Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09630
- Subject:
- XM_005255144.3
- Aligned Length:
- 1560
- Identities:
- 1143
- Gaps:
- 414
Alignment
Query 1 ATGGCATCCAACGATAAAGGCATGGCACCCTCGCTGGGCTCTCCCTGGGCCTCCCGGATGGGGCCCTGGGATGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCCTCAAGGCTGTCAAAGACCAGCTCCCGTCTCTGGACTCAGACTCCCCTTTGTCGGACTATGGGGAAGAGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGCTGTTCATCTTCCAGCGAAACCAAACCTCCCTGATTCCAGACCTGTCGGAGGAGCTGGCTGAAGATCCTGCC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GATGGCGACAAGTCCAGGGCCTGGGTCGCTGCAGCTGAAGAGTCCCTTCCCGAGCCAGTTCTGGTGCCTGCAGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 ATTGGCCACAGAACCTGGGTGCAGACAGAACACAAGGACAAAGGATGCATCCTCTCAGGAAGGAAGAGACCCTG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GCAGGCCTTTTGAAAGCTCTGGTGAAGTCAGCGCTCTTCTTGGGATGGCCGAGGAGCCCCCCAGGTGGCTGGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------ATGGCCGAGGAGCCCCCCAGGTGGCTGGAA 30
Query 445 GGCGACCTTGGAAGCCTGTCTTTCAACACCAAAGGATCCCAGGGTCCTCCCTGGGACCCACAGGCCGAAGCCAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 31 GGCGACCTTGGAAGCCTGTCTTTCAACACCAAAGGATCCCAGGGTCCTCCCTGGGACCCACAGGCCGAAGCCAC 104
Query 519 TCTCTCCTGCCATGAAGGAGACCCAAAGGCAGAGCCCCTCAGCACTGCCTCACAAGAATCTGTGAACCGCCGGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 TCTCTCCTGCCATGAAGGAGACCCAAAGGCAGAGCCCCTCAGCACTGCCTCACAAGAATCTGTGAACCGCCGGG 178
Query 593 CCCTCCGACAGGAGAGAAGGAAGATGATAGAGACGGACATCCTCCAGAAAGTCACCCGGGATGCCTGCGGCCCG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 CCCTCCGACAGGAGAGAAGGAAGATGATAGAGACGGACATCCTCCAGAAAGTCACCCGGGATGCCTGCGGCCCG 252
Query 667 ACCAGCAGTGACAAAGGTGGGGTGAAGGAGGCGCCCTGCCACGCTGCGGAGTCAGCTCCCAGATCCAAAATGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 253 ACCAGCAGTGACAAAGGTGGGGTGAAGGAGGCGCCCTGCCACGCTGCGGAGTCAGCTCCCAGATCCAAAATGCC 326
Query 741 CCTCGTGGAGCCTCCGGAGGGACCACCAGTGCTCTCGCTCCAGCAACTTGAAGCGTGGGATTTGGATGACATCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 CCTCGTGGAGCCTCCGGAGGGACCACCAGTGCTCTCGCTCCAGCAACTTGAAGCGTGGGATTTGGATGACATCC 400
Query 815 TTCAGAGTCTGGCGGGACAAGAAGACAACCAGGGAAATCGTGCACCTGGAACTGTGTGGTGGGCAGCTGACCAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 401 TTCAGAGTCTGGCGGGACAAGAAGACAACCAGGGAAATCGTGCACCTGGAACTGTGTGGTGGGCAGCTGACCAC 474
Query 889 CGCCAAGTTCAAGACTGCATGGTGCCGAGCGCCCACAACAGGCTCATGGAACAGCTGGCCCTCCTGTGCACCAC 962
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475 CGCCAAGTTCAAGACCGCATGGTGCCGAGCGCCCACAACAGGCTCATGGAACAGCTGGCCCTCCTGTGCACCAC 548
Query 963 GCAGTCCAAGGCCTCTGCTTGTGCCCGGAAGGTGCCTGCCGACACTCCCCAGGACACCAAAGAGGCAGATTCAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 549 GCAGTCCAAGGCCTCTGCTTGTGCCCGGAAGGTGCCTGCCGACACTCCCCAGGACACCAAAGAGGCAGATTCAG 622
Query 1037 GAAGCAGATGTGCCTCAAGGAAGCGGGGCTCCCAGGCTGGGCCAGGCCCGCAGCTGGCCCAGGGCATGAGGCTT 1110
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 623 GAAGCAGATGTGCCTCAAGGAAGCAGGGCTCCCAGGCTGGGCCAGGCCCGCAGCTGGCCCAGGGCATGAGGCTT 696
Query 1111 AACGCAGAGTCCCCCACCATCTTTATTGACCTGCGGCAGATGGAGCTACCAGACCACCTGTCCCCAGAAAGCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697 AACGCAGAGTCCCCCACCATCTTTATTGACCTGCGGCAGATGGAGCTACCAGACCACCTGTCCCCAGAAAGCTC 770
Query 1185 CAGCCACAGCTCCTCTGACAGTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGATGGCAGCTCTGGGAGACGCAGAGGGGGCAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 CAGCCACAGCTCCTCTGACAGTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGATGGCAGCTCTGGGAGACGCAGAGGGGGCAT 844
Query 1259 CTCCTTCCTCCCTGGGGCTACGGACCTGTACCGGGAAAAGCCAGCTTCTCCAGCAGCTCAGGGCCTTTCAGAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 845 CTCCTTCCTCCCTGGGGCTACGGACCTGTACCGGGAAAAGCCAGCTTCTCCAGCAGCTCAGGGCCTTTCAGAAG 918
Query 1333 GGGACAGCCCAGCCCGAGCTGCCTGCCAGCAAGGGGCCCGCGGGTGGGAGGGCTCAGGCCCTTGAAGACACAGC 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 919 GGGACAGCCCAGCCCGAGCTGCCTGCCAGCAAGGGGCCCGCGGGTGGGAGGGCTCAGGCCCCTGAAGACACAGC 992
Query 1407 TGGATCACGAACTGGGAGGAAGCAACACATGAAGCTCTGTGCCAAGGGGCAGAGCGCCCAGGCTCGACTCCCAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 993 TGGATCACGAACTGGGAGGAAGCAACACATGAAGCTCTGTGCCAAGGGGCAGAGCGCCCAGGCTCGACTCCCAA 1066
Query 1481 GAGGCAGGCCCAGAGCCCTGGGGGATGTTCCTGAGCCAGGGGCAGCCAGGGAGGCCCTGATGCCTCCTCTGGAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067 GAGGCAGGCCCAGAGCCCTGGGGGATGTTCCTGAGCCAGGGGCAGCCAGGGAGGCCCTGATGCCTCCTCTGGAG 1140
Query 1555 CAACTA 1560
||||||
Sbjct 1141 CAACTA 1146