Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09483
- Subject:
- XM_006534434.2
- Aligned Length:
- 1126
- Identities:
- 918
- Gaps:
- 158
Alignment
Query 1 ATGGANGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT 74
|||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGCAAATGGGAGCCCAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT 74
Query 75 CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT 148
Query 149 GTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTCGCAGACCCAGCAAGT 222
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTATGGTCATGAGAGATCCCACAACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACCTTCGCAGACCCAGCAAGT 222
Query 223 GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAAAGTTGCATTTCCTCG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCAAAAGTTGCATTTCCTCG 296
Query 297 TCGAGCGCAACC-------------------------------------------------------------- 308
||||||||||||
Sbjct 297 TCGAGCGCAACCTAAGAGTCAAGAGCAGGGAGGCTCCTGGAAACGCACATGGACCACGGTCCAAGCTCGGGCTG 370
Query 309 ----------CAAGATGGTCACGAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTGCGAACACAGTAGTGGAA 372
|.||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CCTCAGGTGACCAGATGGTCACAAGAACAAAGAAAATCTTCGTAGGAGGATTGTCTGCAAACACAGTAGTGGAA 444
Query 373 GATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTTGATAAAACTACCAACAG 446
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 445 GATGTAAAGCAGTATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTAGAGGATGCGATGCTGATGTTCGACAAAACCACCAACAG 518
Query 447 GCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCATG 520
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACCTTTGAGAATGAAGACGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCATG 592
Query 521 AAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAGGC 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAGGC 666
Query 595 CGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGATATCCCAACTTCGT 668
|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 667 CGGGCCCGGGGGCTGCCATACACCATGGATGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGCTACCCCAACTTTGT 740
Query 669 GGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCCAGGCTTCCCAGCAGCGG 742
|||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 741 GGCAACCTATGGCAGAGGCTACCCCGGATTTGCTCCTAGCTATGGCTACCAGTTCCCAGGCTTCCCGGCGGCAG 814
Query 743 CTTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAAGAGGAT----------------------------- 787
|||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||..||||||
Sbjct 815 CTTATGGACCAGTGGCAGCGGCAGCTGTGGCAGCGGCTCGAGGATCAGTCCTGAATAGCTACAGTGCTCAACCG 888
Query 788 -------------------------CAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGCTTCCCGGGGGCCAACAGCCC 836
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATTTTGGCGCGCCCGCTTCCCCGGCAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGCTTCCCGGGGGCCAACAGCCC 962
Query 837 AGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAATTACATAAGTGCGGCCAGCC 910
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 963 AGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAATTACATAAGCGCGGCCAGCC 1036
Query 911 CACAGCCGGGCTCGGGCTTCGGCCACGGCATAGCTGG---ACCTTTGAT-----TGCAACGGCCT--------T 968
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.| ||| |.||| .|||| |.|| |
Sbjct 1037 CACAGCCGGGCTCCGGCTTCGGCCACGGCATAGCTAGCATACC-TGGATGTCCAGGCAA--GACTGGGCGAAGT 1107
Query 969 TACAAATGGATACCAT 984
|.|
Sbjct 1108 TTC------------- 1110