Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09483
• Subject: XM_017024147.2
• Aligned Length: 1038
• Identities: 890
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGGANGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74

Query   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148

Query  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTCGCAGACCCAGCAAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTCGCAGACCCAGCAAGT  222

Query  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAAAGTTGCATTTCCTCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAAAGTTGCATTTCCTCG  296

Query  297  TCGAGCGCAACCCAAGATGGTCACGAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTGCGAACACAGTAGTGG  370
            ||||||||||||                                                              
Sbjct  297  TCGAGCGCAACC--------------------------------------------------------------  308

Query  371  AAGATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTTGATAAAACTACCAAC  444
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  309  -------------------------------CAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTTGATAAAACTACCAAC  351

Query  445  AGGCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  AGGCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCA  425

Query  519  TGAAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  426  TGAAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAG  499

Query  593  GCCGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGATATCCCAACTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  GCCGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGATATCCCAACTTC  573

Query  667  GTGGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCCAGGCTTCCCAGCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  574  GTGGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCCAGGCTTCCCAGCAGC  647

Query  741  GGCTTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAAGAGGAT---------------------------  787
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  648  GGCTTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAAGAGGATCAGTCCTGAATAGCTACAGTGCTCAAC  721

Query  788  ---------------------------CAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGCTTCCCGGGGGCCAACAGC  834
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  CGAATTTTGGCGCGCCCGCTTCCCCGGCAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGCTTCCCGGGGGCCAACAGC  795

Query  835  CCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAATTACATAAGTGCGGCCAG  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  CCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAATTACATAAGTGCGGCCAG  869

Query  909  CCCACAGCCGGGCTCGGGCTTCGGCCACGGCATAGCTGGACCTTTGATTGCAACGGCCTTTACAAATGGATACC  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  CCCACAGCCGGGCTCGGGCTTCGGCCACGGCATAGCTGGACCTTTGATTGCAACGGCCTTTACAAATGGATACC  943

Query  983  AT  984
            ||
Sbjct  944  AT  945