Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09375
• Subject: NM_006001.3
• Aligned Length: 1350
• Identities: 1299
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA  148
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAGATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACCTACAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGAACCTATAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296

Query  297  AGCCAGTAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGCA  370
            .||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATCGTCGACCTGGTCCTGGACCGGATCCGCA  370

Query  371  AACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGGG  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  AACTGGCGGATCTGTGCACGGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGCACTGGCTCTGGG  444

Query  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACAGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACCC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTACCC  518

Query  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTAACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592

Query  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATCGAGCGTCCC  666

Query  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGATGGGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGACGGGGC  740

Query  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTCGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814

Query  815  ACGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCATGAGCAGCTGTCTGTGGCTGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888
            |||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACGCCCCGGTCATCTCAGCCGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888

Query  889  GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCATGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962

Query  963  GGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAATGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACTATCCAGTTTGTGGATT  1036
            |||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  963  GGATGTGGTCCCGAAAGATGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTAGATT  1036

Query 1037  GGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTGCCCAACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACGGTGGTCCCTGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110

Query 1111  GTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGTCCATAAGTT  1184
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1111  GTGCAGCGGGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATCGCGGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCATAAGTT  1184

Query 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGTGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCTG  1258
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGAGAAGGCATGGAGGAGGGGGAGTTCTCTG  1258

Query 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTGTGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCTGAGGCT  1332
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCCGAGGCT  1332

Query 1333  GAAGAAGGCGAAGAATAC  1350
            ||||||||.|||||||||
Sbjct 1333  GAAGAAGGTGAAGAATAC  1350