTTATGGTTGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  CCGACCCTGTGGCCGCCGGGTCTCCTGGGCTGAAGTCTCCCCAAGCCCCCTCGGCCGGGCCCCCTTATGGTTGG  441

Query  445  GAGCAGCTGTCCAAGGCACCGCACCGGGGACGCCCCTCCCTCTGTGCCCACCCCCCTGTCCCCCGAGCTGACCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  GAGCAGCTGTCCAAGGCACCGCACCGGGGACGCCCCTCCCTCTGTGCCCACCCCCCTGTCCCCCGAGCTGACCA  515

Query  519  GCGTCATGGCTGCTACGTGTGCGGGAAGAGCTTTGCCTGGCGCTCCACACTGGTGGAGCACGTCTACAGTCACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  GCGTCATGGCTGCTACGTGTGCGGGAAGAGCTTTGCCTGGCGCTCCACACTGGTGGAGCACGTCTACAGTCACA  589

Query  593  CTGGCGAGAAGCCCTTCCACTGCACTGACTGCGGCAAGGGCTTCGGCCACGCTTCCTCCCTGAGCAAACACCGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  CTGGCGAGAAGCCCTTCCACTGCACTGACTGCGGCAAGGGCTTCGGCCACGCTTCCTCCCTGAGCAAACACCGG  663

Query  667  GCCATCCATCGTGGGGAGCGGCCCCACCGCTGTCTGGAGTGTGGCCGGGCCTTCACGCAGCGCTCGGCGCTGAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  GCCATCCATCGTGGGGAGCGGCCCCACCGCTGTCTGGAGTGTGGCCGGGCCTTCACGCAGCGCTCGGCGCTGAC  737

Query  741  TTCGCACCTGCGCGTCCACACCGGCGAGAAACCCTATGGCTGCGCCGACTGTGGCCGCCGCTTCAGCCAGAGCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  TTCGCACCTGCGCGTCCACACCGGCGAGAAACCCTATGGCTGCGCCGACTGTGGCCGCCGCTTCAGCCAGAGCT  811

Query  815  CTGCCCTCTACCAGCACCGGCGCGTGCACAGCGGCGAGACCCCCTTCCCCTGCCCGGACTGTGGCCGCGCCTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  CTGCCCTCTACCAGCACCGGCGCGTGCACAGCGGCGAGACCCCCTTCCCCTGCCCGGACTGTGGCCGCGCCTTC  885

Query  889  GCCTACCCCTCGGACCTGCGGCGCCACGTGCGCACCCACACCGGCGAGAAGCCCTACCCGTGCCCGGACTGCGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  GCCTACCCCTCGGACCTGCGGCGCCACGTGCGCACCCACACCGGCGAGAAGCCCTACCCGTGCCCGGACTGCGG  959

Query  963  GCGCTGCTTCCGCCAGAGCTCGGAGATGGCAGTCCACAGGCGCACCCACAGCGGCGAGAAGCCCTACCCCTGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  GCGCTGCTTCCGCCAGAGCTCGGAGATGGCAGCCCACAGGCGCACCCACAGCGGCGAGAAGCCCTACCCCTGCC  1033

Query 1037  CGCAGTGCGGCCGCCGCTTTGGCCAGAAGTCAGCCGTGGCCAAACACCAGTGGGTTCATCGGCCCGGGGCCGGG  1110
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Sbjct 1034  CGCAGTGCGGCCGCCGCTTTGGCCAGAAGTCAGCCGTGGCCAAACACCAGTGGGTTCATCGGCCCGGGGCCGGG  1107

Query 1111  GGCCACAGGGGCCGGGTCGCCGGGCGTCTGTCTGTGACCCTGACCCCTGGCCACGGAGACCTGGACCCGCCCGT  1184
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Sbjct 1108  GGCCACAGGGGCCGGGTCGCCGGGCGTCTGTCTGTGACCCTGACCCCTGGCCACGGAGACCTGGACCCGCCCGT  1181

Query 1185  GGGCTTCCAGCTGTACCCGGAGATATTCCAGGAGTGTGGG  1224
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Sbjct 1182  GGGCTTCCAGCTGTACCCGGAGATATTCCAGGAGTGTGGG  1221