Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09483
Subject:
XM_017314830.1
Aligned Length:
1008
Identities:
938
Gaps:
24

Alignment

Query    1  ATGGANGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74
            |||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCAAATGGGAGCCCAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74

Query   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148

Query  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTCGCAGACCCAGCAAGT  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACAACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACCTTCGCAGACCCAGCAAGT  222

Query  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAAAGTTGCATTTCCTCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCAAAAGTTGCATTTCCTCG  296

Query  297  TCGAGCGCAACCCAAGATGGTCACGAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTGCGAACACAGTAGTGG  370
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  297  TCGAGCGCAACCTAAGATGGTCACAAGAACAAAGAAAATCTTCGTAGGAGGATTGTCTGCAAACACAGTAGTGG  370

Query  371  AAGATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTTGATAAAACTACCAAC  444
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  AAGATGTAAAGCAGTATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTAGAGGATGCGATGCTGATGTTCGACAAAACCACCAAC  444

Query  445  AGGCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACCTTTGAGAATGAAGACGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCA  518

Query  519  TGAAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAG  592

Query  593  GCCGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGATATCCCAACTTC  666
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  593  GCCGGGCCCGGGGGCTGCCATACACCATGGATGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGCTACCCCAACTTT  666

Query  667  GTGGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCCAG-------------  727
            |||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||             
Sbjct  667  GTGGCAACCTATGGCAGAGGCTACCCCGGATTTGCTCCTAGCTATGGCTACCAGTTCCCAGCCCTATTACCATA  740

Query  728  -----------GCTTCCCAGCAGCGGCTTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAAGAGGATCAG  790
                       |||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||..|||||||||
Sbjct  741  TTTAAATGCAAGCTTCCCGGCGGCAGCTTATGGACCAGTGGCAGCGGCAGCTGTGGCAGCGGCTCGAGGATCAG  814

Query  791  GCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGCTTCCCGGGGGCCAACAGCCCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCT  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGCTTCCCGGGGGCCAACAGCCCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCT  888

Query  865  GCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAATTACATAAGTGCGGCCAGCCCACAGCCGGGCTCGGGCTTCGGCCACGG  938
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  GCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAATTACATAAGCGCGGCCAGCCCACAGCCGGGCTCCGGCTTCGGCCACGG  962

Query  939  CATAGCTGGACCTTTGATTGCAACGGCCTTTACAAATGGATACCAT  984
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  963  CATAGCTGGACCTTTGATTGCAACGGCCTTTACAAATGGATACCAC  1008