Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09429
- Subject:
- XM_030250108.1
- Aligned Length:
- 2059
- Identities:
- 1805
- Gaps:
- 32
Alignment
Query 1 ATGATGGTGGAATCTGCCTCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCAGAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGG 74
|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1 ATGATGGTGGAGTCTGCATCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCGTCTGGTCAGAACGGCGTGGGCAGCCTCTCTGC 74
Query 75 GCAAGCAGATGGCAGCAGCGG---CGGGGCCACAGGGA------CAACTGCAAG------TGGCACGGGCAGGG 133
|||.||.||||||.||.|.|| ||||.||.|.||.| |..||||..| ||.|.|.|||||||
Sbjct 75 GCAGGCTGATGGCGGCGGTGGGGCCGGGACCGCGGGCACGGCCCCGGCTGCCGGTAGGGATGCCTCAGGCAGGG 148
Query 134 AAGTGACCA-CG--GGTGCAGACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCAACAG 204
|||...||| || ||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 AAGCAGCCAGCGGAGGAGCCGACAGCAATGGCGAGATGAGCCCCGCGGAGCTTCTGCACTTCCAACAGCAACAG 222
Query 205 GCTCTCCAAGTGGCCCGGCAGTTCCTGCTGCAGCAGGCCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAA 278
||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||..||||||.||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 223 GCTCTCCAGGTGGCCCGGCAGTTCCTGTTGCAGCAAGCCTCCAGCCTGAACTCCCCGGGGAACAATGACAGTAA 296
Query 279 ACAGTCTGCCTCTGCTGTGCAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCAGATGCTTACCCCGCAACAGA 352
||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||||
Sbjct 297 ACAGTCGGCCTCTGCGGTGCAGGTGCCTGTGTCTGTGGCCATGATGTCCCAGCAGATGCTTACCCCCCAGCAGA 370
Query 353 TGCAGCAGATCCTGTCGCCCCCGCAGCTGCAGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCA------G 420
|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||| |
Sbjct 371 TGCAGCAGATCCTGTCGCCACCTCAGCTGCAGGCCTTGCTGCAGCAGCAACAGGCTCTCATGCTCCAGCAGCTG 444
Query 421 CAGGAGTACTACAAGAAGCAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCA 494
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 445 CAGGAGTATTACAAGAAGCAGCAAGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCTCACCCAGCAGCAGGCTGGAAAACAGCA 518
Query 495 GCCCAAAGAGGCACTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAGTTGCAGCAGC 568
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 519 GCCCAAAGAGGCCCTGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAGATGCAACAGTTGCAGCAAC 592
Query 569 AGCACCTGCTCAACCTGCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACC 642
|||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 593 AGCACTTGCTCAACCTCCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCTGCAGCCAAGCCAAGCCTCAGGGCCCCTCCAGGCC 666
Query 643 CTTCCGCAAGCAGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGTGCCCCCGGGCAGCCTGC 716
||.||||| |||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 667 CTCCCGCA---AGCCGTGTGCCCGACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAAGGCGAGGGTGCCCCGGGGCAGCCCGC 737
Query 717 CGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCTCACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCC-GCTCCC 789
.||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|..||||.||.|..||.||||||||||||||| || ||.
Sbjct 738 TGAGGACAGCGGCAGGCAGGAGGGGCTGGACCTCGCCAGCACAGCTGTTACTGCTACCTCGTTTGCCAGC-CCT 810
Query 790 CCCAAGGTCTCACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA 863
|||||||||||.||.||||||||||||||..||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 CCCAAGGTCTCCCCGCCCCTCTCCCACCACCCCTTACCCAACGGACAACCCACTGTGCTCACATCTCGGAGAGA 884
Query 864 CAGCTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGGCTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG 937
||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 CAGCTCCTCCCATGAGGAGACCCCCAGTTCCCACCCTCTTTATGGACATGGGGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTG 958
Query 938 AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTACA 1011
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||.||.
