Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09677
- Subject:
- XM_017318085.1
- Aligned Length:
- 1170
- Identities:
- 989
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------------ATGATGCATCC 11
||||||||.||
Sbjct 1 ATGCTCCTGGGCAGCGCATGCCACACCACTACCCTTCCTGCCCTCGTGCGCACACCCACCCTGATGATGCAGCC 74
Query 12 TTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTA 85
|||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 75 TTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTGCCGTGGGGCTCTTTCCAAACTTTA 148
Query 86 ACACAATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAA 159
||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 ACACAATGGACCCTGTGCAGAAAGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCCCCGAAGAAGAAACAA 222
Query 160 GTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAA 233
||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTTATTTCCTGTAACGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAA 296
Query 234 ACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAA 307
|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACATGCCAAGAAGGTCAAAGCTCTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAA 370
Query 308 AGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTA 381
||||||||||||||||||||||||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||||.||
Sbjct 371 AGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAAGACAAAGGGAAGATA 444
Query 382 AAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCT 455
|||||||.|||||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAGCCACCAGTTCCAGTCAGCCCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCT 518
Query 456 GCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAG 529
|||||.||||||...|.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||.|||.||||||||||
Sbjct 519 GCCACTTGGAGCCATCGCTTCTCCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTGCTGAGTCAGAAGAAG 592
Query 530 AAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACAC 603
|||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 593 AAAAAGCCAAAAAATTACTCTACTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTGGAGGCTCAC 666
Query 604 AACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACC 677
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 667 AACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAAGTCCTATCCAAGACC 740
Query 678 TGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCT 751
|||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||||.||||
Sbjct 741 TGGGTCAAGATTAAAGGTGCAGAACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGTTTCATTGTGAGATCT 814
Query 752 GTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCA 825
||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 815 GTGATGTTCACGTGAACTCAGAGATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCATAAAGACCGCGTGGCA 888
Query 826 GGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACT 899
||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||..||||.|||||.||
Sbjct 889 GGAAAACCGCTGAAGCCGAAATACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCATCTTAGCTGCAAAGCT 962
Query 900 TGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCG 973
||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.|| .|||||.|||||||
Sbjct 963 TGCATTCCAGAAAGATCTGATGAAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT---GGCGGCCGCAGCCG 1033
Query 974 TGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTT 1047
|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.
Sbjct 1034 TGTCCTCTGCGCTGTCACTGCCACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCCATCCCTCCTGCGCTG 1107
Query 1048 CTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC 1107
|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1108 CTGAGGCCTGGCCACGGGCCCATCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTAC 1167