Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09429
• Subject: NM_028767.2
• Aligned Length: 2059
• Identities: 1771
• Gaps: 68

Alignment

Query    1  ATGATGGTGGAATCTGCCTCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCAGAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGG  74
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct    1  ATGATGGTGGAGTCTGCATCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCGTCTGGTCAGAACGGCGTGGGCAGCCTCTCTGC  74

Query   75  GCAAGCAGATGGCAGCAGCGG---CGGGGCCACAGGGA------CAACTGCAAG------TGGCACGGGCAGGG  133
            |||.||.||||||.||.|.||   ||||.||.|.||.|      |..||||..|      ||.|.|.|||||||
Sbjct   75  GCAGGCTGATGGCGGCGGTGGGGCCGGGACCGCGGGCACGGCCCCGGCTGCCGGTAGGGATGCCTCAGGCAGGG  148

Query  134  AAGTGACCA-CG--GGTGCAGACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCAACAG  204
            |||...||| ||  ||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  AAGCAGCCAGCGGAGGAGCCGACAGCAATGGCGAGATGAGCCCCGCGGAGCTTCTGCACTTCCAACAGCAACAG  222

Query  205  GCTCTCCAAGTGGCCCGGCAGTTCCTGCTGCAGCAGGCCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAA  278
            ||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||..||||||.||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  223  GCTCTCCAGGTGGCCCGGCAGTTCCTGTTGCAGCAAGCCTCCAGCCTGAACTCCCCGGGGAACAATGACAGTAA  296

Query  279  ACAGTCTGCCTCTGCTGTGCAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCAGATGCTTACCCCGCAACAGA  352
            ||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||||
Sbjct  297  ACAGTCGGCCTCTGCGGTGCAGGTGCCTGTGTCTGTGGCCATGATGTCCCAGCAGATGCTTACCCCCCAGCAGA  370

Query  353  TGCAGCAGATCCTGTCGCCCCCGCAGCTGCAGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCA------G  420
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||      |
Sbjct  371  TGCAGCAGATCCTGTCGCCACCTCAGCTGCAGGCCTTGCTGCAGCAGCAACAGGCTCTCATGCTCCAGCAGCTG  444

Query  421  CAGGAGTACTACAAGAAGCAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCA  494
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct  445  CAGGAGTATTACAAGAAGCAGCAAGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGAAAACAGCA  518

Query  495  GCCCAAAGAGGCACTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAGTTGCAGCAGC  568
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  GCCCAAAGAGGCCCTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAGATGCAACAGTTGCAGCAAC  592

Query  569  AGCACCTGCTCAACCTGCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACC  642
            |||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||.||
Sbjct  593  AGCACTTGCTCAACCTCCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCAAGCCAAGCCTCAGGGCCCCTCCAGGCC  666

Query  643  CTTCCGCAAGCAGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGTGCCCCCGGGCAGCCTGC  716
            ||.|||||   |||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  667  CTCCCGCA---AGCCGTGTGCCCGACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAAGGCGAGGGTGCCCCGGGGCAGCCCGC  737

Query  717  CGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCTCACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCC-GCTCCC  789
            .||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|..||||.||.|..||.||||||||||||||| || ||.
Sbjct  738  TGAGGACAGCGGCAGGCAGGAGGGGCTGGACCTCGCCAGCACAGCTGTTACTGCTACCTCGTTTGCCAGC-CCT  810

Query  790  CCCAAGGTCTCACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA  863
            |||||||||||.||.||||||||||||||..||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  CCCAAGGTCTCCCCGCCCCTCTCCCACCACCCCTTACCCAACGGACAACCCACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA  884

Query  864  CAGCTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGGCTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG  937
            ||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  CAGCTCCTCCCATGAGGAGACCCCCAGTTCCCACCCTCTTTATGGACATGGGGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG  958

Query  938  AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTACA  1011
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||.||.
Sbjct  959  AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAACACGCTTTGGATGACCGGAGCACG  1032

