Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09429
- Subject:
- XM_017317688.2
- Aligned Length:
- 2080
- Identities:
- 1805
- Gaps:
- 53
Alignment
Query 1 ATGATGGTGGAATCTGCCTCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCAGAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGG 74
|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1 ATGATGGTGGAGTCTGCATCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCGTCTGGTCAGAACGGCGTGGGCAGCCTCTCTGC 74
Query 75 GCAAGCAGATGGCAGCAGCGG---CGGGGCCACAGGGA------CAACTGCAAG------TGGCACGGGCAGGG 133
|||.||.||||||.||.|.|| ||||.||.|.||.| |..||||..| ||.|.|.|||||||
Sbjct 75 GCAGGCTGATGGCGGCGGTGGGGCCGGGACCGCGGGCACGGCCCCGGCTGCCGGTAGGGATGCCTCAGGCAGGG 148
Query 134 AAGTGACCA-CG--GGTGCAGACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCAACAG 204
|||...||| || ||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 AAGCAGCCAGCGGAGGAGCCGACAGCAATGGCGAGATGAGCCCCGCGGAGCTTCTGCACTTCCAACAGCAACAG 222
Query 205 GCTCTCCAAGTGGCCCGGCAGTTCCTGCTGCAGCAGGCCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAA 278
||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||..||||||.||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 223 GCTCTCCAGGTGGCCCGGCAGTTCCTGTTGCAGCAAGCCTCCAGCCTGAACTCCCCGGGGAACAATGACAGTAA 296
Query 279 ACAGTCTGCCTCTGCTGTGCAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCAGATGCTTACCCCGCAACAGA 352
||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||||
Sbjct 297 ACAGTCGGCCTCTGCGGTGCAGGTGCCTGTGTCTGTGGCCATGATGTCCCAGCAGATGCTTACCCCCCAGCAGA 370
Query 353 TGCAGCAGATCCTGTCGCCCCCGCAGCTGCAGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCA------G 420
|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||| |
Sbjct 371 TGCAGCAGATCCTGTCGCCACCTCAGCTGCAGGCCTTGCTGCAGCAGCAACAGGCTCTCATGCTCCAGCAGCTG 444
Query 421 CAGGAGTACTACAAGAAGCAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCA 494
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 445 CAGGAGTATTACAAGAAGCAGCAAGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGAAAACAGCA 518
Query 495 GCCCAAAGAGGCACTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAGTTGCAGCAGC 568
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 519 GCCCAAAGAGGCCCTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAGATGCAACAGTTGCAGCAAC 592
Query 569 AGCACCTGCTCAACCTGCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACC 642
|||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 593 AGCACTTGCTCAACCTCCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCAAGCCAAGCCTCAGGGCCCCTCCAGGCC 666
Query 643 CTTCCGCAAGCAGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGTGCCCCCGGGCAGCCTGC 716
||.||||| |||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 667 CTCCCGCA---AGCCGTGTGCCCGACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAAGGCGAGGGTGCCCCGGGGCAGCCCGC 737
Query 717 CGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCTCACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCC-GCTCCC 789
.||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|..||||.||.|..||.||||||||||||||| || ||.
Sbjct 738 TGAGGACAGCGGCAGGCAGGAGGGGCTGGACCTCGCCAGCACAGCTGTTACTGCTACCTCGTTTGCCAGC-CCT 810
Query 790 CCCAAGGTCTCACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA 863
|||||||||||.||.||||||||||||||..||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 CCCAAGGTCTCCCCGCCCCTCTCCCACCACCCCTTACCCAACGGACAACCCACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA 884
Query 864 CAGCTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGGCTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG 937
||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 CAGCTCCTCCCATGAGGAGACCCCCAGTTCCCACCCTCTTTATGGACATGGGGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG 958
Query 938 AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTACA 1011
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||.||.
