Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09429
• Subject: XM_017317686.2
• Aligned Length: 2080
• Identities: 1808
• Gaps: 50

Alignment

Query    1  ATGATGGTGGAATCTGCCTCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCAGAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGG  74
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct    1  ATGATGGTGGAGTCTGCATCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCGTCTGGTCAGAACGGCGTGGGCAGCCTCTCTGC  74

Query   75  GCAAGCAGATGGCAGCAGCGG---CGGGGCCACAGGGA------CAACTGCAAG------TGGCACGGGCAGGG  133
            |||.||.||||||.||.|.||   ||||.||.|.||.|      |..||||..|      ||.|.|.|||||||
Sbjct   75  GCAGGCTGATGGCGGCGGTGGGGCCGGGACCGCGGGCACGGCCCCGGCTGCCGGTAGGGATGCCTCAGGCAGGG  148

Query  134  AAGTGACCA-CG--GGTGCAGACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCAACAG  204
            |||...||| ||  ||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  AAGCAGCCAGCGGAGGAGCCGACAGCAATGGCGAGATGAGCCCCGCGGAGCTTCTGCACTTCCAACAGCAACAG  222

Query  205  GCTCTCCAAGTGGCCCGGCAGTTCCTGCTGCAGCAGGCCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAA  278
            ||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||..||||||.||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  223  GCTCTCCAGGTGGCCCGGCAGTTCCTGTTGCAGCAAGCCTCCAGCCTGAACTCCCCGGGGAACAATGACAGTAA  296

Query  279  ACAGTCTGCCTCTGCTGTGCAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCAGATGCTTACCCCGCAACAGA  352
            ||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||||
Sbjct  297  ACAGTCGGCCTCTGCGGTGCAGGTGCCTGTGTCTGTGGCCATGATGTCCCAGCAGATGCTTACCCCCCAGCAGA  370

Query  353  TGCAGCAGATCCTGTCGCCCCCGCAGCTGCAGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCA------G  420
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||      |
Sbjct  371  TGCAGCAGATCCTGTCGCCACCTCAGCTGCAGGCCTTGCTGCAGCAGCAACAGGCTCTCATGCTCCAGCAGCTG  444

Query  421  CAGGAGTACTACAAGAAGCAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCA  494
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct  445  CAGGAGTATTACAAGAAGCAGCAAGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGAAAACAGCA  518

Query  495  GCCCAAAGAGGCACTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAGTTGCAGCAGC  568
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  GCCCAAAGAGGCCCTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAGATGCAACAGTTGCAGCAAC  592

Query  569  AGCACCTGCTCAACCTGCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACC  642
            |||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||.||
Sbjct  593  AGCACTTGCTCAACCTCCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCAAGCCAAGCCTCAGGGCCCCTCCAGGCC  666

Query  643  CTTCCGCAAGCAGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGTGCCCCCGGGCAGCCTGC  716
            ||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  667  CTCCCGCAAGCAGCCGTGTGCCCGACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAAGGCGAGGGTGCCCCGGGGCAGCCCGC  740

Query  717  CGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCTCACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCC-GCTCCC  789
            .||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|..||||.||.|..||.||||||||||||||| || ||.
Sbjct  741  TGAGGACAGCGGCAGGCAGGAGGGGCTGGACCTCGCCAGCACAGCTGTTACTGCTACCTCGTTTGCCAGC-CCT  813

Query  790  CCCAAGGTCTCACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA  863
            |||||||||||.||.||||||||||||||..||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CCCAAGGTCTCCCCGCCCCTCTCCCACCACCCCTTACCCAACGGACAACCCACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA  887

Query  864  CAGCTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGGCTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG  937
            ||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CAGCTCCTCCCATGAGGAGACCCCCAGTTCCCACCCTCTTTATGGACATGGGGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG  961

Query  938  AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTACA  1011
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||.||.
Sbjct  962  AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAACACGCTTTGGATGACCGGAGCACG  1035

Query 1012  GCCCAGTGCCGGGTACAGATGCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGCTCGCCAAGGAGAGCGAGCGGCTGCA  1085
            |||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036  GCCCAATGCCGCGTGCAGATGCAGGTGGTCCAACAGCTGGAGATCCAGCTGGCCAAGGAGAGTGAGCGGCTGCA  1109

