Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09677
- Subject:
- XM_011510717.2
- Aligned Length:
- 1287
- Identities:
- 1105
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGATGCATCCTTC 14
||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGCTCGGCAGTACATGCCACACTACTACCCTTCCTGCTCTTGTGCGCACACCTACCCTGATGATGCAGCCTTC 74
Query 15 ACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTAACA 88
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTAACA 148
Query 89 CA---------------------------------------ATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCAT 123
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAAAAAGAAGAGGCTTATTTGAGACCAATAAATTTTGCCAGATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCAT 222
Query 124 ACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTC 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTC 296
Query 198 AGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAA 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAA 370
Query 272 ATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGC 345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGC 444
Query 346 AACAACTCTGACAAATC--------------------------------------------------------- 362
|||||||||||||||||
Sbjct 445 AACAACTCTGACAAATCAGAGAGCACTGCCTTGAATTGGACATTCCTTATTTCAGCAAACGTATTGCTCACCTA 518
Query 363 ------------------------AGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCT 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGCTTTCTGTACATTGGGCATAAAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCT 592
Query 413 CTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAG 486
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGAAAGTGGCTCATTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAG 666
Query 487 AGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACT 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACT 740
Query 561 ATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTG 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTG 814
Query 635 AAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGT 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGT 888
Query 709 AAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACT 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACT 962
Query 783 CAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTT 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTT 1036
Query 857 ACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTG 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTG 1110
Query 931 GCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCC 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCC 1184
Query 1005 CTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCA 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCA 1258
Query 1079 CTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC 1107
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC 1287