Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09677
• Subject: NM_001113400.1
• Aligned Length: 1107
• Identities: 989
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGATGCATCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTT  74
            ||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGATGCAGCCTTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTGCCGTGGGGCTCTT  74

Query   75  TCCAAATTTTAACACAATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAA  148
            ||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  TCCAAACTTTAACACAATGGACCCTGTGCAGAAAGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCCCCGA  148

Query  149  AGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTAC  222
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAGAAACAAGTTATTTCCTGTAACGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTAC  222

Query  223  AAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCTCTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAA  296

Query  297  GGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  GGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAAGACA  370

Query  371  AAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGC  444
            ||||||||.|||||||||.|||||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||.|||.||||||||||||||
Sbjct  371  AAGGGAAGATAAAAGCCACCAGTTCCAGTCAGCCCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATCTGGC  444

Query  445  ACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGA  518
            ||||||||||||||||.||||||...|.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||.|||
Sbjct  445  ACAACACCCCTGCCACTTGGAGCCATCGCTTCTCCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTGCTGA  518

Query  519  ATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGC  592
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTCTACTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGC  592

Query  593  TAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCC  666
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  593  TGGAGGCTCACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAAGTCC  666

Query  667  TATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCA  740
            |||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||
Sbjct  667  TATCCAAGACCTGGGTCAAGATTAAAGGTGCAGAACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGTTTCA  740

Query  741  TTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAG  814
            ||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  TTGTGAGATCTGTGATGTTCACGTGAACTCAGAGATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCATAAAG  814

Query  815  ATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTA  888
            |.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||..||
Sbjct  815  ACCGCGTGGCAGGAAAACCGCTGAAGCCGAAATACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCATCTTA  888

Query  889  GCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGC  962
            ||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.||   .||
Sbjct  889  GCTGCAAAGCTTGCATTCCAGAAAGATCTGATGAAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT---GGC  959

Query  963  GGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTC  1036
            |||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.|
Sbjct  960  GGCCGCAGCCGTGTCCTCTGCGCTGTCACTGCCACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCCATCC  1033

Query 1037  CTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1107
            ||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1034  CTCCTGCGCTGCTGAGGCCTGGCCACGGGCCCATCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTAC  1104