Sbjct 959 AGACCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAACACCTCAACACAGAACACGCTTTGGATGACCGGAGCACG 1032
Query 1012 GCCCAGTGCCGGGTACAGATGCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGCTCGCCAAGGAGAGCGAGCGGCTGCA 1085
|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1033 GCCCAATGCCGCGTGCAGATGCAGGTGGTCCAACAGCTGGAGATCCAGCTGGCCAAGGAGAGTGAGCGGCTGCA 1106
Query 1086 GGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCACTGAACCCGGTCCCCG 1159
||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1107 GGCCATGATGGCACATCTGCACATGCGGCCTTCAGAGCCCAAGCCCTTCAGCCAGCCACTGAACCCAGTCCCTG 1180
Query 1160 GCTCCTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCTCTGCAGCAGACTCATTCCCAGATGGTCTCGTGCACCCCCCGACC 1233
|||||||||||||||||||||||||||||| |.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1181 GCTCCTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCT---CCGCAGACCCGTTCCCGGATGGCCTCGTGCACCCCCCAACT 1251
Query 1234 TCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGGCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTCCCTGCATGGTGGGGGCCCAGC 1307
||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||..||||..||||||||||.||
Sbjct 1252 TCAGCCGCTGCCCCCGTCACACCCCTGCGTCCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTCTTTGCACAGTGGGGGCCCTGC 1325
Query 1308 CCGTCGGAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTGGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGA 1381
|||..|||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326 CCGCAGGAGAAGTAATGACAAATTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGAGCTTGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGA 1399
Query 1382 ACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTCACCTACGCCTCCCTCATCCGCCAGGCCATCCTGGAAACCCCTGACAGGCAG 1455
||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||..|||||
Sbjct 1400 ACGCTGACGTCAGGCCCCCCTTCACCTACGCTTCCCTTATCCGCCAGGCCATTCTGGAAACTCCAGATCGGCAG 1473
Query 1456 CTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTATTTCCGCAGAAACACTGCCACCTGGAA 1529
|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1474 CTGACGCTAAATGAGATTTATAACTGGTTCACCAGGATGTTCGCCTACTTCCGAAGAAACACGGCCACCTGGAA 1547
Query 1530 GAACGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGCTTCGTCCGCGTGGAGAACGTCAAGGGTGCCGTGTGGA 1603
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1548 GAATGCCGTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGTTTCGTCCGTGTGGAGAACGTCAAGGGGGCCGTGTGGA 1621
Query 1604 CTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGCCCCACCCTGGTGAAGAACATG 1677
|||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1622 CTGTGGATGAGCGGGAATATCAGAAACGGAGACCGCCAAAGATGACAGGGAGTCCCACTCTGGTGAAGAACATG 1695
Query 1678 ATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCAGCTACCAGGCCGCCCTGGCCGAGAGCAGCTTCCCCCTCCT 1751
|||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1696 ATCTCGGGCCTCAGTTACGGGGCACTTAACGCCAGCTACCAGGCTGCCCTGGCAGAGAGCAGCTTCCCTCTTCT 1769
Query 1752 CAACAGCCCTGGCATGCTGAACCCTGGCTCCGCCAGCAGCCTGCTGCCCCTCAGCCACGATGACGTGGGTGCCC 1825
||.||.|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||||.||
Sbjct 1770 CAGCAACCCCGGCATGCTGAACCCTGGCTCAGCCAGCAGCCTTCTGCCCCTCAGCCAGGAGGACCTGGGTGTCC 1843
Query 1826 CCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAGCCCTCCTCGCCTCTCCCCGCCCCAGTACAGCCACCAGGTG 1899
|.|.|||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||.|.
Sbjct 1844 CTGGGGAACCACTACCCAGCAATGGGAGCAGCAGCCCGCCTCGTCTTTCCCCTCCTCAGTACAGCCACCAGATA 1917
Query 1900 CAGGTGAAGGAGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAGACAGGCAGCCCGGGCCTCCCCTGGGCGCCCCTAACCCCAG 1973
||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|.|||.|||||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct 1918 CAAGTCAAAGAGGAGCCTGCAGAGGCAGAGGAAGACCGACGGCCGGGGCCTCCCTTGGGCGCCCCCAACCCCAG 1991
Query 1974 CGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGAGCTGCCGGGAGAAGAACTGTCC 2034
|.|...|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||...|||||.||..|||||
Sbjct 1992 CACTGTGGGGCCTCCAGAAGACAGGGACCTGGAGGAGGACCTGGGAGGAGAGGACATGTCC 2052