Query 1086  GGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCA----------------  1143
            ||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 1110  GGCCATGATGGCACATCTGCACATGCGGCCTTCAGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCACACCTACCCCATTGCT  1183

Query 1144  -----CTGAACCCGGTCCCCGGCTCCTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCTCTGCAGCAGACTCATTCCCAGAT  1212
                 ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||   |.||||||.|.|||||.|||
Sbjct 1184  CACAGCTGAACCCAGTCCCTGGCTCCTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCT---CCGCAGACCCGTTCCCGGAT  1254

Query 1213  GGTCTCGTGCACCCCCCGACCTCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGGCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTC  1286
            ||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  GGCCTCGTGCACCCCCCAACTTCAGCCGCTGCCCCCGTCACACCCCTGCGTCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTC  1328

Query 1287  CCTGCATGGTGGGGGCCCAGCCCGTCGGAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTGGCCC  1360
            ..||||..||||||||||.|||||..|||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1329  TTTGCACAGTGGGGGCCCTGCCCGCAGGAGAAGTAATGACAAATTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTTGCCC  1402

Query 1361  AGAATCATGAGTTCTACAAGAACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTCACCTACGCCTCCCTCATCCGCCAGGCCATC  1434
            |||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 1403  AGAATCATGAGTTCTACAAGAACGCTGACGTCAGGCCCCCCTTCACCTACGCTTCCCTTATCCGCCAGGCCATT  1476

Query 1435  CTGGAAACCCCTGACAGGCAGCTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTATTTCCG  1508
            ||||||||.||.||..||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1477  CTGGAAACTCCAGATCGGCAGCTGACGCTAAATGAGATTTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTACTTCCG  1550

Query 1509  CAGAAACACTGCCACCTGGAAGAACGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGCTTCGTCCGCGTGGAGA  1582
            .||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1551  AAGAAACACGGCCACCTGGAAGAATGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGTTTCGTCCGTGTGGAGA  1624

Query 1583  ACGTCAAGGGTGCCGTGTGGACTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGC  1656
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1625  ACGTCAAGGGGGCCGTGTGGACTGTGGATGAGCGGGAATATCAGAAACGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGT  1698

Query 1657  CCCACCCTGGTGAAGAACATGATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCAGCTACCAGGCCGCCCTGGC  1730
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1699  CCCACTCTGGTGAAGAACATGATCTCGGGCCTCAGTTACGGGGCACTTAACGCCAGCTACCAGGCTGCCCTGGC  1772

Query 1731  CGAGAGCAGCTTCCCCCTCCTCAACAGCCCTGGCATGCTGAACCCTGGCTCCGCCAGCAGCCTGCTGCCCCTCA  1804
            .||||||||||||||.||.||||.||.|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1773  AGAGAGCAGCTTCCCTCTTCTCAGCAACCCCGGCATGCTGAACCCTGGCTCAGCCAGCAGCCTTCTGCCCCTCA  1846

Query 1805  GCCACGATGACGTGGGTGCCCCCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAGCCCTCCTCGCCTCTCCCCG  1878
            ||||.||.|||.||||||.|||.|.|||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 1847  GCCAGGAGGACCTGGGTGTCCCTGGGGAACCACTACCCAGCAATGGGAGCAGCAGCCCGCCTCGTCTTTCCCCT  1920

Query 1879  CCCCAGTACAGCCACCAGGTGCAGGTGAAGGAGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAGACAGGCAGCCCGGGCCTCC  1952
            ||.|||||||||||||||.|.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|.|||.||||||||
Sbjct 1921  CCTCAGTACAGCCACCAGATACAAGTCAAAGAGGAGCCTGCAGAGGCAGAGGAAGACCGACGGCCGGGGCCTCC  1994

Query 1953  CCTGGGCGCCCCTAACCCCAGCGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGAGCTGCCGGGAGAAG  2026
            |.||||||||||.|||||||||.|...|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||...|||||.|
Sbjct 1995  CTTGGGCGCCCCCAACCCCAGCACTGTGGGGCCTCCAGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGACCTGGGAGGAGAGG  2068

Query 2027  AACTGTCC  2034
            |..|||||
Sbjct 2069  ACATGTCC  2076