Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09429
- Subject:
- XM_030250107.1
- Aligned Length:
- 2059
- Identities:
- 1808
- Gaps:
- 29
Alignment
Query 1 ATGATGGTGGAATCTGCCTCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCAGAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGG 74
|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1 ATGATGGTGGAGTCTGCATCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCGTCTGGTCAGAACGGCGTGGGCAGCCTCTCTGC 74
Query 75 GCAAGCAGATGGCAGCAGCGG---CGGGGCCACAGGGA------CAACTGCAAG------TGGCACGGGCAGGG 133
|||.||.||||||.||.|.|| ||||.||.|.||.| |..||||..| ||.|.|.|||||||
Sbjct 75 GCAGGCTGATGGCGGCGGTGGGGCCGGGACCGCGGGCACGGCCCCGGCTGCCGGTAGGGATGCCTCAGGCAGGG 148
Query 134 AAGTGACCA-CG--GGTGCAGACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCAACAG 204
|||...||| || ||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 AAGCAGCCAGCGGAGGAGCCGACAGCAATGGCGAGATGAGCCCCGCGGAGCTTCTGCACTTCCAACAGCAACAG 222
Query 205 GCTCTCCAAGTGGCCCGGCAGTTCCTGCTGCAGCAGGCCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAA 278
||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||..||||||.||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 223 GCTCTCCAGGTGGCCCGGCAGTTCCTGTTGCAGCAAGCCTCCAGCCTGAACTCCCCGGGGAACAATGACAGTAA 296
Query 279 ACAGTCTGCCTCTGCTGTGCAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCAGATGCTTACCCCGCAACAGA 352
||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||||
Sbjct 297 ACAGTCGGCCTCTGCGGTGCAGGTGCCTGTGTCTGTGGCCATGATGTCCCAGCAGATGCTTACCCCCCAGCAGA 370
Query 353 TGCAGCAGATCCTGTCGCCCCCGCAGCTGCAGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCA------G 420
|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||| |
Sbjct 371 TGCAGCAGATCCTGTCGCCACCTCAGCTGCAGGCCTTGCTGCAGCAGCAACAGGCTCTCATGCTCCAGCAGCTG 444
Query 421 CAGGAGTACTACAAGAAGCAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCA 494
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 445 CAGGAGTATTACAAGAAGCAGCAAGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGAAAACAGCA 518
Query 495 GCCCAAAGAGGCACTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAGTTGCAGCAGC 568
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 519 GCCCAAAGAGGCCCTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAGATGCAACAGTTGCAGCAAC 592
Query 569 AGCACCTGCTCAACCTGCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACC 642
|||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 593 AGCACTTGCTCAACCTCCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCAAGCCAAGCCTCAGGGCCCCTCCAGGCC 666
Query 643 CTTCCGCAAGCAGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGTGCCCCCGGGCAGCCTGC 716
||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 667 CTCCCGCAAGCAGCCGTGTGCCCGACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAAGGCGAGGGTGCCCCGGGGCAGCCCGC 740
Query 717 CGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCTCACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCC-GCTCCC 789
.||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|..||||.||.|..||.||||||||||||||| || ||.
Sbjct 741 TGAGGACAGCGGCAGGCAGGAGGGGCTGGACCTCGCCAGCACAGCTGTTACTGCTACCTCGTTTGCCAGC-CCT 813
Query 790 CCCAAGGTCTCACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA 863
|||||||||||.||.||||||||||||||..||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CCCAAGGTCTCCCCGCCCCTCTCCCACCACCCCTTACCCAACGGACAACCCACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA 887
Query 864 CAGCTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGGCTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG 937
||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 CAGCTCCTCCCATGAGGAGACCCCCAGTTCCCACCCTCTTTATGGACATGGGGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG 961
Query 938 AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTACA 1011
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||.||.