Sbjct 959 AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAACACGCTTTGGATGACCGGAGCACG 1032
Query 1012 GCCCAGTGCCGGGTACAGATGCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGCTCGCCAAGGAGAGCGAGCGGCTGCA 1085
|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1033 GCCCAATGCCGCGTGCAGATGCAGGTGGTCCAACAGCTGGAGATCCAGCTGGCCAAGGAGAGTGAGCGGCTGCA 1106
Query 1086 GGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCA---------------- 1143
||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 GGCCATGATGGCACATCTGCACATGCGGCCTTCAGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCACACCTACCCCATTGCT 1180
Query 1144 -----CTGAACCCGGTCCCCGGCTCCTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCTCTGCAGCAGACTCATTCCCAGAT 1212
||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||| |.||||||.|.|||||.|||
Sbjct 1181 CACAGCTGAACCCAGTCCCTGGCTCCTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCT---CCGCAGACCCGTTCCCGGAT 1251
Query 1213 GGTCTCGTGCACCCCCCGACCTCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGGCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTC 1286
||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 GGCCTCGTGCACCCCCCAACTTCAGCCGCTGCCCCCGTCACACCCCTGCGTCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTC 1325
Query 1287 CCTGCATGGTGGGGGCCCAGCCCGTCGGAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTGGCCC 1360
..||||..||||||||||.|||||..|||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1326 TTTGCACAGTGGGGGCCCTGCCCGCAGGAGAAGTAATGACAAATTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTTGCCC 1399
Query 1361 AGAATCATGAGTTCTACAAGAACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTCACCTACGCCTCCCTCATCCGCCAGGCCATC 1434
|||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 1400 AGAATCATGAGTTCTACAAGAACGCTGACGTCAGGCCCCCCTTCACCTACGCTTCCCTTATCCGCCAGGCCATT 1473
Query 1435 CTGGAAACCCCTGACAGGCAGCTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTATTTCCG 1508
||||||||.||.||..||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1474 CTGGAAACTCCAGATCGGCAGCTGACGCTAAATGAGATTTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTACTTCCG 1547
Query 1509 CAGAAACACTGCCACCTGGAAGAACGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGCTTCGTCCGCGTGGAGA 1582
.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1548 AAGAAACACGGCCACCTGGAAGAATGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGTTTCGTCCGTGTGGAGA 1621
Query 1583 ACGTCAAGGGTGCCGTGTGGACTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGC 1656
||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1622 ACGTCAAGGGGGCCGTGTGGACTGTGGATGAGCGGGAATATCAGAAACGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGT 1695
Query 1657 CCCACCCTGGTGAAGAACATGATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCAGCTACCAGGCCGCCCTGGC 1730
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1696 CCCACTCTGGTGAAGAACATGATCTCGGGCCTCAGTTACGGGGCACTTAACGCCAGCTACCAGGCTGCCCTGGC 1769
Query 1731 CGAGAGCAGCTTCCCCCTCCTCAACAGCCCTGGCATGCTGAACCCTGGCTCCGCCAGCAGCCTGCTGCCCCTCA 1804
.||||||||||||||.||.||||.||.|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1770 AGAGAGCAGCTTCCCTCTTCTCAGCAACCCCGGCATGCTGAACCCTGGCTCAGCCAGCAGCCTTCTGCCCCTCA 1843
Query 1805 GCCACGATGACGTGGGTGCCCCCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAGCCCTCCTCGCCTCTCCCCG 1878
||||.||.|||.||||||.|||.|.|||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 1844 GCCAGGAGGACCTGGGTGTCCCTGGGGAACCACTACCCAGCAATGGGAGCAGCAGCCCGCCTCGTCTTTCCCCT 1917
Query 1879 CCCCAGTACAGCCACCAGGTGCAGGTGAAGGAGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAGACAGGCAGCCCGGGCCTCC 1952
||.|||||||||||||||.|.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|.|||.||||||||
Sbjct 1918 CCTCAGTACAGCCACCAGATACAAGTCAAAGAGGAGCCTGCAGAGGCAGAGGAAGACCGACGGCCGGGGCCTCC 1991
Query 1953 CCTGGGCGCCCCTAACCCCAGCGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGAGCTGCCGGGAGAAG 2026
|.||||||||||.|||||||||.|...|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||...|||||.|
Sbjct 1992 CTTGGGCGCCCCCAACCCCAGCACTGTGGGGCCTCCAGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGACCTGGGAGGAGAGG 2065
Query 2027 AACTGTCC 2034
|..|||||
Sbjct 2066 ACATGTCC 2073