Query 1012  GCCCAGTGCCGGGTACAGATGCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGCTCGCCAAGGAGAGCGAGCGGCTGCA  1085
            |||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1033  GCCCAATGCCGCGTGCAGATGCAGGTGGTCCAACAGCTGGAGATCCAGCTGGCCAAGGAGAGTGAGCGGCTGCA  1106

Query 1086  GGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCACTGAACCCGGTCCCCG  1159
            ||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 1107  GGCCATGATGGCACATCTGCACATGCGGCCTTCAGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCA----------------  1164

Query 1160  GCTCCTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCTCTGCAGCAGACTCATTCCCAGATGGTCTCGTGCACCCCCCGACC  1233
                                ||||||||||   |.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1165  --------------------GTGACCGTCT---CCGCAGACCCGTTCCCGGATGGCCTCGTGCACCCCCCAACT  1215

Query 1234  TCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGGCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTCCCTGCATGGTGGGGGCCCAGC  1307
            ||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||..||||..||||||||||.||
Sbjct 1216  TCAGCCGCTGCCCCCGTCACACCCCTGCGTCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTCTTTGCACAGTGGGGGCCCTGC  1289

Query 1308  CCGTCGGAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTGGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGA  1381
            |||..|||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290  CCGCAGGAGAAGTAATGACAAATTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTTGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGA  1363

Query 1382  ACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTCACCTACGCCTCCCTCATCCGCCAGGCCATCCTGGAAACCCCTGACAGGCAG  1455
            ||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||..|||||
Sbjct 1364  ACGCTGACGTCAGGCCCCCCTTCACCTACGCTTCCCTTATCCGCCAGGCCATTCTGGAAACTCCAGATCGGCAG  1437

Query 1456  CTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTATTTCCGCAGAAACACTGCCACCTGGAA  1529
            |||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1438  CTGACGCTAAATGAGATTTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTACTTCCGAAGAAACACGGCCACCTGGAA  1511

Query 1530  GAACGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGCTTCGTCCGCGTGGAGAACGTCAAGGGTGCCGTGTGGA  1603
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1512  GAATGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGTTTCGTCCGTGTGGAGAACGTCAAGGGGGCCGTGTGGA  1585

Query 1604  CTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGCCCCACCCTGGTGAAGAACATG  1677
            |||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1586  CTGTGGATGAGCGGGAATATCAGAAACGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGTCCCACTCTGGTGAAGAACATG  1659

Query 1678  ATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCAGCTACCAGGCCGCCCTGGCCGAGAGCAGCTTCCCCCTCCT  1751
            |||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1660  ATCTCGGGCCTCAGTTACGGGGCACTTAACGCCAGCTACCAGGCTGCCCTGGCAGAGAGCAGCTTCCCTCTTCT  1733

Query 1752  CAACAGCCCTGGCATGCTGAACCCTGGCTCCGCCAGCAGCCTGCTGCCCCTCAGCCACGATGACGTGGGTGCCC  1825
            ||.||.|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||||.||
Sbjct 1734  CAGCAACCCCGGCATGCTGAACCCTGGCTCAGCCAGCAGCCTTCTGCCCCTCAGCCAGGAGGACCTGGGTGTCC  1807

Query 1826  CCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAGCCCTCCTCGCCTCTCCCCGCCCCAGTACAGCCACCAGGTG  1899
            |.|.|||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||.|.
Sbjct 1808  CTGGGGAACCACTACCCAGCAATGGGAGCAGCAGCCCGCCTCGTCTTTCCCCTCCTCAGTACAGCCACCAGATA  1881

Query 1900  CAGGTGAAGGAGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAGACAGGCAGCCCGGGCCTCCCCTGGGCGCCCCTAACCCCAG  1973
            ||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|.|||.|||||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct 1882  CAAGTCAAAGAGGAGCCTGCAGAGGCAGAGGAAGACCGACGGCCGGGGCCTCCCTTGGGCGCCCCCAACCCCAG  1955

Query 1974  CGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGAGCTGCCGGGAGAAGAACTGTCC  2034
            |.|...|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||...|||||.||..|||||
Sbjct 1956  CACTGTGGGGCCTCCAGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGACCTGGGAGGAGAGGACATGTCC  2016