Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09483
• Subject: NM_054043.3
• Aligned Length: 1038
• Identities: 938
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGGANGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74
            |||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCAAATGGGAGCCCAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74

Query   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148

Query  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTCGCAGACCCAGCAAGT  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACAACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACCTTCGCAGACCCAGCAAGT  222

Query  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAAAGTTGCATTTCCTCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCAAAAGTTGCATTTCCTCG  296

Query  297  TCGAGCGCAACCCAAGATGGTCACGAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTGCGAACACAGTAGTGG  370
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  297  TCGAGCGCAACCTAAGATGGTCACAAGAACAAAGAAAATCTTCGTAGGAGGATTGTCTGCAAACACAGTAGTGG  370

Query  371  AAGATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTTGATAAAACTACCAAC  444
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  AAGATGTAAAGCAGTATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTAGAGGATGCGATGCTGATGTTCGACAAAACCACCAAC  444

Query  445  AGGCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACCTTTGAGAATGAAGACGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCA  518

Query  519  TGAAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAG  592

Query  593  GCCGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGATATCCCAACTTC  666
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  593  GCCGGGCCCGGGGGCTGCCATACACCATGGATGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGCTACCCCAACTTT  666

Query  667  GTGGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCCAGGCTTCCCAGCAGC  740
            |||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  667  GTGGCAACCTATGGCAGAGGCTACCCCGGATTTGCTCCTAGCTATGGCTACCAGTTCCCAGGCTTCCCGGCGGC  740

Query  741  GGCTTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAAGAGGAT---------------------------  787
            .||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||..||||||                           
Sbjct  741  AGCTTATGGACCAGTGGCAGCGGCAGCTGTGGCAGCGGCTCGAGGATCAGTCCTGAATAGCTACAGTGCTCAAC  814

Query  788  ---------------------------CAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGCTTCCCGGGGGCCAACAGC  834
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGAATTTTGGCGCGCCCGCTTCCCCGGCAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGCTTCCCGGGGGCCAACAGC  888

Query  835  CCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAATTACATAAGTGCGGCCAG  908
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  CCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAATTACATAAGCGCGGCCAG  962

Query  909  CCCACAGCCGGGCTCGGGCTTCGGCCACGGCATAGCTGGACCTTTGATTGCAACGGCCTTTACAAATGGATACC  982
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCACAGCCGGGCTCCGGCTTCGGCCACGGCATAGCTGGACCTTTGATTGCAACGGCCTTTACAAATGGATACC  1036

Query  983  AT  984
            |.
Sbjct 1037  AC  1038