Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09677
• Subject: XM_011510720.2
• Aligned Length: 1227
• Identities: 1105
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGATGCATCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTT  74
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGCAGCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTT  74

Query   75  TCCAAATTTTAACACA---------------------------------------ATGGATCCTGTGCAAAAAG  109
            ||||||||||||||||                                       |||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCAAATTTTAACACAAAAAGAAGAGGCTTATTTGAGACCAATAAATTTTGCCAGATGGATCCTGTGCAAAAAG  148

Query  110  CGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAG  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAG  222

Query  184  CTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACT  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACT  296

Query  258  AGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCA  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCA  370

Query  332  CTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATC-------------------------------------------  362
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct  371  CTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAGAGCACTGCCTTGAATTGGACATTCCTTATTTCAGCAAAC  444

Query  363  --------------------------------------AGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAG  398
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTATTGCTCACCTATGGCTTTCTGTACATTGGGCATAAAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAG  518

Query  399  TCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCA  472
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCA  592

Query  473  CTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTA  546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTA  666

Query  547  CTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACA  620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACA  740

Query  621  CAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGA  694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGA  814

Query  695  TGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAAT  768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAAT  888

Query  769  TCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCC  842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCC  962

Query  843  AAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATA  916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATA  1036

Query  917  TGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCA  990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCA  1110

Query  991  CTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGG  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGG  1184

Query 1065  GCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1107
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1227