Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09438
• Subject: XM_011540607.1
• Aligned Length: 2559
• Identities: 2470
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCG-------------------CGCT--------TCAG  47
                                       |.||.||.||||                   ||||        |.||
Sbjct    1  ---------------------------ATGGCCTACCCGTCTTTCCAGCGGACCATGCCGCTTGCAGCTGTGAG  47

Query   48  GGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGACGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCA  121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  GGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGACGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCA  121

Query  122  GTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCTACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCC  195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  GTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCTACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCC  195

Query  196  CAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATCTC------------------------------GGAATGTCTGCAGAG  239
            |||||||||||||||||||||||||||||                              |||||||||||||||
Sbjct  196  CAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATCTCGGTGAGGGGCCGACTGACCTCTGACCTCAAGGAATGTCTGCAGAG  269

Query  240  GTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAACTACCACATGAACCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGC  313
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  GTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAACTACCACATGATCCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGC  343

Query  314  AGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGG  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  AGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGG  417

Query  388  GAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCAC  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  GAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCAC  491

Query  462  CGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGC  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  CGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGC  565

Query  536  AGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAG  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  AGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAG  639

Query  610  GGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTGGACCAGCTGGTGATCGA  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  GGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTGGACCAGCTGGTGATCGA  713

Query  684  CTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCT  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  CTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCT  787

Query  758  CCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAG  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  CCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAG  861

Query  832  AGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAA  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  AGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAA  935

Query  906  GAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCG  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  GAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCG  1009

Query  980  AGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGG  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  AGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGG  1083

Query 1054  CAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGA  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  CAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGA  1157

Query 1128  GAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGA  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  GAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGA  1231

Query 1202  AGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGAC  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232  AGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGAC  1305

Query 1276  CCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGT  1349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306  CCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGT  1379

Query 1350  CCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTG  1423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380  CCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTG  1453

Query 1424  GAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGC  1497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454  GAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGC  1527

Query 1498  TCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGC  1571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528  TCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGC  1601

Query 1572  ACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCA  1645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602  ACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCA  1675

Query 1646  CTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGAT  1719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676  CTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGAT  1749

Query 1720  CGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGC  1793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750  CGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGC  1823

Query 1794  CGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAGTAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGATGGCAGCTCGGACGTCC  1867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1824  CGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAGTAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGATGGCAGCTCGGACGTCC  1897

Query 1868  TGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGGACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGT  1941
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Sbjct 1898  TGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGGACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGT  1971

Query 1942  GAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGC  2015
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Sbjct 1972  GAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGC  2045

Query 2016  GCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGG  2089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046  GCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGG  2119

Query 2090  CGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTC  2163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2120  CGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTC  2193

Query 2164  CTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCT  2237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2194  CTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCT  2267

Query 2238  GGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGG  2311
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Sbjct 2268  GGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGG  2341

Query 2312  ACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAG  2385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2342  ACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAG  2415

Query 2386  GAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCG  2459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2416  GAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCG  2489

Query 2460  CAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC  2502
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Sbjct 2490  CAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC  2532