Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09678
• Subject: XM_011510724.2
• Aligned Length: 783
• Identities: 652
• Gaps: 129

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGTATTTCTGGTTTATCAAACCGCTAACACCCAGTCTAAGGGCAGGTCTGAGCAGAGGGCGGGGTGCAGGCGG  74

Query   1  -ATGGCCCTCGTGCCCTATGAGGAGACCACGGAATTTGGGTTGCAGAAATTCCACAAGCCTCTTGCAACTTTTT  73
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AATGGCCCTCGTGCCCTATGAGGAGACCACGGAATTTGGGTTGCAGAAATTCCACAAGCCTCTTGCAACTTTTT  148

Query  74  CCTTTGCAAACCACACGATCCAGATCCGGCAGGACTGGAGACACCTGGGAGTCGCAGCGGTGGTTTGGGATGCG  147
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CCTTTGCAAACCACACGATCCAGATCCGGCAGGACTGGAGACACCTGGGAGTCGCAGCGGTGGTTTGGGATGCG  222

Query 148  GCCATCGTTCTTTCCACATACCTGGAGATGGGAGCTGTGGAGCTCAGGGGCCGCTCTGCCGTGGAGCTGGGTGC  221
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCCATCGTTCTTTCCACATACCTGGAGATGGGAGCTGTGGAGCTCAGGGGCCGCTCTGCCGTGGAGCTGGGTGC  296

Query 222  TGGCACGGGGCTGGTGGGCATAGTGGCTGCCCTGCTG-------------------------------------  258
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct 297  TGGCACGGGGCTGGTGGGCATAGTGGCTGCCCTGCTGGCACTTAAGTCATCGATGAAGCCCTTGCTGGTACACT  370

Query 259  -----------------GGTGCTCATGTGACTATCACGGATCGAAAAGTAGCATTAGAATTTCTTAAATCAAAC  315
                            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GCCTTTTATTCTTTTCAGGTGCTCATGTGACTATCACGGATCGAAAAGTAGCATTAGAATTTCTTAAATCAAAC  444

Query 316  GTTCAAGCCAACTTACCTCCTCATATCCAAACTAAAACTGTTGTTAAGGAGCTGACTTGGGGACAAAATTTGGG  389
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GTTCAAGCCAACTTACCTCCTCATATCCAAACTAAAACTGTTGTTAAGGAGCTGACTTGGGGACAAAATTTGGG  518

Query 390  GAGTTTTTCTCCTGGAGAATTTGACCTGATACTTGGTGCTGATATCATATATTTAGAAGAAACATTCACAGATC  463
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GAGTTTTTCTCCTGGAGAATTTGACCTGATACTTGGTGCTGATATCATATATTTAGAAGAAACATTCACAGATC  592

Query 464  TTCTTCAAACACTGGAACATCTCTGTAGCAATCACTCTGTGATTCTTTTAGCATGCCGAATTCGCTATGAACGG  537
           |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TTCTTCAGACACTGGAACATCTCTGTAGCAATCACTCTGTGATTCTTTTAGCATGCCGAATTCGCTATGAACGG  666

Query 538  GATAACAACTTCTTAGCAATGCTGGAGAGGCAATTTATTGTGAGAAAGGTTCACTACGATCCTGAAAAAGATGT  611
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GATAACAACTTCTTAGCAATGCTGGAGAGGCAATTTACTGTGAGAAAGGTTCACTACGATCCTGAAAAAGATGT  740

Query 612  ACATATTTACGAAGCACAGAAGAGAAACCAGAAGGAGGACTTA  654
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  ACATATTTACGAAGCACAGAAGAGAAACCAGAAGGAGGACTTA  783