Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09483
• Subject: XM_011249304.2
• Aligned Length: 1058
• Identities: 738
• Gaps: 271

Alignment

Query    1  ATGGANGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74
            |||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCAAATGGGAGCCCAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74

Query   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148

Query  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTCGCAGACCCAGCAAGT  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACAACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACCTTCGCAGACCCAGCAAGT  222

Query  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAAAGTTGCATTTCCTCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCAAAAGTTGCATTTCCTCG  296

Query  297  TCGAGCGCAACC--------------------------------------------------------------  308
            ||||||||||||                                                              
Sbjct  297  TCGAGCGCAACCTAAGAGTCAAGAGCAGGGAGGCTCCTGGAAACGCACATGGACCACGGTCCAAGCTCGGGCTG  370

Query  309  ----------CAAGATGGTCACGAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTGCGAACACAGTAGTGGAA  372
                      |.||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CCTCAGGTGACCAGATGGTCACAAGAACAAAGAAAATCTTCGTAGGAGGATTGTCTGCAAACACAGTAGTGGAA  444

Query  373  GATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTTGATAAAACTACCAACAG  446
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  445  GATGTAAAGCAGTATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTAGAGGATGCGATGCTGATGTTCGACAAAACCACCAACAG  518

Query  447  GCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCATG  520
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACCTTTGAGAATGAAGACGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCATG  592

Query  521  AAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAGGC  594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAGGC  666

Query  595  CGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGATATCCCAACTTCGT  668
            |||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  667  CGGGCCCGGGGGCTGCCATACACCATGGATGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGCTACCCCAACTTTGT  740

Query  669  GGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCCAG-GCTTCCCAGCAGCG  741
            |||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||| .|||.|||.||.| 
Sbjct  741  GGCAACCTATGGCAGAGGCTACCCCGGATTTGCTCCTAGCTATGGCTACCAGTTCCCAGCACTTTCCACCAAC-  813

Query  742  GCTTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAAGAGGATCAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAG-  814
                    ||||....|||.|              |.|.||||              ||.||..|    |.|| 
Sbjct  814  --------ACCATCTTCAGAA--------------ATCTAGAG--------------CCTGCATG----GAAGA  847

Query  815  GCTTCCCGGGGGCCAACAGCCCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGG  888
            |||    ||||      ||   ||.||                                               
Sbjct  848  GCT----GGGG------AG---AGAAC-----------------------------------------------  861

Query  889  AATTACATAAGTGCGGCCAGCCCACAGCCGGGCTCGGGCTTCGGCCACGGCATAGCTGGACCTTTGATTGCAAC  962
                                                                                      
Sbjct  862  --------------------------------------------------------------------------  861

Query  963  GGCCTTTACAAATGGATACCAT  984
                                  
Sbjct  862  ----------------------  861