Sbjct 962 AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAACACGCTTTGGATGACCGGAGCACG 1035
Query 1012 GCCCAGTGCCGGGTACAGATGCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGCTCGCCAAGGAGAGCGAGCGGCTGCA 1085
|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036 GCCCAATGCCGCGTGCAGATGCAGGTGGTCCAACAGCTGGAGATCCAGCTGGCCAAGGAGAGTGAGCGGCTGCA 1109
Query 1086 GGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCACTGAACCCGGTCCCCG 1159
||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1110 GGCCATGATGGCACATCTGCACATGCGGCCTTCAGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCACTGAACCCAGTCCCTG 1183
Query 1160 GCTCCTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCTCTGCAGCAGACTCATTCCCAGATGGTCTCGTGCACCCCCCGACC 1233
|||||||||||||||||||||||||||||| |.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1184 GCTCCTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCT---CCGCAGACCCGTTCCCGGATGGCCTCGTGCACCCCCCAACT 1254
Query 1234 TCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGGCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTCCCTGCATGGTGGGGGCCCAGC 1307
||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||..||||..||||||||||.||
Sbjct 1255 TCAGCCGCTGCCCCCGTCACACCCCTGCGTCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTCTTTGCACAGTGGGGGCCCTGC 1328
Query 1308 CCGTCGGAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTGGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGA 1381
|||..|||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 CCGCAGGAGAAGTAATGACAAATTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTTGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGA 1402
Query 1382 ACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTCACCTACGCCTCCCTCATCCGCCAGGCCATCCTGGAAACCCCTGACAGGCAG 1455
||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||..|||||
Sbjct 1403 ACGCTGACGTCAGGCCCCCCTTCACCTACGCTTCCCTTATCCGCCAGGCCATTCTGGAAACTCCAGATCGGCAG 1476
Query 1456 CTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTATTTCCGCAGAAACACTGCCACCTGGAA 1529
|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1477 CTGACGCTAAATGAGATTTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTACTTCCGAAGAAACACGGCCACCTGGAA 1550
Query 1530 GAACGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGCTTCGTCCGCGTGGAGAACGTCAAGGGTGCCGTGTGGA 1603
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1551 GAATGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGTTTCGTCCGTGTGGAGAACGTCAAGGGGGCCGTGTGGA 1624
Query 1604 CTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGCCCCACCCTGGTGAAGAACATG 1677
|||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1625 CTGTGGATGAGCGGGAATATCAGAAACGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGTCCCACTCTGGTGAAGAACATG 1698
Query 1678 ATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCAGCTACCAGGCCGCCCTGGCCGAGAGCAGCTTCCCCCTCCT 1751
|||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1699 ATCTCGGGCCTCAGTTACGGGGCACTTAACGCCAGCTACCAGGCTGCCCTGGCAGAGAGCAGCTTCCCTCTTCT 1772
Query 1752 CAACAGCCCTGGCATGCTGAACCCTGGCTCCGCCAGCAGCCTGCTGCCCCTCAGCCACGATGACGTGGGTGCCC 1825
||.||.|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||||.||
Sbjct 1773 CAGCAACCCCGGCATGCTGAACCCTGGCTCAGCCAGCAGCCTTCTGCCCCTCAGCCAGGAGGACCTGGGTGTCC 1846
Query 1826 CCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAGCCCTCCTCGCCTCTCCCCGCCCCAGTACAGCCACCAGGTG 1899
|.|.|||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||.|.
Sbjct 1847 CTGGGGAACCACTACCCAGCAATGGGAGCAGCAGCCCGCCTCGTCTTTCCCCTCCTCAGTACAGCCACCAGATA 1920
Query 1900 CAGGTGAAGGAGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAGACAGGCAGCCCGGGCCTCCCCTGGGCGCCCCTAACCCCAG 1973
||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|.|||.|||||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct 1921 CAAGTCAAAGAGGAGCCTGCAGAGGCAGAGGAAGACCGACGGCCGGGGCCTCCCTTGGGCGCCCCCAACCCCAG 1994
Query 1974 CGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGAGCTGCCGGGAGAAGAACTGTCC 2034
|.|...|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||...|||||.||..|||||
Sbjct 1995 CACTGTGGGGCCTCCAGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGACCTGGGAGGAGAGGACATGTCC 2055