Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09677
- Subject:
- XM_006499457.3
- Aligned Length:
- 1320
- Identities:
- 989
- Gaps:
- 216
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAATGTTACACCTGCCTCCCGGATGGCCCAGGCAGCGCATGCCACACCACTACCCTTCCTGCCCTCGTGCG 74
Query 1 -------------ATGATGCATCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTG 61
||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 75 CACACCCACCCTGATGATGCAGCCTTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTG 148
Query 62 CTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTAACACA--------------------------------------------- 90
|.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 CCGTGGGGCTCTTTCCAAACTTTAACACACCATCTTTGTCCGTGGACTTGTGCCTGTTGGCTCTCAGAGCCCCT 222
Query 91 -------------------------------------------------------------------------- 90
Sbjct 223 ACGCATACAGGACTGAGGAAGAGACCAGGCCATCTAAAGGAGAAAAGAAGAGGCTTATTTGGGACCAATAAGTT 296
Query 91 -------ATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAAC 157
|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 CTGCCAGATGGACCCTGTGCAGAAAGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCCCCGAAGAAGAAAC 370
Query 158 AAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGT 231
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGTTATTTCCTGTAACGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGT 444
Query 232 AAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGC 305
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCTCTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGC 518
Query 306 AAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGT 379
||||||||||||||||||||||||||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 519 AAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAAGACAAAGGGAAGA 592
Query 380 TAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCC 453
|||||||||.|||||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAAAAGCCACCAGTTCCAGTCAGCCCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCC 666
Query 454 CTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGA 527
|||||||.||||||...|.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||.|||.||||||||
Sbjct 667 CTGCCACTTGGAGCCATCGCTTCTCCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTGCTGAGTCAGAAGA 740
Query 528 AGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCAC 601
|||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 741 AGAAAAAGCCAAAAAATTACTCTACTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTGGAGGCTC 814
Query 602 ACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGA 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 815 ACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAAGTCCTATCCAAGA 888
Query 676 CCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAAT 749
|||||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||||.||
Sbjct 889 CCTGGGTCAAGATTAAAGGTGCAGAACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGTTTCATTGTGAGAT 962
Query 750 CTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTG 823
||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 963 CTGTGATGTTCACGTGAACTCAGAGATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCATAAAGACCGCGTGG 1036
Query 824 CAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAA 897
||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||..||||.|||||.
Sbjct 1037 CAGGAAAACCGCTGAAGCCGAAATACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCATCTTAGCTGCAAAG 1110
Query 898 CTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGC 971
||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.|| .|||||.|||||
Sbjct 1111 CTTGCATTCCAGAAAGATCTGATGAAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT---GGCGGCCGCAGC 1181
Query 972 CGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTC 1045
|||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|
Sbjct 1182 CGTGTCCTCTGCGCTGTCACTGCCACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCCATCCCTCCTGCGC 1255
Query 1046 TTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC 1107
|.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1256 TGCTGAGGCCTGGCCACGGGCCCATCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTAC 1317